Как определить орви или грипп: Чем грипп отличается от ОРВИ и ОРЗ

Ежегодно в осенне-зимний период наблюдается всплеск сезонных заболеваний. Многие не относятся к ним серьезно и вместо обращения в поликлинику сами прописывают лечение, считая, что у них простуда. Однако в медицине такого заболевания нет, врач может поставить диагноз «ОРЗ», «ОРВИ» или «грипп». У них разные симптомы и методы лечения, которые должны назначать исключительно специалисты.

AIFRU.ru рассказывает о том, чем грипп отличается от ОРВИ и АРЗ.

Orz

· Симптомы

При вирусном и бактериальном возрасте наблюдаются различные симптомы заболевания.

Вирусный АРЗ имеет изменчивые симптомы. Первые признаки болезни — общий недуг, слабость мышц и суставов, головная боль. Они усиливаются через 1-2 дня, у больного поднимается температура, появляется сильный насморк, чихание. Вирусное заболевание может осложняться бактериальной инфекцией.

В случае бактериального АРЗ заболевание часто начинается при температуре около 38 ° С. Воспаление слизистой оболочки носа и глаз обычно отсутствует. Симптомы не меняются на протяжении болезни, при этом, несмотря на лечение, они могут сохраняться до двух недель. Бактериальный ОРС часто осложняется отитом, синомитом, бронхитом, пневмонией. В анализе крови у пациента обнаруживается большое количество нейтрофилов: смещение лейкоцитарной формулы влево.

· Инкубационный период

Все вирусные ОРС отличаются очень коротким инкубационным периодом: от 1 до 5 дней. При бактериальной инфекции дыхательных путей инкубационный период более длительный: от 2 до 14 дней.

· Лечение

Лечение ОРЗ зависит от вида возбудителя этого заболевания. При вирусном АРЗ назначают противовирусную и иммуностимулирующую терапию. При бактериальном возрасте применяют антибактериальную терапию, антибиотики обязательно.

· Профилактика

Общая профилактика респираторных заболеваний заключается в следующих рекомендациях:

• предотвратить подпорку тела;
• не оставляют будущих хронических заболеваний;
• новости здорового образа жизни;
• , чтобы избежать стрессовых ситуаций; ,
• едят богатые витаминами и микроэлементами;
• принимать витамины весной и осенью;
• с эпидемией АРЗ носить защитную маску и избегать мест большого скопления людей;
• часто мыть руки, после пребывания на улице — нос и горло.

ОРВИ

Острая респираторная вирусная инфекция (ОРВИ) — группа острых воспалительных заболеваний органов дыхания, возбудителями которых являются вирусы. Таким образом, ОРВИ — вирусная природа АРЗ. Учеными установлено более 200 респираторных вирусов, самые распространенные из них — парагрипп, аденовирусы, риновирусы.

Инфекция передается в основном воздушно-капельным путем. При контакте с больным, а также посредством поцелуев, рукопожатия или прикосновения к инфицированным поверхностям с последующим заносом во рту.

· Симптомы

О начальном периоде Заболевания Вирус размножается в носу, носоглотке, гортани, что проявляется в виде пореза, насморка, взаимного кашля. Заболевание развивается постепенно: сначала начинается двоеточие в горле, затем появляется насморк и чихание, через пару дней появляется кашель. Повышения температуры может не быть, либо она повышается незначительно: до 37,5-38 градусов. Иногда в этот процесс вовлекаются слизистые глаза и желудочно-кишечный тракт.

При попадании вируса в кровь возникают симптомы общей интоксикации: озноб, головная боль, боль в спине и конечностях. Затем возникает иммунный ответ организма: выработка антител к вирусу, в результате чего кровь постепенно очищается от него, и симптомы интоксикации ослабевают.

На завершающей стадии ОРВИ (без осложнений) дыхательные пути очищаются от пораженных вирусом эпителиальных слоев, что проявляется насморком и влажным кашлем с растрепыванием слизистой оболочки или гнойной мокротой.

В процессе развития вирусное заболевание может осложняться бактериальной инфекцией. После простуды или перенесенной на ноги простуды может возникнуть отит (воспаление уха) или гайморит (воспаление видимых пазух носа).

· Инкубационный период

Инкубационный период ОРВИ может составлять от 1 до 5 дней, редко — до 14 дней.

· Лечение

Если симптомы ТПЗ сильно выражены, применяются противовирусные препараты.Симптоматическое лечение Включает обезболивающие и жаропонижающие препараты, сосудосуживающие капли и спреи, облегчающие насморк, лекарства и лучи от кашля. При заболевании также рекомендуется полоскать горло, полоскать нос слабым соляным раствором, делать ингаляции. Больному следует обильно пить и соблюдать домашний режим.

· Профилактика

Вакцинация против ОРВИ отсутствует. Разработать такую ​​вакцину невозможно из-за большого количества респираторных вирусов, которые постоянно модифицируются.

Грипп

Грипп (от нем. Grippen — «схватить», «резко сжать») — острое инфекционное заболевание дыхательных путей, вызываемое вирусом гриппа. Входит в группу ОРВИ. Периодически распространяется в виде эпидемий и пандемий. В настоящее время выявлено более 2000 вариантов вируса гриппа.

· Симптомы

Вирус гриппа проникает в организм человека через верхние дыхательные пути — нос, трахею, бронхи — там, где он размножается.

В отличие от большинства других ОРВИ, при заболевании гриппом ухудшение самочувствия наступает внезапно, а температура достигает 39-40 ° С и держится до 4 суток. После попадания вируса в кровь у человека наступает озноб, мышечная слабость, головная боль. Также при гриппе бывает свет и покраснение в глазах. Все это свидетельствует о высокой интоксикации, характерной для вирусов гриппа. Резина и заложенность носа могут появиться не сразу или вообще. Выделений из носа, как правило, нет, наоборот, есть ярко выраженное ощущение сухости в носу и глоток.Обычно сухой кашель, вызывающий напряжение, сопровождающийся болью в грудины.

При плавном течении болезни симптомы гриппа сохраняются 3-5 дней, но повышенная утомляемость организма может присутствовать в течение нескольких недель после выздоровления. При тяжелых формах гриппа могут развиваться серьезные осложнения, особенно у детей, пожилых и ослабленных пациентов.

· Инкубационный период

Инкубационный период гриппа очень короткий: от нескольких часов до 3 дней, обычно 1-2 дня.Однако именно в этот период человек наиболее заразен.

· Лечение

При гриппе применяют противовирусные, обезболивающие, жаропонижающие, отхаркивающие, противокашлевые препараты, а также витамины, особенно витамин С, в повышенных дозах. Больным рекомендуется покой, большое количество жидкости, отказ от курения и спиртных напитков. Грипп без осложнений антибиотиками не лечат, так как эти средства используются только при бактериальных инфекциях (на которые грипп не распространяется).

· Профилактика

В отличие от других ОРВИ от гриппа существует специфическая профилактика: вакцинация.

В качестве неспецифической профилактики в помещении, где заболел грипп, проводится влажная уборка с использованием дезинфицирующего средства. Для обеззараживания воздуха используются ультрафиолетовые и аэрозольные дезинфекторы.

COVID-19, грипп, простуда или аллергия? Как отличить

Эпидемия коронавируса изменила практически все в нашей жизни, и предстоящий сезон гриппа не станет исключением.Поскольку COVID-19 все еще распространяется на большей части страны, ношение маски и социальное дистанцирование важны как никогда.

Фактически, эти меры могут также снизить распространение гриппа и простуды в течение следующих нескольких месяцев, сказал СЕГОДНЯ доктор Уолт Оренштейн, профессор инфекционных заболеваний Медицинской школы Университета Эмори в Атланте. Помимо соблюдения рекомендаций по коронавирусу этой зимой, также важно понимать тонкие различия между симптомами, связанными с простудой, гриппом и COVID-19.Вот руководство.

Как грипп связан с COVID-19?

Грипп и COVID-19 являются заразными респираторными заболеваниями, но, по данным Центров по контролю и профилактике заболеваний, они происходят от разных вирусов. Вирус, вызывающий COVID-19, называется SARS-CoV-2, а грипп вызывается вирусами гриппа.

Коронавирус и вирусы гриппа вызывают схожие симптомы, поэтому их может быть трудно отличить друг от друга, сказал СЕГОДНЯ доктор Эрик Чио-Пена, врач скорой медицинской помощи в Northwell Health в Нью-Йорке.

Размышляя о том, как вы подверглись воздействию, вы можете определить, есть ли у вас COVID-19 или грипп. Например, если бы у вас был «межличностный контакт с повышенным риском (с кем-то, кто может быть инфицирован COVID-19), я бы больше подозревал COVID», — сказал Чио-Пена.

Сходства и различия между симптомами гриппа и COVID-19

По данным CDC, эти симптомы часто возникают как при гриппе, так и при COVID-19:

• Лихорадка (более 100), озноб или ощущение лихорадки
• Кашель
• Одышка дыхания или затрудненного дыхания
• Усталость
• Боль в горле
• Насморк или заложенный нос
• Мышечная боль или ломота в теле
• Головная боль
• Желудочно-кишечные симптомы

Единственный симптом, который встречается почти исключительно при COVID-19, — это потеря ( или изменения) на свой вкус и запах.«Как правило, этого не наблюдается при гриппе, и если это произойдет, это действительно означает, что у вас COVID», — пояснил Оренштейн.

Тем не менее, не все, кто заражается коронавирусом, теряют вкус или запах, так что это различие не является надежным. Если у вас есть какие-либо из вышеперечисленных симптомов и , ваш вкус и запах остаются неизменными, это все еще может быть COVID-19.

Точно так же чихание чаще всего встречается при простуде, реже — при гриппе и меньше всего связано с COVID-19. Но наличие чихания не исключает COVID-19, сказал Чио-Пена, добавив, что «ничто в этом вирусе не является абсолютным.»

Недавнее исследование предполагает, что вы, возможно, захотите отслеживать прогрессирование своих симптомов, чтобы отличить грипп от COVID-19. Было обнаружено, что лихорадка, скорее всего, была первым симптомом, который испытывали люди с COVID-19; в то время как кашель был наиболее сильным. вероятно, будет первым симптомом гриппа. И хотя это может быть редким, можно заразиться COVID-19 и гриппом одновременно.

Сколько времени нужно, чтобы проявить симптомы гриппа по сравнению с COVID-19?

По данным CDC, как при COVID-19, так и при гриппе симптомы могут развиваться через 1-2 дня после заражения.Тем не менее, у людей с COVID-19 обычно требуется больше времени, чтобы развить симптомы.

Симптомы коронавируса у человека обычно появляются через пять дней после заражения, но это может занять от двух дней до двух недель. Симптомы гриппа обычно появляются через один-четыре дня после заражения.

В чем разница между аллергией, простудой и COVID-19?

Простуда, как правило, легче отличить от гриппа и COVID-19, чем их друг от друга.Уильям Шаффнер, медицинский директор Национального фонда инфекционных заболеваний в Бетесде, штат Мэриленд, сказал СЕГОДНЯ.

Симптомы, которые чаще встречаются при простуде и реже при гриппе или COVID-19, по Шаффнеру, включают:

• Симптомы, которые остаются выше шеи (например, не кашель в груди)
• Нет лихорадки или очень низкая температура (ниже 100)
• Чихание
• Нет ничего более серьезного, чем заложенный нос или боль в горле

Тем не менее, если у вас есть только эти легкие симптомы, то это все равно может быть COVID-19 или грипп, сказал Шаффнер, добавив: «Все из они могут перекрываться и маскироваться.«

С другой стороны, если у вас серьезные симптомы, по словам Чиоэ-Пены, менее вероятно, что это будет простуда. Если« у кого-то (температура 104) он обезвожен и выглядит так, будто ему нужно внутривенное введение жидкости, «Обычно это грипп или COVID», — сказал он.

Другой способ оценить, грипп это или COVID-19 по сравнению с простудой? Подумайте об уровне гриппа и коронавируса в вашем сообществе и о ваших привычках, сказал Шаффнер.

» Вы носите маску, укрываетесь, отдаляетесь на шесть футов и избегаете больших групп? Или вы человек, который гуляет? »- сказал он.«Если вы осторожный человек, у вас меньше шансов заболеть COVID или гриппом».

Хотите знать, аллергия это или COVID-19? «Это не тот год, чтобы предполагать, что у вас впервые возникает осенняя или зимняя аллергия, и вести себя так, как будто вы не заразны», — посоветовал Чиое-Пена. Но если это происходит ежегодно, то не нужно «сходить с ума», думая, что у вас может быть COVID-19 или грипп, сказал он. Следует отметить, что зуд обычно является «отличительным признаком» аллергии.

Просто убедитесь, что ваши симптомы не отличаются от прошлых лет и являются легкими (например, зуд из носа с чистыми выделениями) и что вы чувствуете себя лучше после приема обычного средства от аллергии, такого как Кларитин.

Как защитить себя во время сезона гриппа?

Оренштейн, Шаффнер и Чиоэ-Пена предложили следующие стратегии:

• Сделайте прививку от гриппа до конца октября. Скажите всем, кого вы знаете, сделать то же самое. (Это не защитит от коронавируса, но это важная мера общественного здравоохранения.)
• Примите меры для предотвращения распространения коронавируса, особенно социальное дистанцирование, регулярное мытье рук, ношение маски и общение с людьми вне вашего дома только на открытом воздухе. .
• Оставайтесь дома, если у вас есть признаки болезни. Если вы сомневаетесь в том, можно ли безопасно покинуть дом, обратитесь к своему врачу.
• Если вы молоды, здоровы и у вас только легкая форма болезни, позвоните своему врачу перед посещением офиса или больницы.

Наконец, если вы знаете, что подверглись воздействию COVID-19, как можно скорее обратитесь к своему врачу.

Маура Хохман

Маура Хохман, редактор выходных дней в Бруклине и репортер TODAY Digital, присоединилась к команде в начале пандемии коронавируса.Хотя она с удовольствием пишет на самые разные темы, от поп-культуры до политики, у нее есть особый интерес к всестороннему охвату услугами здравоохранения, особенно к исследованиям COVID-19, женскому здоровью и расовым различиям в здоровье.

Специальная разведка для обнаружения необычной эпидемической активности после взрыва в Вектор, Россия

Введение

16 сентября 2019 г. произошел взрыв в здании Государственного научного центра вирусологии и биотехнологии (Вектор) уровня биобезопасности 4 (BSL-4) в селе Кольцово Новосибирского района Сибири (1).Причиной взрыва якобы стал газовый баллон, за которым последовал пожар. Огонь распространился по вентиляционной системе и затронул территорию площадью 30 квадратных метров. В результате взрыва на пятом этаже шестиэтажного дома были разбиты все стекла. В официальном заявлении правительства России указано, что никаких патогенов или риска не было, но Вектор содержит самую большую из известных коллекций патогенов, чувствительных к безопасности. Взрыв газа может распространить ударную волну со скоростью 1500-2000 метров в секунду.Пламя распространяется с гораздо меньшей скоростью (обычно 20-25 м / сек и до нескольких 100 м / сек) (1). Несгоревший газ распространяется впереди пламени, поэтому, если присутствовали какие-либо патогены, они могли быть распылены далеко за пределы здания с дозвуковой скоростью, перед огнем и до того, как пожар стал широко распространенным (1).

Если произошло распространение патогенных микроорганизмов, болезнь может возникнуть в окрестностях Вектора и распространиться в близлежащие регионы путем прямой передачи от человека к человеку, а затем — при путешествии.Эпидемические инфекции могут приводить к росту эпидемии каждый инкубационный период. Страны с сухопутными границами, близкими к Сибири, могут оказаться в опасности. К ним относятся Монголия, Казахстан и Китай. Хотя Украина находится дальше от места взрыва, это также будет представлять интерес, учитывая нынешний конфликт между Россией и Украиной. Другие затронутые конфликтом районы в пределах 2000 км включают Джамму и Кашмир в Индии. Если в Vector проводились засекреченные исследования, особенно в отношении искусственно созданных, гибридных или синтетических патогенов, официальная отчетность о последующих эпидемиях может отсутствовать умышленно.Также могут быть необычные клинические синдромы, вызванные новыми патогенами. Взрыв также мог быть преднамеренным, чтобы обеспечить кражу патогенов (1) — в этом случае серьезные или искусственно созданные патогены могут быть выпущены в любую точку мира. Чтобы распознать потенциальную биологическую войну, возникающую в результате кражи патогенов, необходимо сочетание глобального эпиднадзора за болезнями, повышенной осведомленности и политического интеллекта.

Возможные сроки возникновения эпидемических событий в результате взрыва будут зависеть от инкубационного периода патогенов, рассеянных взрывом.Он может варьироваться от нескольких дней (грипп) до нескольких недель (оспа, лихорадка Эбола). Верхний предел инкубационного периода Эболы составляет 42 дня, и новые или сконструированные патогены будут иметь неизвестный инкубационный период. Остальной мир зависит от своевременной информации об эпидемии для смягчения глобальных последствий выброса патогенов. Традиционный эпиднадзор за общественным здоровьем, если таковой имеется, часто бывает несвоевременным из-за задержек в отчетности и необходимости проверки органами здравоохранения (1). Отсутствие наблюдения может быть связано с ограниченными ресурсами для наблюдения (например, в странах с низким уровнем дохода) или цензурой информации.В этом случае огромные объемы данных из открытых источников могут быть использованы для оперативной разведки эпидемий, поскольку средства массовой информации могут сообщать о вспышках до официального уведомления, а люди обсуждают эпидемии и болезни в социальных сетях (2). EpiWATCH, автоматизированная эпидемическая обсерватория, была разработана в период с 2016 по 2019 год с использованием данных из открытых источников, таких как социальные сети и новостные ленты. Это более своевременно, чем клиническое синдромное наблюдение (3).

Цель

Для использования данных из открытых источников из обсерватории EpiWATCH для отслеживания ранних сигналов болезни в России и соседних странах после взрыва на Vector в сентябре 2019 года.

Методы

Эпидемическая обсерватория с открытым исходным кодом, EpiWATCH, была разработана в Университете Нового Южного Уэльса (UNSW) в качестве веб-приложения для управления, дополненного машинным обучением, и собирает данные с 2016 года. Полный прототип состоит из трех программных пакетов, которые все работают на единый сервер. Все программные зависимости — это хорошо зарекомендовавшие себя проекты с открытым исходным кодом. В программном обеспечении есть программа сбора данных, запуск которой запланирован на регулярной основе. База данных курируется, очищается и дополняется еженедельным экспертным обзором по мере сбора новых данных.

После известия о взрыве на Векторе 16 сентября 2019 года команда EpiWATCH добавила русский язык и ключевые слова Россия, Сибирь, Новосибирск и Кольцово в Стандартные рабочие процедуры в дополнение к обычным ключевым словам, связанным с эпидемией, используемым в EpiWATCH. . Мы также провели поиск сообщений о вспышках в странах, граничащих с Сибирью, включая Монголию, Казахстан и Китай. Учитывая, что в этих странах может проявиться локальное распространение эпидемии, мы включили поиск на китайском, монгольском и казахском языках.Мы добавили «Украина» в качестве ключевого слова из-за текущего конфликта между Россией и Украиной и с учетом того, что нарушение безопасности взрыва может привести к краже и преднамеренному освобождению. Сбор данных начался в сентябре 2019 года, через неделю после взрыва, и это считалось исходным. Предыдущие данные EpiWATCH за 2016-19 гг. Не включали поиск на русском языке, поэтому не являлись действительной базой.

Результаты

На Рисунке 1 показано количество ранних сообщений в этом районе. Обратите внимание, что на Рисунке 1 отражены отчеты, а не номера дел.На Рисунке 2 представлена ​​карта расположения этих отчетов с номерами дел.

Отчеты EpiWATCH о вспышках в России с 17 сентября по 31 декабря 2019 г. (N = 244)

С момента взрыва в лаборатории «Вектор» было зарегистрировано 244 сообщения о вспышках в России до 31 декабря 2019 г. Множественные вспышки произошли примерно 22 октября, 6 ноября и 13 декабря 2019 г. Вспышки, включая острую респираторную вирусную инфекцию (ОРВИ), пневмонию и т. Д. В октябре и ноябре в разных районах страны были зарегистрированы «ОРВИ» и грипп.22 октября в Самарской области было зарегистрировано 7 859 случаев «атипичной пневмонии» и гриппа, но при этом упоминались конкретные возбудители, в том числе грипп, парагрипп и аденовирус, которые выявляются в лаборатории. Еще одна вспышка с упоминанием «Острая респираторная вирусная инфекция (ОРВИ)» произошла с 28 октября по 4 ноября и привела к 12 765 случаям ОРВИ в Иркутской области. Вспышка пневмонии в Надыме имела очень высокий зарегистрированный уровень летальности, но произошла на фоне прошлых вспышек пневмонии, имевших место в этом районе до взрыва «Вектора».Сезонный рост заболеваемости внебольничной пневмонией в ноябре отмечен в Приморском крае, где доля больных детей составила 47,2% (4). Обеспокоенность вызывают две крупные вспышки острого респираторного заболевания в Воронеже (7 198 случаев, 8 октября) (5) и во Владимире (9 953 случая, 23 октября) (6). В Воронеже не было зарегистрировано вирусологического диагноза, но во Владимире были выявлены смешанные вирусные диагнозы: аденовирус и бокавирус. В обеих вспышках непропорционально сильно пострадали дети, а во Владимире показатели заболеваемости превышали средний региональный уровень заболеваемости в Кольчугинском и Собинском районах.Кроме того, сезон гриппа и «атипичной пневмонии» в России наступил на две недели раньше запланированного срока (7), и тысячи людей были инфицированы «атипичной пневмонией» и гриппом в Самаре (8 000 случаев, 22 октября) (8) и Иркутске (13 000 случаев). , 5 ноября) (9). Ближайшее сообщение с Кольцово было в Тюмени, в 1300 км, о 3 случаях предполагаемой болезни Хаффа, редкого синдрома рабдомиолиза, связанного с потреблением рыбы (10). Дальнейшие поиски выявили синдром, включающий паралич, онемение конечностей и почечную недостаточность. В одном отчете упоминается 11 случаев диализа по поводу почечной недостаточности.Эта вспышка вызывает беспокойство, потому что болезнь Хаффа не подтверждена, и вспышка сопровождалась болезнью и смертью большого числа собак и кошек.

В октябре в Санкт-Петербурге произошло пищевое отравление, связанное с едой, приготовленной в общепите, в результате чего у 19 сотрудников появились желудочно-кишечные симптомы (11). В ноябре на Алтае 4 ребенка отравились после того, как выпили содержимое бутылки, предположительно содержащей антифриз (12). 13 декабря двое подростков были отравлены неизвестным веществом и скончались в Москве (13).Новокули, в которых произошла вспышка сибирской язвы, являются районом эндемической сибирской язвы. Другие болезни, такие как сальмонелла, дифтерия, менингит, листерия и стафилококк, были зарегистрированы во многих регионах России. Кроме того, мы обнаружили твит о биологической войне в России, который, судя по всему, принадлежал группе сторонников теории заговора.

Местоположение отчетов о вспышках в России, 25 сентября — 31 декабря 2019 г.

Примечание: аннотированная карта. Районы с наибольшим количеством отчетов с описанием вспышек.

По состоянию на 31 декабря 2019 г. сигналов о необычных или неожиданных вспышках в соседних странах не поступало. Сообщений из Монголии не поступало.

На рис. 3 показаны отчеты о вспышках из Китая (N = 50) за период эпиднадзора. Из всех 50 сообщений 36 (72%) сообщений касались вспышек заболеваний в материковом Китае. После взрыва лаборатории «Вектор» произошла вспышка чумы во Внутренней Монголии, которая была ближайшим районом к России. В материковом Китае чума была эндемическим заболеванием во Внутренней Монголии, распространяясь грызунами или из-за того, что там охотники ели зараженное мясо.Недавняя вспышка чумы произошла в период с октября по ноябрь. 26 октября был зарегистрирован один подтвержденный случай бубонной чумы в автономном районе Внутренняя Монголия, где человек посетил регион, где очаги чумы были выявлены до болезни (14). 12 ноября пара из Внутренней Монголии была зарегистрирована в Пекине, вызванной употреблением в пищу сырого мяса сурка и почек (15). Третий случай произошел в Лиге Ксилингол (Внутренняя Монголия), у охотника, который заразился после поедания дикого кролика (16).Четвертый случай произошел с сельским пастухом во Внутренней Монголии (17). Люди, которые связались с этими подтвержденными случаями, были помещены в карантин.

Мы идентифицировали первые сигналы о вспышке бруцеллеза, когда 7 декабря было зарегистрировано 96 случаев (18). 26 декабря китайское правительство провинции Ганьсу впервые сообщило, что в общей сложности 181 студент и сотрудник Института ветеринарных исследований Ланьчжоу были инфицированы бруцеллой, один из которых имел клинические симптомы, а остальные протекали бессимптомно и без болезней (19). .В расследовании этой вспышки указывается, что первоначально она была вызвана газом, содержащим бактерии, выпущенным биофармацевтической фабрикой Ланьчжоу с 24 июля по 20 августа 2019 г. По имеющимся данным, при производстве вакцины против бруцеллы на фабрике использовались дезинфицирующие средства с истекшим сроком годности, поэтому отходящие газы и выбросы не были полностью стерилизованы. Сотрудники Института ветеринарных исследований Ланьчжоу, который находится более чем в 400 метрах от завода по ветру, вдохнули и заразились аэрозолями, содержащими бактерии.10 декабря вспышка распространилась на Харбин, город в провинции Хэйлунцзян, в результате чего 13 человек оказались положительными по антителам к Brucella, а инфицированные лица имели кратковременный контакт с животными во время исследовательской работы в лаборатории Института ветеринарных исследований Ланьчжоу в августе ( 20).

Кроме того, до того, как 31 декабря 2019 года власти впервые официально объявили о вспышке COVID-19, мы определили ранние сигналы, такие как неизвестная пневмония и легочная инфекция. Уже 22 ноября больной тяжелой пневмонией из Сянъян был переведен в Ухань для лечения (21).26 декабря мы также обнаружили сообщение об одном подозрении на новый коронавирус (22). Однако доступ к этой веб-странице был прекращен, и содержание этого новостного сообщения было отредактировано.

Было несколько сообщений о других заболеваниях и вспышках известной этиологии.

Отчеты EpiWATCH о вспышках в Китае с 25 сентября по 31 декабря 2019 г. (N = 50)

На Рисунке 4 показаны отчеты о вспышках в Украине за период эпиднадзора. Значительное увеличение числа сообщений в октябре было связано со вспышками ботулизма, дифтерии, гепатита А, полиомиелита и лептоспироза, а с октября по декабрь были зарегистрированы множественные кластеры кори.За годы до взрыва «Вектора» Украина страдала от крупной эпидемии кори. Также была эпидемия дифтерии, показатели которой в 2019 году удвоились из-за низкого уровня вакцинации в Украине (23). Другие вспышки включают ботулизм, связанный с рыбными продуктами из пищевой базы Подольска (24), и болезнь гепатита А у школьников Днепра и Чернигова (25). Кроме того, мы обнаружили твит о пневмонии у украинских военнослужащих в Донбассе, хотя возбудитель заболевания до сих пор неизвестен (26).

отчетов EpiWATCH о вспышках в Украине с 25 сентября по 31 декабря 2019 г. (N = 39)

На Рисунке 5 показаны отчеты о вспышках в Казахстане за период эпиднадзора. Респираторные инфекции часто регистрировались с октября по декабрь 2019 года, особенно в ноябре. С начала эпидемического сезона в Казахстане зарегистрировано около 55 000 случаев ОРВИ (27). В 2019 году в Казахстане корью заразились 11000 человек, и большинство случаев были среди непривитых детей (28).27 ноября вспышка кори поразила 648 случаев за один день (29). Сезон гриппа начался в ноябре и был на месяц раньше, чем ожидалось. Первые случаи гриппа в этом сезоне были зарегистрированы в Мангистауской области и Шымкенте, а тип В был циркулирующим (27). По состоянию на 19 ноября 2019 года в Казахстане зарегистрировано 2879 случаев гриппа (27). В 2019 году также произошла вспышка коклюша в Северном Казахстане, где было 72 подозреваемых случая и около 36 подтвержденных случаев (30). Кроме того, по состоянию на 1 ноября 2019 года в Алматинском центре СПИДа зарегистрировано 3307 человек, живущих с ВИЧ, а 30 (31) ноября в Алматы зарегистрировано 56 детей с положительным статусом ВИЧ.Кишечные инфекции, вызванные сальмонеллезом, кишечной палочкой и невыявленными причинами, были зарегистрированы в школах, и в основном страдали дети (32).

отчетов EpiWATCH о вспышках в Казахстане с 25 сентября по 31 декабря 2019 г. (N = 42)

Выводы

Мы демонстрируем метод быстрой эпидемиологической разведки после вызывающего беспокойство инцидента, взрыва в Векторе. Никаких необъяснимых вспышек не было зарегистрировано ни в странах, граничащих с Сибирью, ни на Украине в течение трех месяцев после взрыва.Лучшая практика обеспечения готовности должна включать наблюдение за событиями болезни в месяцы после события, вызывающего обеспокоенность на местном, национальном и глобальном уровнях. В отсутствие официальных данных наблюдения, разведка из открытых источников может быть единственным доступным средством обнаружения вспышек и обеспечения раннего реагирования и смягчения последствий для остального мира. EpiWATCH удалось выявить сообщения о вспышках в России в течение недель и месяцев после взрыва «Вектора», что позволяет отслеживать вызывающие обеспокоенность вспышки без известной причины.Тысячи случаев ОРИ были зарегистрированы в Воронеже и Владимире, оба оказались отрицательными при тестировании на грипп и затронули детей больше, чем взрослых. Причина болезни в Воронеже неизвестна. Во Владимире зарегистрирован смешанный вирусный диагноз: аденовирус и бокавирус. При неизвестных или новых вспышках заболеваний идентификация смешанных вирусов может быть случайной или отражать сопутствующие инфекции. Другая вызывающая беспокойство вспышка, хотя и небольшая, предположительно была вызвана болезнью Хаффа в Тюмени.Это малоизученный, редкий синдром рабдомиолиза, случаи которого, по-видимому, происходят в пределах одной семьи и связаны с потреблением рыбы. Другие сообщения о подобных событиях следует тщательно отслеживать и сверять с глобальным надзором.

Повышенный надзор и осведомленность также необходимы во всем мире, особенно в соседних странах. В соседних странах мы не обнаружили сигналов о неизвестных серьезных вспышках, за исключением двух сообщений о тяжелой пневмонии в Китае, начиная с ноября.Мы также выявили вспышку бруцеллеза в Китае в начале декабря, связанную с другой лабораторной аварией, связанной с нарушением работоспособности предприятия, производящего вакцины против бруцеллы.

Учитывая длительный инкубационный период некоторых инфекций и возможные пропущенные цепочки передачи на ранних стадиях эпидемии, надзор должен продолжаться в течение нескольких месяцев после интересующего события. Данные из открытых источников являются мощным источником оперативной информации для быстрого выявления серьезных эпидемий и предоставляют более быстрые сигналы, чем традиционный эпиднадзор за болезнями.EpiWATCH также может преодолеть ограничения, связанные с плохой официальной отчетностью, нехваткой человеческих ресурсов или преднамеренной цензурой информации (32). В этом случае официальная отчетность маловероятна, а данные из открытых источников являются единственным средством получения информации об эпидемиях. Большой объем таких данных из новостных лент и социальных сетей может своевременно предоставлять информацию о событиях болезни. Следует отметить, что пандемия COVID-19 началась в течение трех месяцев после события. У SARS-COV-2 длительный инкубационный период, составляющий 2 недели, поэтому рост эпидемии от одного случая может занять несколько месяцев, прежде чем эпидемия станет достаточно большой, чтобы ее можно было обнаружить.Мы не нашли никаких доказательств связи пандемии со взрывом, за исключением временной связи и очевидного происхождения пандемии в Китае, стране, граничащей с пострадавшей зоной. В отдельном исследовании мы выявили сигналы COVID-19 в Китае до декабря 2019 года, добавив доказательства того, что возникновение пандемии могло произойти раньше декабря (33). Ранние вспышки неизвестного тяжелого респираторного заболевания в России, по-видимому, непропорционально сильно затронули детей, что несовместимо с COVID-19.До ноября 2019 года в Китае не было сигнала о тяжелой пневмонии.

Таким образом, после взрыва Вектора обсерватория EpiWATCH была адаптирована и настроена для поиска событий, связанных с этим инцидентом. Мы также разработали инструмент для определения вероятности неестественного происхождения эпидемий, адаптированный на основе критериев Грунова-Финке (4). Это можно использовать вместе с данными эпиднадзора для расследования необычных или необъяснимых вспышек в течение нескольких месяцев после любого вызывающего беспокойство события, такого как несчастный случай в лаборатории.Сигналы эпидемии должны сочетаться с политической информацией, такой как возникновение конфликта и войны, чтобы определить риск глобального распространения ранних эпидемий.

Благодарности

EpiWATCH финансируется Австралийским национальным советом по здравоохранению и медицинским исследованиям Австралии (NHMRC), грантом Центров передового опыта (CRE) (APP1107393).

Список литературы

1. Макинтайр С.Р., Дулан С., Де Сильва К. Взрыв в Векторе: надеяться на лучшее и готовиться к худшему.Глобальная биозащита. 2019; 1 (2).

2. Ян С.Дж., Чухтай А.А., Макинтайр ЧР. Полезность и потенциал быстрой эпидемической разведки из интернет-источников. Int J Infect Dis. 2017; 63: 77-87.

3. Макинтайр Р. Риск выборочного инвестирования в последующее планирование пандемии. Глобальная биозащита. 2019; 1 (2).

4. Санников Д. Внебольничная пневмония проникает в Приморье в 2019 г. [цитировано 30 января 2020 г.]. Доступно по ссылке: https://deita.ru/ru/news/vnebolnichnaya-pnevmoniya-zahvatyvaet-primore/.

5. Николаева А. Число ОРВИ в Волгоградской области растет в 2019 г. [цитировано 30 января 2020 г.]. Доступно по ссылке: https://bloknot-volgograd.ru/news/rastet-kolichestvo-zabolevshikh-orvi-v-volgogradsk.

6. Аноним. Эпидемия атипичной пневмонии во Владимире в 2019 г. [цитировано 23 октября 2019 г.]. Доступно по ссылке: https://progorod33.ru/news/50907.

7. Клейменов К. Грипп пришел в Россию с опережением графика в 2019 г. [цитировано 26 августа 2020 г.]. Доступно по адресу: https: // www.1tv.ru/news/2019-10-15/374032-gripp_prishel_v_rossiyu_ranshe_sroka.

8. Государственная телерадиокомпания Самара. В Самарской области 8 тысяч человек заболели ОРВИ и гриппом в 2019 году [цитировано 30 января 2020 года]. Доступно по ссылке: https://tvsamara.ru/news/v-samarskoi-oblasti-8-tysyach-chelovek-zaboleli-orvi-i-grippom/.

9. Аноним. За неделю в Иркутской области ОРВИ заболело около 13 тыс. Человек 2019 года [цитировано 30 января 2020 года]. Доступно по ссылке: https://www.irk.ru/news/20191105/illness/.

10. Аноним. Роспотребнадзор расследует случаи «бредовой болезни» в Тюменской области за 2019 год [цитировано 23 октября 2019 года]. Доступно по ссылке: https://ria.ru/201

11. Аноним. В Санкт-Петербурге произошло массовое отравление. Сотрудники Leroy Merlin и Petrovich заболели, а одна компания доставила обеды в 2019 году [цитируется 23 октября 2019 года]. Доступно по ссылке: https://paperpaper.ru/papernews/2019/10/23/v-peterburge-proizoshlo-massovoe-otra/.

12. Аноним.На Алтае четверо детей отравились голубой жидкостью из найденной в 2019 году бутылки [цитировано 10 февраля 2020 года]. Доступно по ссылке: https://www.rbc.ru/rbcfreenews/5dc17dea9a7947d5ec57e318.

13. Аноним. В пригороде погибли двое подростков, отравленные неизвестным веществом 2019 г. [цитировано 9 февраля 2020 г.]. Доступно по ссылке: https://tass.ru/proisshestviya/7336741.

14. CGTN. Четверо, имевшие тесный контакт с носителем бубонной чумы, освобождены из-под медицинского наблюдения в 2019 г. [цитируется 6 марта 2020 г.]. Доступно по адресу: https: // news.cgtn.com/news/2019-12-04/Four-close-contacts-of-bubonic-plague-case-release-medical-observation-M9lmkjfCXC/index.html.

15. Миллер Р.В. Два человека в Китае заражены чумой, заболеванием, связанным с пандемией 2020 года [цитируется 6 марта 2020 года]. Доступно по адресу: https://www.smh.com.au/world/asia/two-people-in-china-infected-with-plague-the-disease-tied-to-black-death-20191114-p53af3.html .

16. Мин Зи, Широузу Н. Новый случай бубонной чумы подтвержден Китаем 2019 [6 марта].Доступно по адресу: https://www.sciencealert.com/a-fresh-case-of-bubonic-plague-has-now-been-confirmed-in-china.

17. Каделл К. Китай сообщил о четвертом случае чумы в этом месяце 2019 года [цитируется 6 марта 2020 года]. Доступно по адресу: https://www.reuters.com/article/us-china-health-plague/china-reports-fourth-case-of-bubonic-plague-this-month-idUSKBN1Y20BI.

18. Институт ветеринарных исследований У. Ланьчжоу увеличил популяцию с положительной реакцией на бруцеллу до 96 (цитировано 6 марта 2020 г.). Доступно по адресу: http: // www.xinhuanet.com/local/2019-12/07/c_1125319607.htm.

19. Голос Америки. Биофармацевтический завод в Ланьчжоу выбрасывает содержащие бактерии выхлопные газы, в результате чего 181 человек заразился Brucella 2019 [цитируется 6 марта 2020 года]. Доступно по адресу: https://www.voachinese.com/a/chinese-gansu-academics-catch-burcella-vaccine-factory-pollution-20191227/5222312.html.

20. Мировой журнал. Вспышка бруцеллеза распространилась на 13 студентов в Харбине в 2019 г. [цитируется 6 марта 2020 г.]. Доступно по адресу: https: // www.worldjournal.com/6671723/article-%E5%B8%83%E9%AD%AF%E6%B0%8F%E8%8F%8C%E7%97%85%E7%96%AB%E6%83%85 % E6% 93% B4% E5% A4% A7-% E5% 93% 88% E7% 88% BE% E6% BF% B113% E5% AD% B8% E7% 94% 9F% E6% 9F% 93% E7% 97% 85 /.

21. У В. Сянъян пациенты с тяжелой пневмонией «сидят» на вертолете для оказания неотложной помощи в Ухане, 2019 [процитировано 11 февраля 2020 года]. Доступно по адресу: https://www.sohu.com/a/355347300_120424456.

22. Аноним. Один образец подозревается как новый коронавирус 2019 года [цитировано 17 февраля 2020 года]. Доступно по адресу: https: // www.baidu.com/link?url=Z-RQ8bcTlJBs3cDD02eX2D_9GYm369JFAMafsDGDXhvycbHIm55nKfHSqVvrOAkJ7a7BL9nWIoSa2icS73uVm6w1RWojdfcbmvm6w1RWojd3d050001000d5cd3d5cd3000d2000d8d3d5cd5000d8d05d05d05d05d06

23. 24 канал. Самые больные украинцы в 2019 году 2019 год [цитируется 2 апреля 2020 года]. Доступно по ссылке: https://health.24tv.ua/ru/bolezni_2019_goda_chem_bolshe_vsego_boleli_v_ukraine_itogi_goda_n1254651.

24. 112.UA. В Киевской области случаи ботулизма были зафиксированы в 2019 г. [цит. По 2 апреля 2020 г.]. Доступно по адресу: https: // 112.ua / общество / в-киевской-области-зафиксировали-случаи-заболевания-ботулизмом-518558.html.

25. 112.UA. В Чернигове восстановят школу, где в 2019 г. была зафиксирована вспышка гепатита А [цит. По 2 апреля 2020 г.]. Доступно по ссылке: https://112.ua/obshchestvo/v-chernigove-vosstanovyat-obucheniya-v-shkole-gde-zafiksirovali-vspyshku-gepatita-a-513382.html.

26. Петров С. Неизвестная инфекция поразила Вооруженные силы Украины на Донбассе в 2019 г. [цитировано 2 апреля 2020 г.]. Доступно по ссылке: https: // riafan.ru / 1215200-неизвестная-инфекция-поразила-всу-в-донбассе.

27. Новости Шымкента. Первые случаи гриппа были выявлены в начале ноября в Мангистауской области и в Шымкенте в 2019 г. [цитировано 2 апреля 2020 г.]. Доступно по адресу: https://otyrar.kz/2019/11/pervye-sluchai-grippa-vyyavleny-v-nachale-noyabrya-v-mangistauskoj-oblasti-i-v-gorode-shymkent/.

28. Новости Шымкента. В Шымкенте в 2019 г. зарегистрировано более тысячи случаев кори [цитировано 3 апреля 2020 г.]. Доступно по ссылке: https: // otyrar.kz / 2019/10 / более-тысячи-случайев-кори-зарегистрировано-в-шымкенте /.

29. Рахимова А. Около 9 тысяч человек заболели ОРВИ в Алматы в 2019 году [цитировано 2 апреля 2020 года]. Доступно по ссылке: https://newtimes.kz/obshchestvo/101123-poryadka-9-tys-patsientov-zaboleli-orvi-v-almaty.

30. Tengrinews. Заболеваемость коклюшем бьет рекорды в NKO 2019 [цитировано 2 апреля 2020 года]. Доступно по ссылке: https://tengrinews.kz/kazakhstan_news/zabolevaemost-koklyushem-bet-rekordyi-v-sko-387217/.

31.Жунусова А. В 2019 г. в Алматы зарегистрировано 56 детей с ВИЧ-положительным статусом [цитировано 2 апреля 2020 г.]. Доступно по ссылке: https://www.inalmaty.kz/news/2588816/v-almaty-zaregistrirovano-56-detej-s-polozitelnym-vic-statusom.

32. Шинкоренко О. В костанайской школе, где отравились дети, обнаружены кишечная палочка и золотистый стафилококк 2019 [цитировано 2 апреля 2020 года]. Доступно по ссылке: https://liter.kz/13736-kishechnuyu-palochku-i-stafilokok-obnarugili-v-kostanayskoy-shkole-gde-otravilis-deti/.

33.Kpozehouen EB, Chen X, Zhu M, Macintyre CR. Использование разведки с открытым исходным кодом для обнаружения ранних сигналов COVID-19 в Китае, описательное исследование. Обзор общественного здравоохранения JMIR. 2020. DOI: 10.2196 / 18939

Мягкое небо является важным местом адаптации для трансмиссивных вирусов гриппа

Специфичность связывания рецептора является важным фактором ограничения диапазона хозяев и передачи вирусов гриппа A (ссылки 4, 5 и обзор в ссылке 6). Способность вирусов зоонозного гриппа A передаваться воздушно-капельным путем увеличивает их пандемический потенциал ⁷ .Недавно несколько исследователей попытались идентифицировать вирусные детерминанты воздушно-капельной передачи путем создания трансмиссивных вирусов птичьего гриппа A ^8,9,10 H5 и H7. Мы подошли к этому вопросу иначе и использовали эпидемиологически успешный вирус гриппа А, в котором мы изменили предпочтение рецепторов с человеческого (α2,6-связанные сиаловые кислоты) на рецепторы птиц (α2,3-связанные сиаловые кислоты).

Ранее мы создали варианты вируса h2N1pdm с высокоспецифичным связыванием либо с α2,6-связанными, либо с α2,3-связанными сиаловыми кислотами (обозначаемые как вирус α2,6 или α2,3 h2N1pdm соответственно) ¹¹ .Вирус α2,3 h2N1pdm был получен путем введения четырех аминокислотных мутаций в сайт связывания рецептора HA (D187E, I216A, D222G и E224A) ¹¹ . Неожиданно оказалось, что вирусы α2,6 и α2,3 h2N1pdm, передаваемые воздушно-капельным путем, одинаково хорошо переносятся хорьками (рис. 1 и дополнительная таблица 1) и с такой же эффективностью, как наблюдалось ранее для вируса h2N1pdm дикого типа ^{12,13,14, 15} .

Исследования передачи были выполнены на 4 парах животных (всего 8 животных) в клетках с двойной защитой и перфорированными перегородками ¹² .Один хорек в каждой паре был инфицирован 10 ⁶ 50% инфекционной дозой культуры ткани (TCID ₅₀ ) указанного вируса; через 24 часа в соседний отсек был введен наивный хорек (называемый воздушно-десантным). Назальные выделения собирали через день в течение 14 дней. Вирусные титры из носовых выделений наносятся на график для каждого инфицированного или находящегося в контакте с воздухом животного. Передача вирусов α2,6 h2N1pdm ( a ) и α2,3 h2N1pdm ( b ) была аналогичной.Красная стрелка указывает на пиковый день выделения вируса у контактных животных, передающихся по воздуху.

Слайд PowerPoint

Задержка пикового выделения вируса была отмечена у контактных животных (подробности см. В легенде на рис. 1) в группе вируса α2,3 (красные стрелки на рис. 1), что свидетельствует о том, что вирус эволюционировал до передачи. Глубокий анализ последовательности вирусной РНК (вРНК), экстрагированной из носовых смывов хорьков, инфицированных вирусом α2,3 h2N1pdm, выявил смешанную популяцию в положении 222 аминокислоты (нумерация h2) с сконструированным глицином (G) и аспарагиновой кислотой дикого типа (D ), в то время как остальные три инженерных изменения в HA были сохранены (рис.2а и дополнительная таблица 2). Интересно, что вРНК из носовых смывов хорьков, контактирующих с воздухом, содержала только мутацию G222D HA (рис. 2а и дополнительная таблица 2), что позволяет предположить, что эта последовательность по аминокислоте 222 в вирусе α2,3 h2N1pdm была связана с переносом по воздуху. Посевной материал вируса не содержал смеси по этому остатку (фиг. 2а), и связанных изменений в гене нейраминидазы не наблюдалось (дополнительная таблица 3).

a , Глубокое секвенирование инокулята α2,3 h2N1pdm, промывание носа (NW) от инфицированного хорька при 1, 3 и 5 dpi и промывание носа от одного животного, контактировавшего с воздухом (AC), через 6 дней после экспозиция (dpe) выявила реверсию остатка 222 с G на D. Эти данные являются репрезентативными для трех пар передачи, которые привели к инфицированию животных, контактировавших с воздухом. Показано графическое представление доли прочтений каждого сконструированного нуклеотида. Синяя заливка представляет собой сконструированный нуклеотид α2,3-связанной сиаловой кислоты, а оранжевый представляет собой нуклеотидный остаток дикого типа.Все остальные сконструированные нуклеотиды были сохранены. b , реверсия G222D, в контексте других сконструированных мутаций, влияет на гликановую специфичность вируса α2,3 h2N1pdm. Гликаны указаны в условных обозначениях рисунка и определены в Методах; оранжевые цвета представляют α2,6-связанные сиаловые кислоты, а синие цвета представляют α2,3-связанные сиаловые кислоты. Нумерация h2 используется для всех положений аминокислот.

Слайд PowerPoint

Изменение D222G в HA вируса h2N1pdm 2009 произошло в естественных изолятах, и сообщения предполагают связь с повышенной вирулентностью у людей и не влияют на передачу по воздуху ^16,17,18 .Теоретический структурный анализ предполагает, что реверсия G222D делает сайт связывания рецептора лучше приспособленным для связывания α2,6-связанных сиаловых кислот, сохраняя при этом контакты с α2,3-связанными сиаловыми кислотами через глутаминовую кислоту по аминокислоте 187 (расширенные данные рис. 1). Данные по связыванию гликанов подтвердили это структурное предсказание, потому что мутация G222D не вызывала изменений связывания α2,3-связанной сиаловой кислоты, но существенно увеличивала связывание с длинноцепочечной α2,6-связанной сиаловой кислотой (рис. 2b). Предыдущие сообщения продемонстрировали важность связывания α2,6-связанной сиаловой кислоты для передачи ^4,5,19 .Теперь мы убедительно демонстрируем, что передача по воздуху требует увеличения связывания длинноцепочечной α2,6-связанной сиаловой кислоты и, вопреки предыдущим предположениям ⁴ , потеря связывания α2,3-связанной сиаловой кислоты не является необходимой.

Наличие отчетливой и идентифицируемой последовательности НА в трансмиссивном вирусе позволило нам определить, появляется ли она в определенной области дыхательных путей экспериментально инфицированных хорьков. Срезы тканей и образцы из верхних и нижних дыхательных путей собирали через несколько дней после инфицирования (dpi) у групп из 3 хорьков, инфицированных вирусом α2,3 h2N1pdm.Вирус был обнаружен у всех хорьков и во всех образцах (расширенные данные, рис. 2). Глубокое секвенирование вРНК как из верхних, так и из нижних дыхательных путей выявило смешанную популяцию по остатку 222 (рис. 3). Неожиданно оказалось, что вРНК из мягкого неба была заметно и уникально обогащена вирусом G222D на 1 dpi и ≥90% последовательностей, кодирующих D222 на 3 dpi (фиг. 3c). Все остальные сконструированные мутации были сохранены (расширенные данные, рис. 3). Эти данные свидетельствуют о том, что ревертантный вирус G222D активно селекционировался в мягком небе хорьков.

a — f , Различные образцы из дыхательных путей хорька: смыв из носа ( a ), респираторный эпителий (RE) носовых раковин ( b ), мягкое небо ( c ), трахея ( d ), бронхоальвеолярный лаваж (BAL) ( e ) и комбинированные правые, средние и левые срезы черепа легкого ( f ) были взяты у трех животных каждый с разрешением 1, 3, 5 и 7 dpi.Область респираторного эпителия носовых раковин изображена на рис. 6h с расширенными данными. Ген НА из вирусных популяций в этих образцах был глубоко секвенирован, и доля считываний с D в положении 222 показана оранжевым, а G — синим. Каждая полоса представляет собой одно животное. Стандартная ошибка между правым и левым отделами легкого показана в f .

Слайд PowerPoint

Чтобы определить, является ли быстрое обогащение ревертантного вируса G222D в мягком небе причиной инфицирования животных, контактировавших с воздухом, мы провели исследование передачи по воздуху, в котором наивные хорьки подвергались воздействию экспериментально инфицированных хорьков-доноров в течение всего 2 дней.Удивительно, но даже в течение этого сокращенного времени воздействия два животных, контактировавших с воздухом, выделяли вирус и у 3 из 4 животных, контактировавших с воздухом, произошла сероконверсия (расширенные данные рис. 4 и дополнительная таблица 1). Анализ последовательности вРНК от двух животных, контактировавших по воздуху с обнаруживаемым вирусом в смывах для носа, выявил присутствие ревертанта G222D. Эти данные предполагают, что отбор вируса α2,3 h2N1pdm с последовательностью D222 происходит в пределах 3 dpi у хорька-донора и что хорьки, контактирующие с воздухом, возможно, были инфицированы вирусом, происходящим из мягкого неба, потому что был почти полный отбор вируса. G222D мутант на 3 dpi в этой ткани.

Мягкое небо с поверхностями слизистой оболочки, обращенными к ротовой полости и носоглотке, обычно не исследуется на животных моделях гриппа. Чтобы понять, что движет обогащением ревертантного вируса G222D, связывающего длинноцепочечную α2,6-сиаловую кислоту, на этом участке, мы окрасили мягкое небо лектинами, специфичными для сиаловых кислот α2,6 или α2,3 (расширенные данные, рис. . 5). Мерцательный респираторный эпителий и слизистые бокаловидные клетки респираторного эпителия и подслизистых желез (SMG) содержали α2,6-связанные сиаловые кислоты (окрашивание SNA) (расширенные данные, рис.5). Экспрессия α2,3-связанной сиаловой кислоты (окрашивание MAL II) присутствовала в соединительной ткани, лежащей под респираторным эпителием, и в серозных клетках SMG. Используя очищенный белок HA (SC18), который избирательно связывает длинноцепочечные α2,6-связанные сиаловые кислоты ²⁰ , мы обнаружили высокую экспрессию длинноцепочечных α2,6-связанных сиаловых кислот в мягком небе по сравнению с трахеей и легкими. хорьков (рис. 4 и расширенные данные рис. 6). Недавний отчет, в котором подробно описывается гликановый профиль дыхательных путей хорька, подтверждает, что мягкое небо обильно экспрессирует α2,6 сиалированные структуры LacNAc ²¹ , аналогичные длинноцепочечным α2,6-связанным сиаловым кислотам, распознаваемым SC18 HA.Интересно, что как респираторный эпителий, так и обонятельный эпителий носовых раковин хорьков экспрессировали высокие уровни длинноцепочечной α2,6-связанной сиаловой кислоты, но респираторный эпителий носовых раковин не был обогащен мутантом G222D (рис. 3b и рис. Расширенные данные (рис. 6). Эти данные свидетельствуют о том, что мягкое небо необычно для селекции вируса G222D.

a — c , g — i , m — o , Окрашивание мягкого неба гематоксилином и эозином у неинфицированного хорька ( a — c ), свинья ( г — и ) и человека ( м, — или ) выделяют носоглотку, SMG и поверхности рта. d — f , j — l , p — r , Очищенная НА SC18 была использована для определения длинноцепочечных α2,6-связанных сиаловых кислот в этих срезах неинфицированного хорька ( d — f ), свиньи ( j — l ) и человека ( p — r ).Окрашивание носоглоточной поверхности показано для каждого вида в первом ряду, SMG во втором ряду и ротовой поверхности в последнем ряду. По крайней мере, два независимых образца ткани были окрашены и проанализированы для каждого вида. Для каждого образца использовали контроль, обработанный сиалидазой-А, чтобы гарантировать специфичность НА SC18 (не показано). Масштабные полосы, 100 мкм на всех изображениях. Звездочки выделяют SC18-положительные бокаловидные клетки, а белые стрелки указывают на SC18-положительные плазматические клетки мягкого неба человека.

Слайд PowerPoint

Чтобы определить актуальность для людей, мы оценили экспрессию длинноцепочечных α2,6-связанных сиаловых кислот в мягком небе людей и свиней.Интересно, что экспрессия длинноцепочечных α2,6-связанных сиаловых кислот сохранялась на респираторном эпителии и бокаловидных клетках мягкого неба у обоих видов (рис. 4). Кроме того, окрашивание растительными лектинами, специфичными для α2,6-связанных или α2,3-связанных сиаловых кислот (расширенные данные, рис. 7), показало, что α2,6-связанные сиаловые кислоты присутствовали на поверхности носоглотки и SMG обоих свиней и люди. Экспрессия α2,3-связанных сиаловых кислот была обнаружена в базальных клетках поверхности полости рта и на поверхности носоглотки мягкого неба человека; Эти данные согласуются с сообщениями, описывающими распределение сиаловой кислоты в носоглотке человека ²² .Другие исследователи также сообщили о репликации вирусов сезонного и пандемического гриппа А в срезах тканей носоглотки человека ²³ . Взятые вместе, эти данные подчеркивают важность носоглотки, мягкое небо которой образует дно, как места адаптации вирусов гриппа А.

Грипп Вирусная инфекция мягкого неба может способствовать передаче воздушно-капельным путем, обеспечивая богатую муцином микросреду для генерации переносимого по воздуху вируса во время кашля, чихания или дыхания.Инфекция вирусом α2,3 h2N1pdm привела к тяжелому воспалению и некрозу респираторных эпителиальных клеток и SMG в мягком небе (расширенные данные, рис. 8). Поскольку мягкое небо иннервируется тройничным нервом, воспаление этой ткани может стимулировать чихание. В качестве альтернативы мягкое небо может быть местом, откуда инфекция инициируется во время передачи воздушно-капельным путем; поэтому связывание с этой тканью обеспечило бы преимущество в фитнесе.

Эти результаты, хотя и с одним вирусом, улучшают наше понимание свойств, необходимых для воздушной передачи вирусов гриппа А в модели хорька.Утрата специфичности α2,3-связанной сиаловой кислоты не является необходимой, но усиление связывания длинноцепочечной α2,6-связанной сиаловой кислоты имеет решающее значение для эффективной передачи вирусов гриппа A воздушно-капельным путем. Вирусы H7N9 из Китая демонстрируют двойное связывание с рецепторами, но различную эффективность передачи по воздуху у хорьков ^24,25 . Интересно, что вирус h2N1 1918 года (A / New York / 1/18), который имеет такое же предпочтение связывания сиаловой кислоты, как и вирус α2,3 h2N1pdm, не передавался воздушным путем и не адаптировался в организме хорька-хозяина ⁴ , предполагая, что вирус h2N1pdm 2009 может быть необычным для этой быстрой адаптации.Однако недавно было сообщено об обнаружении мутации, которая усиливает связывание α2,6-связанной сиаловой кислоты в носовых смывах хорьков, инфицированных птичьим вирусом h3, ²⁶ , демонстрируя, что быстрая адаптация вирусов гриппа A к предпочтению рецепторов человека происходит в других подтипы вируса гриппа А.

Исследования трансмиссивных вирусов H5 показывают, что повышенный pH и термостабильность HA усиливают передачу по воздуху ^8,9,27 . Хотя мы не наблюдали адаптивных мутаций в стебле HA вируса α2,3 h2N1pdm, возможно, потому, что HA h2N1pdm уже адаптирован для человека, смешанная популяция наблюдалась на четырех остатках лизина вокруг сайта связывания рецептора (расширенные данные, рис.9 и в дополнительной таблице 2). Известно, что некоторые из них являются адаптивными мутациями яйца ²⁸ или являются компонентами предложенного положительно заряженного «лизинового барьера» вокруг основания сайта связывания рецептора, расположенного для закрепления ацетилнейраминовой кислоты N и галактозного сахара α2,3- связанные и α2,6-связанные гликаны сиаловой кислоты ²⁹ . Интересно, что остатки лизина восстанавливались в вРНК, выделенной из носовых смывов хорьков, контактировавших с воздухом, и мягкого неба экспериментально инфицированных хорьков (расширенные данные, рис. 9 и 10).

Вместе с нашими ранее опубликованными данными, связывание длинноцепочечной α2,6-связанной сиаловой кислоты и высокоактивная нейраминидаза вносят вклад в воздушную передачу вируса h2N1pdm ^12,30 . Важно отметить, что мы определили ранее упущенное из виду мягкое небо как важное место изоляции трансмиссивного вируса и, возможно, начальное место заражения. Анализ репликационной способности вирусов гриппа A в этой ткани может быть оправдан при оценке их пандемического потенциала.

Омичи должны быть готовы к новой волне коронавируса и гриппа | Последние новости Омска и Омской области

Об этом предупредил Роспотребнадзор.

Главный санитарный врач Омской области Александр Крига издал приказ о мерах по профилактике гриппа, ОРВИ и COVID-19 в эпидемиологическом сезоне 2020–2021 годов. Рекомендации разосланы во все инстанции. В постановлении говорится, что мэр Омска Оксана Фадина и главы муниципальных районов должны решить вопрос обеспечения медицинских учреждений необходимыми лекарствами, дезинфицирующими средствами, оборудованием и средствами индивидуальной защиты в период роста заболеваемости.

Минздрав должен до конца августа оценить готовность больниц к работе в эпидемический сезон и ежемесячно с августа отчитываться в Роспотребнадзор о степени готовности к эпидемии гриппа. До 7 сентября врачи должны пройти обучение по оказанию помощи при гриппе, ОРВИ, коронавирусе и внебольничной пневмонии, а работники детских садов и школ одновременно должны пройти обучение по предотвращению распространения этих заболеваний.Кроме того, от них требовалось оказывать помощь врачам в вакцинации, проводить утренний фильтр для детей и предотвращать массовые мероприятия.

В омских вузах рекомендуется не допускать скопления студентов в холлах, коридорах, у входа в класс, чистить системы вентиляции и не допускать на занятия учителей старше 65 лет и / или с хроническими заболеваниями. классы.

С сентября Минздрав вводит специальные анкеты для врачей неотложной помощи и приемных отделений больниц, по которым можно будет оперативно выявлять пациентов с признаками гриппа и ОРВИ.

Роспотребнадзор рекомендует властям ввести ограничительные меры в период роста заболеваемости. В том числе приостановка учебного процесса.

Анна Пацула

.

Использование машинного обучения для выявления заболеваний до появления симптомов — Центр новостей инженеров Мичигана

В этом разделе вопросов и ответов профессор Альфред Хиро объясняет свою работу, используя данные для прогнозирования передачи инфекционного заболевания среди людей с предсимптомным или бессимптомным течением, и как это связано с COVID-19.

ECE: Как ваше исследование связано с COVID-19?

AH: Мы работаем над прогнозированием состояния здоровья и болезней людей, подвергшихся воздействию инфекционных вирусных патогенов с начала 2007 года. Особый интерес для нас вызвали асимптотические и предсимптотические распространители, т. Е. человек, которые инфицированы, но не заражены. • чувствовать себя плохо и распространять вирус (индексные случаи часто называют «тифом Мэри»). Это особенно актуально для COVID-19, симптомы которого часто очень легкие, а инкубационный период относительно продолжительный.

ECE: Как ваше исследование превратилось в то, чем оно является сейчас?

AH: В нашей ранней работе методы машинного обучения применялись к данным, собранным у людей, для разработки геномных, метаболомных и протеомных предикторов бессимптомных и пресимптомных инфекционных заболеваний с использованием анализов крови и анализов других жидкостей организма. Одним из результатов этой работы стало открытие небольшой панели генов в цельной крови, которую можно использовать для выявления ранних признаков острой респираторной вирусной инфекции (ОРВИ), на что мы получили патент [1].

Мы установили в [2], что эта панель дает характерную сигнатуру, которая четко различает инфицированных людей, которые заболевают, и тех, кто этого не делает, после воздействия вируса.

В другой статье [3] мы использовали разреженное машинное обучение, чтобы установить преимущества сочетания тестовой выборки пациента со здоровой контрольной (базовой) выборкой для классификации состояния инфекции пациента. При применении к классификации образца, полученного от бессимптомного инфицированного субъекта, предсимптомного инфицированного субъекта или инфицированного субъекта с симптомами, классификатор на основе справочных данных [2] показал себя значительно лучше, чем стандартный классификатор, не имеющий доступа к исходному образцу.Таким образом, доступность персонализированных исходных данных улучшает нашу способность обнаруживать эти болезненные состояния.

Эта ранняя работа проводилась в сотрудничестве с другими инженерными исследователями и медицинскими клиницистами и поддерживалась с 2007 по 2011 год грантом DARPA / DSO в рамках программы Predicting Health and Disease (PHD). Позже мы были поддержаны другим грантом программы DARPA / DSO Biochronicity, которая расширила сферу PHD, включив стероидные, физиологические и когнитивные анализы, собранные на более длительной и более плотной временной шкале.

Среди других результатов наш анализ данных биохронности показал, что циркадные хронотипы человека сильно связаны с тяжестью инфекции [Рукопись готовится].

Совсем недавно, при поддержке гранта программы Prometheus DARPA / BTO, мы сосредоточили наши исследования непосредственно на раннем обнаружении того, что субъект выделяет вирус, ведущий к передаче и распространению инфекции. Данные Prometheus были собраны с носимых устройств (умных часов) о частоте сердечных сокращений, температуре кожи и других физиологических сигналах.Мы определили, что набор характеристик, извлеченных из этих сигналов, можно использовать для прогнозирования распространения вируса за 24 часа до его распространения [4].

ЕЭК: Как можно потенциально использовать это исследование для выяснения того, что происходит с нынешней или будущей пандемией?

AH: Наше исследование актуально по нескольким причинам:

1. Если появится более крупномасштабный анализ крови для всего населения и станет доступной технология быстрого и недорогого геномного анализа, наш классификатор в [1] и [2] может быть применен к тестовой выборке, чтобы предсказать, станет ли человек бессимптомным распространителем.Если они станут доступны, полученная информация поможет снизить распространение инфекции.

2. По мере того как мы будем получать больше данных от населения, носящего умные часы во время этой пандемии, наши прогностические модели будут уточняться. Эти уточненные модели позволят неинвазивно (без тестов) прогнозировать бессимптомное распространение.

ECE: Каковы самые большие проблемы в этой работе?

AH: Наши доступные данные имеют следующие недостатки с точки зрения применимости к COVID-19:

1. Это небольшой размер выборки (менее 300 участников исследования), поэтому до тех пор, пока мы не получим более крупные выборки данных, мы не знаем, будут ли наши результаты обобщены для населения в целом.

2. До сих пор мы не наблюдали заметного предсимптоматического сигнала в других жидкостях организма, таких как протеомика в конденсате дыхания или слизистой оболочке носа. Таким образом, наши методы не эффективны для текущего теста мазка из носа на COVID-19. В сочетании с данными крови или носимых данных может быть обнаруживаемый сигнал.

ECE: Что делать дальше?

AH: Мы работаем над сворачиванием сети социальных контактов в данные анализов по конкретным предметам. Эта комбинация контактных данных и данных анализа может снизить требования к отбору проб для обнаружения бессимптомных распространителей.Однако есть предостережения. Невозможно отследить все контакты. В значительной степени воздействие происходит через фомиты, оставленные на таких поверхностях, как дверные ручки, переключатели и кнопки лифта, которые невозможно эффективно отслеживать.

ECE: Повлияли ли новые протоколы социального дистанцирования на вашу способность проводить это исследование? Если да, то как вы адаптировались?

AH: Моя исследовательская группа в UM работает над анализом данных, которые уже были собраны. Таким образом, социальное дистанцирование не влияет на нас. Однако я ожидаю, что это повлияет на доступность данных ответа хоста COVID-19, что позволит нам уточнить наши модели для этого типа вируса.