Инкубационный период кишечной инфекции: 24.07.2018 Кишечные инфекции — КФС Отзывы — Корректор функционального состояния.Центр Регион

Содержание

Острые кишечные инфекции (ОКИ) / Новости / РЦИБ им. С.М. Магомедова

Забывая помыть перед едой руки и фрукты-овощи, мы рискуем подцепить кишечную инфекцию. В лучшем случае, это грозит многочасовым просиживанием в уборной. В худшем — инфекционной больницей и даже смертью. Заражение происходит при попадании возбудителя инфекции через рот, как правило, при употреблении зараженных пищевых продуктов и воды. Всего таких заболеваний более 30. Из них самое безобидное — так называемое пищевое отравление, а самые опасные — холера, брюшной тиф, ботулизм и т.д.

Причины Возбудителями кишечных инфекций могут быть: бактерии (сальмонеллез, брюшной тиф, холера), их токсины (ботулизм), а также вирусы (энтеровирус, ротавирус) и т.д. От больных и носителей инфекции микробы выделяются во внешнюю среду с испражнениями, рвотными массами, иногда с мочой. Практически все возбудители кишечных инфекций чрезвычайно живучи. Они способы подолгу существовать в почве, воде и даже на различных предметах.

Например, на ложках, тарелках, дверных ручках и мебели. Кишечные микробы не боятся холода, однако все же предпочитают жить там, где тепло и влажно. Особенно быстро они размножаются в молочных продуктах, мясном фарше, студне, киселе, а также в воде (особенно в летнее время). В организм здорового человека возбудители кишечной инфекции попадают через рот: вместе с пищей, водой или через грязные руки. Например, дизентерия может начаться, если попить парное (некипяченое) молоко или поесть сделанную из него простоквашу, творог или сметану. Кишечную палочку можно съесть вместе с некачественным кефиром или йогуртом. Стафилококковая инфекция комфортно себя чувствует в испорченных тортах с кремом. Возбудители сальмонеллеза (а их известно около 400 видов) попадают к человеку через любые зараженные продукты: куриное мясо и яйца, вареную колбасу, сосиски, плохо промытые или вымытые грязной водой овощи и зелень. Что происходит? Изо рта микробы попадают в желудок, а затем в кишечник, где начинают усиленно размножаться.

После попадания микробов в организм наступает бессимптомный инкубационный период, продолжающийся, в большинстве случаев, 6-48 часов.

Симптомы заболевания вызывают как сами микробы, так и выделяемые ими токсины. Кишечные инфекции могут протекать в виде острого гастрита (с рвотой и болями под ложечкой), энтерита (с поносом), гастроэнтерита (с рвотой и поносом), колита (с кровью в экскрементах и нарушением стула), энтероколита (с поражением всего кишечника). Одно из самых неприятных последствий, возникающих при кишечных инфекциях — обезвоживание организма вследствие рвоты и/или поноса. Особенно тяжело эти болезни протекают в раннем детском возрасте и у пожилых людей. Результатом резкого обезвоживания могут стать почечная недостаточность и другие тяжелые осложнения, в частности, дегидратационный (связанный с потерей жидкости) шок. Как проявляются? Кишечные инфекции, как и все остальные инфекционные заболевания, всегда случаются неожиданно. В самом начале заболевания человека беспокоит слабость, вялость, снижение аппетита, головная боль, повышение температуры — симптомы, напоминающие обычное ОРЗ.

Однако через некоторое время возникает тошнота и рвота, появляются схваткообразные боли в животе, понос с примесью слизи, гноя или крови (например, при дизентерии). Может беспокоить жажда и озноб. Для инфекций этой группы характерны следующие симптомы (по отдельности или в сочетании друг с другом): повышенная температура; тошнота, рвота; боль в животе; понос; избыточное газообразование в кишечнике (метеоризм). Иногда кишечные инфекции не имеют видимых симптомов, но сопровождаются выделением возбудителей. В плане распространения инфекции такое носительство особенно опасно — ничего не подозревающий человек становится постоянным источником микробов, заражая окружающих.

Диагностика и лечение Очень важно отличить кишечную инфекцию от других заболеваний со сходными симптомами: небактериального пищевого отравления (например, лекарствами), острого аппендицита, инфаркта миокарда, пневмонии, внематочной беременности и т.д. При появлении симптомов, напоминающих острую кишечную инфекцию, необходимо обратиться к инфекционисту. Для того, чтобы правильно поставить диагноз, врач назначит бактериологическое исследование кала или рвотных масс. Дополнительно могут применяться серологические методы диагностики (для выявления антител к возбудителям инфекции). Если состояние пациента быстро ухудшается, срочно вызывайте «Скорую помощь», а до ее приезда оказывайте пострадавшему первую помощь.

Лечение кишечных инфекций является комплексным и включает в себя: борьбу с микробными ядами, самими микробами, а также с обезвоживанием организма. Кроме того, больные должны соблюдать правильную диету и с помощью специальных препаратов восстанавливать нормальную микрофлору кишечника. Профилактика Чтобы уберечься от острых кишечных инфекций, достаточно соблюдать следующие несложные правила: пить воду и молоко только в кипяченом виде, мыть овощи и фрукты горячей водой с мылом, соблюдать правила и сроки хранения пищевых продуктов, мыть руки перед едой и не грызть ногти.

Острые кишечные инфекции. Автор статьи: врач-инфекционист Подряднова Татьяна Валентиновна.

26 ноября 2019

Журнал «Здоровье семьи»

Острые кишечные инфекции (ОКИ) — это большая группа инфекционных заболеваний человека с энтеральным (фекальнооральным) механизмом заражения, вызываемых патогенными (шигеллы, сальмонеллы и др.) и условно-патогенными бактериями (протей, клебсиеллы, клостридии и др.), вирусами (рота-, астро-, группы Норфолка и др.) и простейшими (амеба, лямблии, криптоспоридии и др.)

ОКИ до настоящего времени занимают ведущее место в инфекционной патологии, уступая по заболеваемости только гриппу и острым респираторным инфекциям. По данным ВОЗ ежегодно в мире регистрируется до 1-1,2 млрд. кишечных заболеваний и около 1 млн. в России. Источником инфекции является человек и/или животные. Для ОКИ характерна всеобщая восприимчивость. Чаще всего болеют ОКИ маленькие дети. Ведущий путь передачи для детей раннего возраста — контактнобытовой, для детей старшего возраста и взрослых пищевой или водный. Воздушнокапельным, трансмиссивным и парентеральным путем кишечные инфекции не передаются. При кишечных инфекциях, протекающих с бактериемией (например, брюшной тиф, кампилобактериоз), возможно внутриутробное инфицирование плода.

Кишечные инфекции встречаются как в виде спорадических случаев, так и в виде отдельных вспышек, вплоть до пандемий (холера). Для большинства ОКИ бактериальной этиологии характерен летне-осенний подъем заболеваемости, для вирусных диарей (поносы) — осенне-зимний период года. В последние годы удельный вес ОКИ вирусной этиологии среди госпитализированных больных в стационар составляет в зимний период года (январь — март) до 70%. Это неуправляемая инфекция, так как нет вакцин. Входными воротами инфекции и органом «мишенью» является желудочно-кишечный тракт. Клинически ОКИ характеризуется симптомами интоксикации (вялость, сниженный аппетит, лихорадка, тошнота, рвота), нередким развитием синдромов инфекционного токсикоза и диарейным синдромом (чаще нарушение стула).

Несмотря на значительные достижения лабораторной диагностики источник заражения ОКИ в 50-80% случаев остается нераспознанным. В последние годы особое внимание привлечено к ротавирусам- наиболее значимым возбудителям острых гастроэнтеритов. По РТ и г. Казани в 2008-2009 гг. около 30% случаев заболеваний ОКИ обусловлено ротавирусной инфекцией. Причем дети до 1 года составили 52%. У 2/3 пациентов заболевание протекало в среднетяжелой форме. Ротавирусная инфекция — острое антропозоонозное инфекционное заболевание, характеризующееся нарушением стула в виде поносов.

Ротавирусная инфекция характеризуется цикличностью течения. Инкубационный период колеблется в пределах 1-7 суток (в среднем 2-3 дня). Острый период болезни длится 3-4 дня, из них на начальную фазу приходится 12-24 часа и на фазу разгара 2-3 суток. Заболевание при типичной форме начинается остро с развития триады синдромов: общего инфекционно-токсического (повышением температуры, вялость, потеря активности), респираторного (чихание, кашель), желудочно-кишечного (энтерит, гастроэнтерит).

Инфекционно-токсический синдром проявляется повышением температуры тела до 38-39 град., вялостью, слабостью, адинамией и снижением аппетита вплоть до анорексии (ребенок ничего не ест). Продолжительность лихорадки составляет в среднем 2-4 дня.

Кишечный синдром протекает в виде гастроэнтерита или энтерита. Больные отмечают тяжесть в эпигастральной области, тошноту, появляется рвота. С первых дней у больных отмечаются выраженные боли в животе по ходу кишечника, вздутие живота, при пальпации шумное урчание. Диарея характеризуется кашицеобразным или чаще жидким стулом желтого или зеленого цвета без патологических примесей. Кратность дефекаций составляет от 2-7 раз в сутки до 15 раз и более. Явлений в виде гемоколита (кровь в кале) никогда не наблюдаются.

Респираторный синдром также регистрируется с самого начала заболевания: яркая гиперемия и зернистость слизистых оболочек, мягкого неба, небных дужек, язычка, ринит.

Ротавирусный гастроэнтерит чаще протекает в легкой и среднетяжелой форме. Ротавирусная инфекция обычно характеризуется цикличным течением с выздоровлением большинства больных. Затяжное и хроническое течение ей не свойственно.

У новорожденных детей (в родильных домах) ротавирусная инфекция чаще протекает бессимптомно. Может быть кратковременная слабовыраженная диарея. Но известны тяжелые ее формы у недоношенных детей вплоть до летального исхода.

Заболевание лечится в стационаре, особенно у детей до 1 года. Лечебные мероприятия при ротавирусной инфекции носят комплексный характер, включая режимные моменты, питание и медикаментозную терапию. Патогенетическая терапия направлена на купирование инфекционно-токсического, кишечного и связанного с ним синдрома обезвоживания.

При обезвоживании проводится обильное питье, назначается регидрон, цитроглюкосолан и др. В домашних условиях можно применить рисовый отвар, щелочные минеральные воды без газа, раствор, содержащий в 1 литре питьевой воды 1 чайную ложку поваренной соли, 1 чайную ложку питьевой соды, 2 чайной ложки сахарного песка. Парентеральная регидратация проводится реополиглюкином, 5-10% растворами глюкозы, полиионными буферными растворами. Также применяют препараты кальция, адсорбенты, энтерол, иммодиум, ферменты, биопрепараты. Выписку пациентов проводят только после клинического выздоровления. В настоящее время (США, Венесуэла и др.) проходят третью (завершающую) фазу клинических испытаний живые аттенуированные вакцины из рекомбинантных ротавирусов человека и животных против ОКИ. Надеемся, что их появление на нашем рынке «не за горами» и это поможет в дальнейшем сохранить здоровье нашим детям.

Поделиться в соц.сетях

Опасность острых кишечных инфекций в жаркий период

Вы знали, что острые кишечные инфекции наиболее опасны в жаркий период?

Елена Николаевна Абрамова, заведующая отделением кишечных инфекций ИКБ № 1, расскажет об особенностях течения этих заболеваний, и как можно избежать заражения данными инфекциями.

Острые кишечные инфекции (ОКИ) – это заболевания желудочно-кишечного тракта, вызываемые различными бактериями, вирусами или простейшими паразитами, и которые сопровождаются интоксикацией, болями в животе, жидким стулом и рвотой. К таким инфекциям относятся: дизентерия, сальмонеллезы, брюшной тиф, холера, иерсиниозы, пищевые токсикоинфекции и вирусные диареи (ротавирусная и норовирусная инфекции).

ОКИ имеют значительное распространение в летне-осенний период. Заболеваемость увеличивается в связи с повышенным употреблением овощей, фруктов и других продуктов, которые иногда забываем или недостаточно тщательно моем. Летом мы чаще пьем некипяченую воду, открывается купальный и пляжный сезон. Не стоит забывать, что инфекция может передаться через воду в водоемах.

Ввиду повышенной температуры воздуха летом, повышается риск порчи различных продуктов. Заражение людей ОКИ происходит при попадании возбудителя в организм человека через рот, а именно, при приеме в пищу продуктов питания, инфицированных возбудителями инфекции, употреблении воды из неизвестных источников и не подвергавшейся обеззараживанию.

Нельзя употреблять в пищу еду с истекшим сроком годности или скоропортящиеся продукты, которые длительное время хранились не в холодильнике.

Необходимо соблюдать правила личной гигиены. Достаточно помыть руки, чтобы избежать инфицирования через рукопожатия и различные предметы обихода, т.к. микроорганизмы весьма устойчивы к внешней среде. Перед приготовлением еды и приемом пищи руки тоже нужно помыть.

На кухне должна соблюдаться идеальная чистота. При разделке различных видов продуктов используйте отдельные ножи и доски. Тщательно мойте все поверхности и предохраняйте кухню и продукты от насекомых, грызунов и других животных. Своевременно удаляйте пищевые отходы.

Соблюдайте правила приготовления и хранения продуктов. После остывания приготовленной еды, храните ее в закрытой посуде с температурой не выше 5°С, но не долго. Пищу для детей лучше не подвергать хранению и употреблять сразу.

Клиническая картина кишечных инфекций зависит от возбудителя заболевания. Инкубационный период варьирует от нескольких часов при пищевой токсикоинфекции до нескольких дней при сальмонеллёзе и дизентерии. Основные симптомы, на которые необходимо обратить внимание: общая вялость, слабость, плохой аппетит. Чуть позже наступает рвота, диарея, боли в животе, возможна высокая температура, озноб. Наряду с поражением кишечника могут отмечаться изменения со стороны верхних дыхательных путей. С рвотой и жидким стулом организм обезвоживается, что представляет опасность для работы сердечно-сосудистой системы и почек.

При возникновении симптомов острой кишечной инфекции необходимо немедленно обратиться за медицинской помощью. Проявления кишечных инфекций могут быть схожи с симптомами острой хирургической патологии, например аппендицит или острый панкреатит – правильный диагноз может поставить только врач.

Медицинские новости — БУЗ РА «Центр по профилактике и борьбе со СПИД»

Понедельник, 1 Июль 2019

Кишечные инфекции относятся к сезонным заболеваниям, пик которых приходится на летний период. Тёплая погода способствует созданию благоприятных условий для сохранения и размножения возбудителей кишечных инфекций в окружающей среде, пищевых продуктах, воде, предметах домашнего обихода. Как провести это лето без «сюрпризов», а если всё же их не удалось избежать, как выйти из ситуации с меньшими потерями? На эти и другие вопросы ответила главный внештатный инфекционист Министерства здравоохранения Республики Алтай Елена Сакашева.

— Елена Викторовна, что собой представляют кишечные инфекции? Как они «ведут» себя, попадая в организм человека?

— Это большая группа заразных заболеваний, их насчитывается более 30, которые в первую очередь поражают желудочно-кишечный тракт. Причиной инфекции могут стать вирусы, бактерии, а также продукты их жизнедеятельности (токсины). И, хотя кишечные заболевания различаются по тяжести протекания и быстроте излечения, они характеризуются однотипной симптоматикой, включающей в себя явления интоксикации (повышенная температура, головная боль, слабость и т.д.), расстройство стула (понос), тошноту и рвоту, а также боли в животе.

Кишечные инфекции очень широко распространены, причём заболевают ими люди любого возраста. Наиболее подвержены этому заболеванию дети, пожилые граждане, люди с определёнными хроническими заболеваниями.

— Известно, что кишечные инфекции передаются через грязные руки. Как ещё можно «подхватить» это заболевание?

— Да, с нечистыми руками, водой, пищей, в рот попадают вирусы и бактерии, затем они транспортируются в желудок и кишечник, где начинают активно размножаться и продуцируют различные токсины. Эти вещества нарушают проницаемость клеточных мембран, вмешиваются в ход биохимических процессов, приводят к дисбалансу важных солей, минеральных веществ и потере влаги.

Бывает, что неприятности начинаются после купания в реке или озере, где летом прекрасно себя чувствуют вирусы и бактерии. Я, конечно, не призываю отказываться от купания, но важно следить, чтобы вам и особенно детям вода не попадала в рот. Выбирайте для этих целей чистые и проверенные водоёмы, после купания необходимо принять душ.

Что касается ротавируса и других вирусов, они нередко передаются воздушно-капельным путём, то есть в момент общения или случайного контакта с больным человеком.

— Как протекает инфекция? Когда нужно бить тревогу и обращаться за медицинской помощью?

— Как правило, кишечная инфекция развивается по известному сценарию. Инкубационный период – время от момента заражения до появления первых симптомов – длится от нескольких часов до 3–4 дней, потом организм начинает подавать тревожные сигналы. Вялость, повышенная температура, отсутствие аппетита, головная боль, непереносимость яркого света — эти симптомы характерны для многих заболеваний. Если же они сопровождаются рвотой, диареей, болями в животе, то круг «подозреваемых» сужается — скорее всего, это кишечная инфекция. В зависимости от её типа набор симптомов может быть разным. Обычно заболевание протекает остро, появляется жидкий стул (от водянистого до жидкого стула с кровью), боли в животе, тошнота, рвота, слабость, повышение температуры.

Все кишечные инфекции опасны прежде всего обезвоживанием организма. Понос и рвота постоянно увеличивают потерю воды, вместе с которой из организма выводятся минеральные вещества, в первую очередь калий и натрий.

В подавляющем большинстве случаев для лечения таких заболеваний не требуется приёма каких-либо лекарств, поскольку организм человека самостоятельно вырабатывает антитела к микробами и уничтожает их. Главное лечение – питьё. Пить необходимо понемногу, но часто, можно воду, можно регидратационные растворы (Регидрон, Трисоль и др.). Необходимо помнить о соблюдении диеты, а впервые сутки и вовсе следует отказаться от приёма пищи. Диета при кишечной инфекции должна исключать продукты, которые провоцируют жидкий стул, в рацион можно включить куриный бульон, сухари, рисовую кашу, кисель или крепкий чай.

У больного должна быть отдельная посуда, его белье и одежду нужно стирать отдельно, после ухода за ним необходимо мыть руки.

Поставить точный диагноз и назначить правильную терапию может только врач. Самостоятельное лечение кишечной инфекции возможно, если вы сталкивались с аналогичными расстройствами раньше и чувствуете себя относительно неплохо – без жара, мучительной рвоты или слабости, сыпи, сильных болей и других необычных симптомов. Однако у детей младше 3-х лет, у взрослых старше 60 лет, у лиц, страдающих нарушениями иммунитета, болезнями сердца, ЖКТ, печени и почек, гипертонией и т.д., при одновременном заболевании нескольких членов семьи, резком ухудшении состояния, отсутствии улучшения в течение 3-х дней, появлении симптомов недуга после турпоездки в страны Африки или Азии, южные республики бывшего СССР или после контакта с людьми, прибывшими оттуда, консультация врача обязательна!

При пищевом отравлении и неосложнённой кишечной инфекции больному должно стать легче через день-два после появления первых симптомов, полное выздоровление наступит через 7-10 дней. Если вы лечились самостоятельно и состояние стало лишь ухудшаться, не откладывая обратитесь к доктору!

— В летнее время врачи регистрируют увеличение случаев заражения энтеровирусной инфекцией. Что это за инфекция? Чем она опасна?

— Энтеровирусные инфекции (ЭВИ) — группа острых заболеваний, вызываемых энтеровирусами. Отмечу, что энтеровирусная инфекция — очень многолика, у нее 14 клинических проявлений, от легких лихорадочных состояний до тяжелых менигоэнцефалитов, миокардитов.

Ребёнок или взрослый могут заразиться энтеровирусной инфекцией от другого человека, который недавно был заражён и переболел этой болезнью. Вирус содержится в частичках слюны, слизи (из горла), а также в частичках кала заболевшего человека. Как и другие кишечные инфекции ЭВИ могут передаваться при общении с заболевшим человеком, при использовании общей посуды или полотенца, при употреблении в пищу воды или продуктов питания. В купальный сезон источником заражения могут быть плавательные бассейны и естественные водоёмы.
У подавляющего большинства взрослых и детей, которые заражаются энтеровирусной инфекцией, эта болезнь развивается не опасно и заканчивается полным выздоровлением в течение 5-10 дней. Тем не менее у некоторых людей инфекция может спровоцировать серьезные осложнения со стороны сердца, нервной системы, лёгких и других внутренних органов, что опасно для жизни.

Тяжёлое развитие энтеровирусной инфекции более вероятно у детей раннего возраста (в том числе у грудничков) и у людей с ослабленной иммунной системой.

Поскольку чаще всего этому заболеванию подвержены дети, хочу напомнить родителям — обращайте внимание на появление постоянной, интенсивной головной боли у ребёнка, высокую температуру (38 и выше) и рвоту. Это три главных тревожных симптома, заметив которые незамедлительно обратитесь к врачу!

— Какие существуют меры защиты от кишечных инфекций, включая энтеровирусную?

— Главная защита — профилактика. Первое главное правило — мыть руки. Это нужно делать перед приготовлением и употреблением пищи, после посещения общественных мест. Сейчас продаётся масса гелей, спреев, влажных салфеток для дезинфекционной обработки рук, которые желательно носить с собой и использовать, если нет возможности помыть руки под краном. Ни в коем случае не пейте воду из непроверенных источников — колодцев, родников, колонок. Пить желательно только кипяченую или бутилированную воду. Как уже говорилось выше, нельзя глотать воду при купании. Для маленьких детей необходимо покупать продукты ежедневно и готовить им пищу на один приём — это очень важно. Молоко и творог для ребёнка должны подвергаться термической обработке. При покупке скоропортящихся продуктов смотрите на сроки годности. Сейчас начинается сезон бахчевыхх культур, не стоит покупать арбузы и дыни в разрезанном виде, не поддавайтесь предложению продавцов попробовать кусочек «с ножа». Тщательно мойте фрукты и овощи, в том числе, те, которые в кожуре, в струе проточной воды. Не покупайте продукты на стихийных рынках! В каждом доме должны быть разделочные доски и ножи, предназначенные отдельно для разделки сырых продуктов и уже приготовленных.

В этих правилах нет ничего сложного, их соблюдение должно стать нормой жизни, тогда и риски заболеть кишечной инфекцией значительно снизятся. Хорошего вам лета! Будьте здоровы!

Кишечные инфекции и их профилактика

Из года в год в мире регистрируется все больше кишечных инфекций, некоторые их которых, порой, заканчиваются смертельным исходом. Наиболее распространены кишечные инфекции неустановленной этиологии, сальмонеллезная инфекция, бактериальная дизентерия, пищевые токсикоинфекции энтеробактериальной и стафилакокковой природы. Последние годы значительно возросла роль гастроэнтеритов вирусной этиологии, вызванных ротавирусами, норовирусами, энтеровирусами. Неблагополучие по острым кишечным инфекциям в Российской Федерации является отражением мировых тенденций.

Кишечные инфекции — это целая группа заразных заболеваний, которые в первую очередь повреждают пищеварительный тракт. Заражение происходит при попадании возбудителя инфекции через рот, как правило, при употреблении зараженных пищевых продуктов и воды, при вирусных инфекциях, кроме того, через мельчайшие капельки слюны и мокроты при кашле и чихании, через испражнения больного. При контактно-бытовом пути возбудитель может передаваться через загрязненные руки, предметы домашнего обихода (белье, полотенца, посуда, игрушки). Изо рта микробы попадают в желудок, а затем в кишечник, где начинают усиленно размножаться. После попадания микробов в организм наступает бессимптомный инкубационный период, продолжающийся, в большинстве случаев, 6-48часов.

Возбудители кишечных инфекций отличаются большой устойчивостью во внешней среде. Сальмонеллы выдерживают нагревание до 65 гр.С в течение 30 минут, сохраняют жизнеспособность в пыли до 80 дней, в почве живут несколько лет. Дизентерийные микробы сохраняются во внешней среде до 30-45 дней. Энтеровирусы выживают в водопроводной воде до 18 дней, норовирусы устойчивы к высыханию, замораживанию, нагреванию до 60гр. С и погибают только от хлорсодержащих дезинфицирующих средств.

Источником инфекции при дизентерии является только больной человек, при сальмонеллезе — больной человек и животные. Например, до 30% сальмонеллы обнаруживаются у овец, до 15% — у свиней, до 40% — у мышевидных грызунов, до 50% — у гусей и уток.

Как правило, кишечные инфекции начинаются остро. Отмечается повышенная температура тела, снижение аппетита, тошнота, рвота, жидкий стул, головная боль и пр. Серьезным последствием кишечной инфекции является обезвоживание организма, особенно тяжело протекающее у детей и у пожилых людей. Клиническая картина заболеваний различается в зависимости от вида кишечной инфекции.

Иногда кишечные инфекции не имеют видимых симптомов, но сопровождаются выделением возбудителей. В плане распространения инфекции такое носительство особенно опасно — ничего не подозревающий человек становится постоянным источником заражения окружающих.Среди людей все чаще выявляются здоровые бактерионосители сальмонелл, здоровые вирусоносители ротавирусной и энтеровирусной инфекции. Взрослый человек может не заметить, что он носитель ротавирусной инфекции, болезнь, как правило, протекает со стертыми симптомами (снижение аппетита, кратковременное повышение температуры), но в этот период человек является заразным! Люди, инфицированные норовирусом, способны заразить окружающих во время разгара заболевания и в течение последующих 2-х суток, а иногда в течение 2-х недель после начала заболевания.

Как уберечься от кишечной инфекции?

Соблюдать питьевой режим

Использовать для питьевых целей только кипяченую или бутилированную воду.

Соблюдать правила личной гигиены

Тщательно и часто мыть руки с мылом, особенно после посещения туалета, перед едой, после возвращения с улицы.
Избавиться от вредной привычки грызть ногти

Соблюдать правила приготовления пищи

Осуществлять приготовление пищи в оптимальных гигиенических условиях: приготовление пищи должно обеспечивать ее безопасность.
Соблюдать технологию приготовления блюд, практиковать тушение, запекание и другие способы термической обработки.
Соблюдать правила кулинарной обработки продуктов

— пользоваться разными досками и ножами для разделки мяса, рыбы, овощей.

Подвергать фрукты качественной обработке горячей водой, ополаскивая их кипяченой водой.
Свежие овощи использовать в блюдах после термической обработки.
Использовать в питании только свежеприготовленную пищу.

Соблюдать правила хранения продуктов

Cкоропортящиеся продукты — молочные, мясные, рыбные, кондитерские, овощные и приготовленные блюда хранить в холодильнике при температуре (+2) – (+ 6) гр.С.
Соблюдать условия хранения продуктов и сроки их годности.
Хранить раздельно сырые и готовые продукты, мясные и молочные продукты.

Соблюдать санитарный режим на кухне

Регулярно проводить уборку на кухне с применением моющих и дезинфицирующих средств.
Не допускать контакт пищевых продуктов и готовой пищи с животными, насекомыми, грызунами.

Обращать внимание при покупке продуктов

на внешний вид продуктов, их запах, упаковку и информацию на этикетке;
на дату изготовления продуктов – не приобретать и не использовать в питании продукты с истекшим сроком годности;
приобретать продукты исключительно в местах санкционированной торговли;
исключить приобретение продуктов сомнительного качества, продуктов с признаками недоброкачественности.

Соблюдать правила поведения на воде

Купаясь в водоеме, не заглатывать воду.

В настоящее время используются средства специфической защиты населения от кишечных инфекций в виде вакцинации: дизентерийной вакциной против Шигелл Зоне, вакциной для профилактики гепатита А, профилактической вакциной против вируса гепатита В.

Следите за своим здоровьем!

Обращение в лечебно-профилактическое учреждение при любом расстройстве желудочно-кишечного тракта, поможет своевременное поставить диагноз, назначить соответствующее лечение и предупредить распространение инфекции.

Кишечные инфекции можно предупредить

Когда летом вокруг просто разбегаются глаза от изобилия овощей и фруктов, хочется перепробовать всё, что видишь. А когда обнаруживаешь роящиеся над лотками тучи мух — желание куда-то испаряется. И почему-то вспоминается, что и руки негде помыть перед тем, как отправить в рот вот ту клубничку… или вон тот персик… а они бессовестно лежат и соблазняют румяными боками, всем своим видом суля неземной вкус.

Что такое кишечные инфекции?

Возбудителей кишечных инфекций довольно много — это могут быть как бактерии, так и разные виды вирусов, которые попадают в организм вместе с некачественными или приготовленными в антисанитарных условиях продуктами питания, с немытыми овощами и фруктами, через контакт продуктов и посуды с грязными руками и т. д. Как видите — в основном через рот. И, попав в организм, эти непрошеные гости развивают там бурную деятельность, в результате чего человек чувствует себя плохо.

Общими признаками острых кишечных инфекций служат ощущение слабости, головная боль, повышенная температура. Эти признаки тем больше выражены, чем сильнее отравлен организм. А ещё у каждого желудочно-кишечного заболевания есть своя особая симптоматика.

Если пострадал желудок, то речь идёт о гастрите. Самые частые его признаки — начинает болеть верхняя часть живота, также присутствуют рвота и тошнота.

При поражении тонкого кишечника ставится диагноз «энтерит». Врач может определить это, если есть жалобы на боль в животе, вздутие, жидкий водянистый понос (возможно даже со слизью или зеленью) — это говорит о неполадках в процессе пищеварения и всасывания пищи. Патологии в работе толстого кишечника именуются колитом. Если в стуле присутствуют зелень, слизь или прожилки крови, желание посетить туалет сопровождается сильной болью и в животе периодически возникают схваткообразные боли — это он.

Но в реальной жизни так, что поражён только какой-то один отдел желудочно-кишечного тракта, случается редко. В основном под удар попадают несколько отделов — если толстый и тонкий кишечник, то диагноз будет звучать как «энтероколит», если желудок и тонкий кишечник — то это уже будет гастроэнтеритом, если пострадал весь пищеварительный тракт — это называется гастроэнтероколитом.

Только не обольщайтесь, что с похолоданием «впадут в спячку» и кишечные инфекции. На смену осенне-летним бактериальным инфекциям зимой и весной приходят их вирусные родственники. Так что принцип «предупреждён — значит вооружён» будет никогда не лишним.

Виды кишечных инфекций

Дизентерия, она же шигеллёз (второе название получила из-за того, что вызывается бактериями рода Shigella) может быть подхвачена от бактерионосителя или заболевшего человека. Бактерии Shigella достаточно живучи — они холодоустойчивы, могут довольно длительное время жить в пище (особенно в молочных продуктах) и воде. Инкубационный период дизентерии — 2-3 дня. Определяется при таких симптомах, как повышение температуры тела, отсутствие аппетита, вялость, частый, но скудный стул с прожилками крови или слизью, боли в животе. Рвота может быть только в первые сутки, не более пары раз.

Сальмонеллёз, вызываемый бактериями рода Salmonella, передаётся не только от заболевшего человека, но и от домашней живности (куры, коровы и т. д.). Эти бактерии могут долгое время жить в воде и продуктах питания (мясо, яйца, молочные продукты) и устойчивы к низким температурам. Попав в тёплую среду, бактерии начинают усердно размножаться, в результате чего образуются токсические вещества. Инкубационный период — от четырёх часов до двух суток, симптоматика — повышенная температура, боли в животе, отсутствие аппетита, слабость (не правда ли, похоже на дизентерию?). Чтоб дифференцировать с дизентерией, обратите внимание на частый жидкий стул и обильную рвоту.

Ротавирусная инфекция получила своё название из-за того, что внешне её возбудитель напоминает по форме колесо (по-латыни — rota). Заполучить её можно только от больного человека (он считается заразным 7-10 дней от начала заболевания). Поскольку этот вирус спокойно переносит холода, то пик заболеваемости ротавирусной инфекцией приходится как раз на холодное время года (поздняя осень-зима-ранняя весна). Симптомы заболевания — повышение температуры до 38° С (может быть и выше), отсутствие аппетита, боль в верхней части живота, частые рвотные позывы, очень частые дефекации, жидкий стул. Инкубационный период при этой болезни составляет 1-2 дня, но при перенесённом ротавирусе человек обеспечивается иммунитетом на всю жизнь.

Норовирусная инфекция происходит из семейства энтеровирусов. Самое неприятное в этой болячке — невероятная живучесть её возбудителя: норовирус, что называется «в огне не горит и в воде не тонет». Он не только спокойно переживёт пребывание в воде, нагрев до 60° С, но и замораживание с высыханием. А при попадании в человеческий организм уже через несколько часов успевает натворить кучу неприятностей. При этой инфекции повышение температуры минимально, но с тошнотой, болью животе и поносом. Уже через пару дней состояние может стабилизироваться, но человек будет заразным ещё несколько недель. Так что мотайте это на ус.

Пищевая токсикоинфекция (так мудрёно врачи называют отравление) тоже считается кишечной инфекцией, её провоцируют такие бактерии как клебсиелла, стафилококк, кишечная палочка или протей. Самые частые места «проживания» этой гадости — кремовые тортики и пирожные, молоко и молочные продукты, творог, колбасы, которые хранятся неправильно (например, на жаре).

Иногда бывает и так, что выраженные симптомы у человека отсутствуют, но при анализах обнаруживаются патогенные бактерии (та же кишечная палочка и т. д.). Это имеет название «бактерионосительство» и несёт в себе скрытую угрозу — распространение инфекции, даже не подозревая о её наличии. В таком случае необходимо лечение до полного выздоровления носителя.

Как избежать кишечной инфекции?

Неприятность проще предупредить, нежели потом избавляться от её последствий. Самое основное — соблюдение правил гигиены. Висевший в советских столовых лозунг «Мойте руки перед едой» не теряет своей актуальности и сегодня. А если быть конкретнее — то не только перед едой, но и после посещения туалета, после возвращения с улицы. Если хотите перекусить в городе и нет возможности помыть руки, носите с собой хотя бы влажные салфетки или флакончик с антибактериальным гелем.Если вы собираетесь готовить или есть сырые овощи и фрукты, их необходимо тщательно мыть под проточной водой. Хотите угостить ягодкой ребёнка? Помните — особо тщательно необходимо мыть клубнику, так как она контактирует с землёй. Молочные продукты, мясо, колбасы, готовые салаты надёжнее всего покупать в торговых точках, оборудованных холодильниками. Дома их хранить только в соответствующих условиях, не бросать на столе на долгий срок, особенно в жару, а если срок годности истёк — выбрасывать. Может взыграть жадность за выброшенные деньги, но лечение кишечной инфекции может обойтись дороже. Так будет убедительнее?

Собираясь готовить еду на всю семью, на всякий случай учтите, что приготовленные блюда даже в холодильнике оптимальнее всего хранить не более двух суток. А пить старайтесь только бутилированную или кипячёную воду. Без холодильника такая вода может выдержать от шести до восьми часов, потом эффект от кипячения сводится практически к нулю и приходится ещё раз её кипятить.

Так что соблюдайте меры предосторожности и пусть инфекции

жарким летом обходят вас стороной!

Зав.

2 т.о. — Савченко Е.П.

Как избежать кишечных инфекций и пищевых отравлений? — Baltic Medical Centre

Лето — самое красивое время года. Летом хочется подольше наслаждаться долгожданным солнцем, теплом, живительными брызгами воды. Но не только мы любим тепло, его любят и возбудители заразных болезней. Поэтому в теплое время года возрастает заболеваемость бактериальными кишечными болезнями. Где кроется опасность и как ее избежать? На эту тему мы беседуем с Аллой Рагаускене, терапевтом медицинского центра Baltic Medical Centre.

Кто является возбудителем кишечных и пищевых инфекций?

Кишечные инфекции, распространяющиеся через пищевые продукты, вызывают содержащиеся в них микроорганизмы. Размножившись до нужной концентрации, они могут вызвать заболевание и стать угрозой нашему здоровью.

Как правило, содержащиеся в пище опасны для здоровья. Но в пище могут быть и амёбы, простейшие, паразиты и вирусы.

Как бактерии и токсины попадают в пищу, а потом вместе с пищей и в наш организм?

Бактерии могут попасть в пищу на любом этапе ее выращивания, хранения и приготовления.

Безопасное хранение продуктов является очень актуальной темой. Если температура окружающей среды выше 10 градусов, то это может способствовать быстрому размножению болезнетворных бактерий в пищевых продуктах. Лето — наиболее благоприятное время для распространения кишечных заболеваний, т.к. тепло является одним из главных условий для размножения болезнетворных микробов. Чем сильнее жара, тем пища быстрее портится. Некоторые размножающиеся в пище бактерии производят токсин, который также является причиной пищевого отравления. Необходимо хранить продукты питания в холодильнике. Если, к примеру, мы оставим кастрюлю с супом на плите на ночь, то на следующей день он будет кишеть бактериями. Еще одна острая проблема — разморозка продуктов. Замороженные продукты можно размораживать только в холодильнике или в микроволновке в специальном режиме, но ни в коем случае не при комнатной температуре. Размороженные продукты должны пройти тепловую обработку в течение двух часов.

Часто во время путешествий или на природе пища хранится и готовится при несоблюдении гигиенических требований. Особенно частой причиной пищевого отравления является употребление в пищу скоропортящихся продуктов и блюд (салата, салата с майонезом, мяса горячего копчения, рыбы, колбасы, молочных продуктов, продуктов с кремом и т.д.), и прежде всего в случаях, когда такая пища находилась на хранении в условиях окружающей среды при 20°C и выше. Чем дольше пищевые продукты хранятся в непригодных для этого условиях, тем больше вероятность отравления.

Летом учащаются случаи группового отравления той же самой небезопасной пищей. Наиболее частой причиной таких отравлений является употребление куриного жаркого, приготовленного на углях, а также заранее приготовленная пища, прошедшая ненадлежащую тепловую или иную обработку в домашних условиях, в кафе, в ресторанах на свадьбах или на других праздниках.

Причиной заражения патогенными микроорганизмами может стать и проглоченная вода из открытых водных источников.

Какие симптомы являются характерными признаками таких инфекций?

Инкубационный период кишечных инфекций и пищевых отравлений (т.е. период от заражения до появления первых симптомов заболевания) длится от нескольких часов до нескольких суток. Заболевание проявляется в виде головных болей, лихорадочного состояния, ломотой в костях, т.е. в виде симптомов, похожих на вирусное заболевание. Позднее оно проявляется в виде сильной рвоты и поноса.

Как лечиться при таком заболевании?

Если больной может пить, то нужно пить много жидкости. Если больного рвет, можно дать ему кусочек льда подержать во рту. Если человек чувствует себя неплохо, то можно лечиться дома с использованием аптечных лекарств — пробиотиков, препаратов, задерживающих жидкость. Часто у людей, у которых нет других проблем со здоровьем, признаки кишечной инфекции проходят через несколько дней.

В каком случае нужно обратиться к врачу?

При наличии следующих симптомов нужно забеспокоиться и обратиться к врачу: температура тела выше 38°C, понос с кровью, частая и обильная рвота и понос, наличие опасных признаков обезвоживания (сухости во рту, пониженного объема мочи, головокружения), болезнь длится больше 3 дней.

Как снизить риск заболевания?

Одним из основных профилактических мер, снижающих риск распространения кишечных инфекций и пищевых отравлений, является гигиена рук. Мытьё рук с мылом помогает устранить около 95% болезнетворных бактерий и вирусов. Необходимо тщательно вымыть руки с мылом после посещения туалета, перед едой, перед началом и во время приготовления пищи. Очень важно часто и тщательно мыть руки младенцам и маленьким детям.

Для того, чтобы избежать заразных кишечных заболеваний во время отдыха на природе, очень важно оценить сколько и каких продуктов питания необходимо взять с собой, особенно в случае отсутствия холодильника и питьевой воды в месте, куда вы отправляетесь. Нужно выбирать не скоропортящиеся продукты питания — мясные изделия холодного копчения, сушки, печенье без кремовой начинки, конденсированное молоко или молоко, прошедшее обработку при очень высокой температуре, фрукты, овощи. Озерная или речная вода совершенно не подходит для мытья фруктов и овощей. Используйте только чистую питьевую воду для мытья продуктов и посуды. Тем более, нельзя употреблять в пищу немытые фрукты или овощи. Важно обеспечить защиту продуктам питания от мух и грызунов. Во время купания в море, озере или в речке необходимо избегать попадания воды в рот.

Не покупайте продукты питания в тех местах, где отсутствуют условия безопасного хранения пищевых продуктов, старайтесь не покупать для закуски пирожки, продаваемые на пляжах. В зарубежных странах употребляйте только качественную воду и продукты питания, избегайте неизвестных продуктов. Обращайте внимание на срок годности продуктов перед их употреблением.

Инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита: систематический обзор

BMC Infect Dis. 2013; 13: 446.

, ¹, ², ¹, ², ³, ⁴ и ²

Рейчел М. Ли

¹ Департамент международного здравоохранения, Джонс Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA

Justin Lessler

² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

Rose A Lee

¹ Department of International Health, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA

Kara E Rudolph

² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США

Николас Г. Райх

³ Отдел биостатистики и эпидемиологии , Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

Trish M Perl

⁴ Depar Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

Дерек А.Т. Каммингс

² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

¹ Департамент Международного здравоохранения, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США

³ Отдел биостатистики и эпидемиологии Школы общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США

⁴ Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США

Автор, отвечающий за переписку.

Поступило 06 марта 2013 г .; Принято 12 сентября 2013 г.

Copyright © 2013 Lee et al .; лицензиат BioMed Central Ltd. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальная работа процитирована должным образом. Эта статья цитировалась в других статьях в PMC.

Дополнительные материалы

Дополнительный файл 1 Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.

GUID: E778F8C8-667E-4C91-903D-7B3CCDE5DCA8

Резюме

Предпосылки

Точное знание инкубационного периода важно для исследования и контроля инфекционных заболеваний и их передачи, однако сведения об инкубационном периоде в литературе остаются часто не цитируются, противоречивы и / или не основаны на доказательствах.

Методы

При систематическом обзоре литературы по пяти кишечным вирусам, имеющим значение для общественного здравоохранения, мы нашли 256 статей с оценками инкубационного периода, в том числе 33 с данными для объединенного анализа.

Результаты

Мы подобрали логарифмически нормальное распределение для объединенных данных и обнаружили, что средний инкубационный период составляет 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) для астровируса, 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) для норовируса. геногрупп I и II, 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) для саповирусов и 2,0 дня (95% ДИ 1,4–2,4 дня) для ротавируса.

Выводы

Наши оценки объединяют опубликованные данные и предоставляют достаточные количественные данные, позволяющие использовать эти оценки в широком спектре клинических приложений и приложений для моделирования.Это может привести к улучшению мер профилактики и контроля в условиях передачи или риска передачи.

Ключевые слова: Инкубационный период, норовирус, ротавирус, калицивирусы, астровирус, систематический обзор

Предпосылки

Острый вирусный гастроэнтерит является важной и часто недооцениваемой причиной заболеваемости и смертности во всем мире. Почти все дети перенесли хотя бы одну ротавирусную инфекцию к пяти годам. Ежегодно на ротавирус приходится около двух миллионов госпитализаций и от 350 000 до 600 000 случаев смерти детей младшего возраста [1].Несколько исследований показали, что астровирус является важной причиной острого гастроэнтерита у детей раннего возраста; исследование распространенности в Соединенном Королевстве показало, что более 70% пятилетних детей имеют антитела к вирусу [2-6]. Астровирус также упоминается как важная причина гастроэнтерита у пожилых людей [7,8]. Калицивирусы, в частности норовирусы, являются наиболее важной причиной эпидемических небактериальных гастроэнтеритов во всем мире, поражают как взрослых, так и детей и составляют от 40 до 50% всех гастроэнтеритов пищевого происхождения в США [9,10].

Астровирус, ротавирус и калицивирусы являются важными причинами инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и вспышек заболеваний в медицинских учреждениях [11]. Инкубационный период (время между заражением и появлением симптомов) важен для точного наблюдения за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, и реализации эффективных мер борьбы со вспышками (например, когортирование и / или карантин). [12] Инкубационный период часто используется для определения заражающего воздействия во время вспышек болезней пищевого происхождения [13,14] и может помочь в диагностике, когда лабораторные ресурсы недоступны.Критерии Каплана были разработаны и часто используются для определения того, была ли вспышка вызвана норовирусом; инкубационный период — один из ключевых элементов этих критериев. [15] Другие применения точно описанного инкубационного периода включают в себя прогностические модели, которые используют инкубационный период для точного моделирования процесса заболевания, а продолжительность инкубационного периода по отношению к латентному периоду (время между заражением и переходом в инфекцию) определяет потенциальная эффективность мер контроля, нацеленных на лиц с симптомами [16].

Несмотря на важность, периоды инкубации кишечных вирусов недостаточно хорошо описаны в медицинской литературе. Информация об инкубационном периоде, как правило, состоит из одного числа («Инкубационный период ротавирусной болезни составляет приблизительно 2 дня» [17]) или плохо определенного диапазона («Инкубационный период для астровирусной болезни составляет от 1 до 5 дней…» [ 18]). Эти утверждения инкубационного периода трудно воплотить в реалии профилактики и контроля. Оценка с одним числом может представлять собой среднее значение, медианное значение, верхний предел или какой-либо другой показатель инкубационного периода.Диапазон может представлять собой исчерпывающий диапазон всех наблюдений или некоторый неопределенный квантиль (например, 95% доверительный интервал, внутренний 75% и т. Д.). Кроме того, часто неясна сила доказательств, лежащих в основе этих оценок. Заявления об инкубационном периоде часто не включают цитату, а когда цитируется, следование цепочке цитирований часто показывает, что оценка основана на ограниченных доказательствах [19].

Мы проанализировали литературу по пяти кишечным вирусам, отобранным с учетом их важности для общественного здравоохранения: астровирусу, калицивирусам (геногруппы норовирусов I и II и саповирусы) и ротавирусу.Посредством систематического обзора и анализа опубликованных оценок и данных мы стремимся (1) зафиксировать консенсус в медицинской литературе по этим инкубационным периодам, (2) охарактеризовать доказательства, лежащие в основе этого консенсуса, и (3) предоставить улучшенные оценки инкубационных периодов для эти инфекции. Поступая таким образом, мы надеемся, что инкубационный период будет использоваться в большем количестве приложений и выявить те области, в которых необходимы дополнительные исследования.

Методы

В этом систематическом обзоре в основном использовались методы, описанные в Lessler et al., 2009 [20]. Подробности и различия в подходах описаны ниже.

Стратегия поиска и критерии выбора

Для каждого вируса мы провели поиск в PubMed, Google Scholar и ISI Web of Knowledge 4.0, как описано Lessler et al., 2009 [20]. В PubMed мы искали слова «инкубация», «период» и название вируса, в Google Scholar мы искали фразы «инкубационный период [название вируса]» и «инкубационный период для [название вируса]», а также ISI Web of Knowledge мы искали по «инкубационному периоду» и названию вируса [20].Поиски проводились в период с 20 января 2011 г. по 16 августа 2011 г., без ограничений по самой ранней дате возврата статей. Общие варианты названия каждого вируса использовались в каждой базе данных, в частности, «астровирус», «калицивирус», «норовирус», «вирус Норо», «Норуолк», «Норуолк-подобный», «NLV», «NLV», «SRSV». »,« Зимняя рвота »,« Hyperemesis hiemis »,« Снежная гора »,« саповирус »,« вирус Саппоро »,« Саппороподобный вирус »,« ротавирус »,« дуовирус »,« агент, подобный реовирусу человека », и «агент инфантильного гастроэнтерита».Мы также рассмотрели четыре широко используемых справочника по инфекционным заболеваниям [11,21-23]. Тезисы рецензировались двумя рецензентами независимо друг от друга. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса. Этот обзор соответствует контрольным спискам систематических обзоров PRISMA и QUORUM.

Оценка

Документы, включенные в полнотекстовый обзор, были классифицированы как содержащие (1) оценку инкубационного периода, основанную на исходных данных и / или анализе, (2) отчет об инкубационном периоде (т. Е. Предоставленную цитату), (3) ) отчет об инкубационном периоде без источника (т.д., без ссылки) или (4) без указания инкубационного периода. Все документы были также проверены на предмет данных индивидуального уровня, пригодных для объединенного анализа. Полные тексты рецензировались независимо двумя рецензентами. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса.

Абстракция данных

Отчеты инкубационного периода и данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа, были извлечены, как описано в Lessler et al., 2009 [20]. Поскольку во многих вспышках болезней пищевого происхождения, описанных в литературе, не сообщалось о точном времени приема пищи, мы установили стандартные интервалы воздействия, которые использовались при абстрагировании данных на индивидуальном уровне для исследований, в которых время приема пищи было указано как просто «завтрак», «обед» или «обед».Воздействие во время завтрака считалось периодом между 0:00 и 10:00, обедом между 10:00 и 14:00 и ужином между 14:00 и 0:00. Мы сообщаем диапазон инкубационных периодов таким образом, чтобы инкубационный период в этом диапазоне соответствовал прогнозам большинства исследователей (т.е.согласовался с более чем 50% опубликованных оценок) и модальным утверждением центральной тенденции.

Объединенный анализ

Сартвелл и другие показали, что натуральный логарифм инкубационных периодов острых инфекционных заболеваний имеет тенденцию к нормальному распределению; следовательно, инкубационный период следует логарифмически нормальному распределению, определяемому средним инкубационным периодом и коэффициентом дисперсии [20,24-26].При нормальном распределении примерно две трети данных попадают в одно стандартное отклонение от среднего; аналогично при логнормальном распределении примерно в двух третях случаев развиваются симптомы между медианной / дисперсией и медианной × дисперсией. Для каждого патогена все наблюдения были объединены в единый набор двухинтервальных цензурированных наблюдений; каждая точка данных содержала диапазон возможных времен воздействия, например «обед», и диапазон возможных времен появления симптомов.Поскольку время воздействия и появления симптомов редко сообщается точно, минимальный временной интервал, который мы рассмотрели, составлял один час. Если сообщалось, что время появления симптома составляет 17:00, мы записывали время появления симптома между 17:00 и 18:00. Оценки максимального правдоподобия были получены с использованием пакета coarseDataTools для R [25,27]. Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций). Объединенные данные для каждой геногруппы норовирусов были проанализированы индивидуально, данные из геногрупп I и II были проанализированы вместе, и, наконец, все данные о калицивирусах человека (как геногруппы норовирусов, так и саповирусы) были объединены и проанализированы.Для выбора подходящих групп использовались байесовский информационный критерий и оценка клинически значимых различий в оценках. Результаты инкубационного периода, полученные с использованием логнормального распределения, сравнивались с результатами, полученными с использованием распределений Вейбулла и гамма-распределения; квантильные оценки оказались согласованными между распределениями (см. дополнительный файл 1). Все анализы были выполнены с использованием статистического пакета R (версия 2.11). Конкретные оценки, содержащиеся в этом обзоре, все данные, использованные в объединенном анализе, и полная библиография доступны у авторов по запросу.В помощь разработчикам моделей результаты подгонки данных с использованием распределения Эрланга доступны в дополнительных материалах (Дополнительный файл 1).

Результаты

Мы идентифицировали 256 статей с одним или несколькими заявлениями об инкубационном периоде (рисунок). Из 317 оценок, включенных в эти статьи, 91 (29%) были оригинальными, 137 (43%) давали источник, а 89 (28%) не предоставляли источник (таблица). 33 статьи содержали данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа (таблица). Шесть (18%) исследований были экспериментальными, а 27 (82%) — наблюдательными.В таблице приведены инкубационные периоды, указанные в литературе, и исходные данные. Оценки инкубационного периода норовирусов получили наибольшую поддержку (23 исследования). Оценка саповирусов была подтверждена меньшим количеством исследований, но эти исследования были относительно большими. Для ротавируса и астровируса было доступно менее 20 наблюдений. Оценки полного распределения каждого инкубационного периода с использованием объединенных данных показаны на рисунке и в таблице. Это обеспечивает периоды, когда 5%, 25%, 50%, 75% и 95% случаев станут симптоматическими.Мы показываем только 5-й и 95-й процентили, когда было более 20 наблюдений для отдельного вируса. Медиана инкубационного периода варьировала от 1,1 дня (для норовирусов I геногруппы) до 4,5 дня (для астровируса). Разброс от 1,22 до 1,82. Полные распределения, наложенные на гистограммы данных латентного периода, показаны на рисунке.

Процесс систематического обзора.

Таблица 1

Сводка оценок инкубационного периода в опубликованной литературе

9017
Исходные оценки
33 Саповирус33
62 89 (28%)

	*Литературные оценки (дни)**		Количество оценок (%)			Участники экспериментальных исследований (n ) ^ψ
	Диапазон	Central Tendency	Оценки без источника	Оценки из источников	Исходные оценки	Участники экспериментальных исследований (n ) ^ψ	1-5	3	8 (40%)	7 (35%)	5 (25%) [1/4]	1
Калицивирусы
Норовирус	1-2	1	39 (22%)	74 (43%)	60 (35%) [15/45]	189
Геногруппы I и II	1-2	1	39 (22%)	74 (43%)	60 (35%) [15/45]	189

2	5 (36%)	2 (14%)	7 (50%) [0/7]	—
Ротавирус
1-4	2	37 (34%)	54 (49%)	19 (17%) [6/13]	42
Всего	—	—	137 (43%)	91 (29%) [22/69]	232

Таблица 2

Исследования, включенные в объединенный анализ

	Местоположение	Тип исследования	N	Население ion	Комментарии
Астровирус
Kurtz et al.(1979) [28]	UK	Экспериментальный	4	Взрослые добровольцы в возрасте 18–50 лет	—
Midthun et al. (1993) [29]	USA	Экспериментальный	1	Взрослый доброволец	—
Mitchell et al. (1993) [30]	США	Наблюдательные	5	Дети в возрасте 6–30 месяцев	Вспышка в дневном стационаре
Калицивирусы 2 Норовирус
Геногруппа I
Baron et al.(1982) [31]	США	Наблюдательный	132	Взрослые и дети в возрасте от 9 месяцев до 59 лет	Вспышка, связанная с купанием в озере
Becker et al. (2000) [32]	США	Наблюдательный	54	Мужчины, футболисты колледжа	Вспышка, связанная с упакованными ланчами
Dolin et al.(1971) [33]	США	Экспериментальный	5	Заключенные-мужчины в возрасте 18–45 лет	—
Gill et al. (1983) [34]	UK	Наблюдательный	127	Взрослые	Вспышка, связанная с потреблением сырых устриц
Hicks et al. (1996) [35]	UK	Observational	31	Гости на свадебном приеме	—
Hoebe et al.(2004) [36]	Нидерланды	Наблюдательный	90	Дети в возрасте 4–12 лет	Вспышка, связанная с игрой в зараженном фонтане
Курицкий и др. (1984) [37]	США	Наблюдательный	126	Взрослые и дети, посещающие любое из четырех общественных мероприятий с питанием	Вспышка, связанная с употреблением в пищу замороженных хлебобулочных изделий, приготовленных плохим кулинаром	Linco et al.(1980) [38]	Австралия	Наблюдательный	24	Гости на рождественском ужине	Вспышка, связанная с употреблением сырых устриц
Matsuhashi et al. (2003) [39]	Япония	Наблюдательный	1	Взрослый врач-мужчина	Заболевание, связанное с выполнением колоноскопии у двух инфицированных лиц
MMWR 9016 (2000) [2000]	USA	Observational	209	Взрослые	Oubreak, связанный с поеданием картофельного салата на корпоративном обеде
Taylor et al.(1981) [41]	США	Наблюдательный	329	Дети в возрасте 5-12 лет	Вспышка, связанная с зараженной питьевой водой в начальной школе
	02 Норовирус
Genogroup II
de Wit et al. (2007) [42]	Нидерланды	Наблюдательный	229	Мужчины и женщины в возрасте 17–63 лет	Вспышка, связанная с обедом для персонала
Dolin et al.(1982) [43]	США	Экспериментальный	9	Взрослые добровольцы	—
Gaulin et al. (1999) [44]	Канада	Observational	43	Посетители, посещающие рождественский ужин в ресторане	—
Gotz et al. (2002) [45]	Швеция	Наблюдательный	173	114 детей в возрасте 1–10 лет и 79 взрослых в возрасте 20–61 лет	Вспышка, связанная с обслуживанием обедов в 30 детских садах
Grotto et al.(2004) [13]	Израиль	Наблюдательный	162	Солдаты мужского и женского пола, дислоцированные на военной базе	Вспышка, связанная с салатом из столовой
Hirakata et al. (2005) [46]	Япония	Наблюдательный	628	Учащиеся начальной, младшей и старшей школы	Мексиканский агент. Вспышка, связанная с обедом в ресторане во время экскурсии
Исакбаева и др.(2005) [47]	США	Наблюдательный	2	Взрослая женщина и ребенок	Вспышка, связанная с контактом с больным ребенком во время двухчасовой игровой группы
Kirking et al. (2010) [48]	США	Наблюдательный	7	Взрослые и дети в возрасте 11–73 лет	Вспышка, связанная с воздействием рвотных масс в виде аэрозолей в самолете
.(2000) [49]	UK	Observational	43	Посетители обедают в большом отеле	—
Marshall et al. (2001) [50]	Австралия	Наблюдательный	46	Посетители ресторана	Вспышка, связанная с употреблением зараженной пищи в буфете
Thornhill et al. (1977) [51]	США	Экспериментальный	1	Взрослый доброволец	Гавайский агент
Труман и др.(1987) [52]	США	Наблюдательный	84	Взрослые мужчины и женщины в возрасте 16–74 лет	Вспышка, связанная с поеданием моллюсков на организованном мероприятии
Sapovirus
Хамфри и др. (1984) [53]	UK	Observational	14	Один ребенок в возрасте 3 лет, девять мужчин и женщин в возрасте 65–95 лет, 5 взрослых мужчин и женщин в возрасте 18–65 лет	Вспышка в учреждении по уходу за престарелыми и в семье, которая владела учреждением
Johansson et al.(2005) [54]	Швеция	Наблюдательный	9	Взрослые мужчины и женщины в возрасте 25–84 лет	Инфекция в больницах
Usuku et al. (2008) [55]	Япония	Наблюдательный	65	Шестьдесят учеников третьего класса и пять взрослых	Вспышка, связанная с рестораном в отеле
Yamashita et al.(2010) [56]	Япония	Наблюдательный	18	Взрослые мужчины и женщины в возрасте 20–70 лет	Вспышка после свадебного приема
							Ротавирус	Капикян и др. (1983) [57]	США	Экспериментальный	4	Взрослые добровольцы	—
Morris et al.(1975) [58]	UK	Наблюдательный	1	Детский	Инфекция в больницах		Ротавирус
Rodriguez et al. (1979) [59]	USA	Observational	6	Две взрослые женщины и 4 ребенка в возрасте 18–24 месяцев	Вспышка после игровой группы

Кумулятивное распределение инкубационного периода. Показан совокупный процент случаев, в которых симптомы развиваются к определенному дню согласно оценкам логнормального распределения.Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций).

Таблица 3

Процентили времени появления симптомов и дисперсии для распределения заболеваний

751-1 9326

	Оценка (95 % ДИ) времени появления симптомов (дни) 24 * 901					Дисперсия (95 % ДИ)
	5-й процентиль	25-й процентиль	50-й процентиль121 9011			Дисперсия (95 % ДИ)
Астровирус	—	4.0 (3,5-4,9)	4,5 (3,9-5,2)	5,3 (4,4-5,8)	—	1,22 (1,04-1,30)
Калицивирусы							^**	0,5 (0,5-0,5)	0,9 (0,8-0,9)	1,2 (1,1-1,2)	1,7 (1,6-1,7)	2,6 (2,6- 2,8)	1,64 (1,61-1,71)
Геногруппа I ^α	0.4 (0,4-0,5)	0,8 (0,7-0,8)	1,1 (1,1-1,2)	1,6 (1,6-1,7)	3,0 (2,8-3,2)	1,82 (1,75-1,90 )
Genogroup II ^β	0,6 (0,5-0,6)	0,9 (0,9-1,0)	1,2 (1,2-1,3)	1,6 (1,6 )	2,5 (2,4-2,6)	1,56 (1,49-1,62)
Саповирусы ^***	0.9 (0,7-1,0)	1,3 (1,1-1,4)	1,7 (1,5-1,8)	2,3 (2,0-2,4)	3,3 (2,7-3,8)	1,48 (1,36-1,61 )
Ротавирус	—	1,6 (1,1-1,9)	2,0 (1,4-2,4)	2,5 (1,8-3,0)	—	1,37 (1,25-1,73)

Кумулятивные распределения данных инкубационного периода и латентного периода.
Астровирус
Астровирус передается фекально-оральным путем [22].Клинические симптомы включают диарею, боль в животе, головную боль, недомогание и рвоту, хотя рвота при астровирусной инфекции встречается реже, чем при ротавирусной или калицивирусной инфекциях [11,22]. Кроме того, астровирус с меньшей вероятностью вызывает обезвоживание или госпитализацию, чем ротавирус [2].
Мы нашли 20 оценок инкубационного периода астровируса, включая пять исходных оценок, семь оценок с источниками и восемь оценок, для которых исходный источник не был предоставлен (оценки без источников).Заявления об инкубационном периоде обычно составляли от 1 до 5 дней (таблица). Было обнаружено три оригинальных исследования, содержащих данные, подходящие для объединенного анализа: два экспериментальных исследования с участием взрослых добровольцев [28,29] и обсервационное исследование, описывающее серию вспышек в детском центре в Хьюстоне, штат Техас, США [30]. На основе этих трех исследований мы оцениваем средний инкубационный период гастроэнтерита, вызванного астровирусом, в 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) с разбросом 1,22 (95% ДИ 1.04-1.30) (таблица). В 25% случаев симптомы проявляются через 4,0 дня (95% ДИ 3,5–4,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 5,3 дня (95% ДИ 4,4–5,8 дней) (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались. Немногие взрослые добровольцы проявляли симптомы при заражении астровирусом [28,30], что свидетельствует о низкой патогенности вируса у взрослых, которые могут быть защищены антителами, приобретенными в детстве [4,60]. Поскольку данные исследований взрослого заражения включают 50% абстрагируемых данных, подходящих для объединенного анализа на астровирус, наши результаты инкубационного периода могут быть неприменимы к первичным инфекциям или инфекциям у детей.
Калицивирусы
Калицивирусы (т. Е. Семейство Caliciviridae ) классически содержат четыре рода, два из которых, норовирус и саповирус , вызывают острый гастроэнтерит у людей [11]. Было предложено, что пятый род калицивирусов включает два генотипа кишечного вируса крупного рогатого скота [61]. Норовирусы разделены на пять антигенно различных геногрупп, три из которых (I, II и IV) вызывают заболевания у людей [62,63]. Норовирусы геногруппы IV были охарактеризованы в сточных водах и речной воде, но, насколько нам известно, не были причастны к вспышкам заболеваний, поэтому в данном обзоре основное внимание будет уделено норовирусам и саповирусам геногрупп I и II [64,65].Важно отметить, что недавние вспышки этих вирусов связаны с увеличением заболеваемости и смертности. Норовирусы и саповирусы передаются фекально-оральным путем и имеют несколько разные клинические проявления [11].
Используя байесовский информационный критерий, мы определили, что все три геногруппы калицивируса человека статистически различаются с точки зрения распределения их инкубационного периода. Однако оценки инкубационных периодов, эпидемиологии и клинических проявлений калицивирусов геногрупп I и II для практических целей очень похожи [43,66].Мы предлагаем рассматривать эти две геногруппы, норовирусы, с одинаковым инкубационным периодом. Саповирусы имеют отличную эпидемиологию и клинические проявления от норовирусов геногрупп I и II, и их следует рассматривать как отдельную группу вирусов.
Норовирусы (геногруппы I и II)
Норовирусы вызывают примерно 90% всех вспышек эпидемического гастроэнтерита и являются важным источником вспышек болезней пищевого происхождения во всем мире [9,10,22]. Хотя передача происходит в основном фекально-оральным путем, имеются также свидетельства передачи через рвотные массы [48].Клинические симптомы включают спазмы в животе, тошноту, частую рвоту и диарею [22]. Большинство опубликованных оценок норовирусов соответствовало инкубационному периоду от 1 до 2 дней (таблица).
Выявлен 131 документ с указанием инкубационного периода норовирусов. Эти документы содержали 60 исходных оценок, 74 оценки из источников и 39 оценок без источников. 54% всех полученных оценок инкубационного периода норовирусов цитировали одну из двух статей Kaplan et al.[15,67], или сослался на статью, в которой цитируется одна или обе эти статьи. Каплан и его коллеги объединили данные 38 вспышек норовируса в период с 1967 по 1980 год и предложили четыре критерия, которые можно использовать для характеристики вспышек норовируса: (1) посев кала, свободный от бактериальных патогенов, (2) средняя или средняя продолжительность болезни 12–60 часов, (3) рвота в ≥ 50% случаев и (4) средний или средний инкубационный период 24–48 часов [67]. Большинство опубликованных оценок инкубационного периода норовирусов соответствовали критериям Каплана (таблица).
На основании 2540 наблюдений из 20 обсервационных исследований и 15 наблюдений из трех экспериментальных исследований, мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов в 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) с дисперсией 1,64 (95% ДИ 1,61- 1.71). В 5% случаев норовируса симптомы проявляются через 0,5 дня (95% ДИ 0,5–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы становятся симптоматическими через 2,6 дня (95% ДИ 2,6–2,8 дня) (таблица).
Геногруппа I
На основании 1123 наблюдений из десяти наблюдательных исследований и пяти наблюдений из одного экспериментального исследования [33] мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы I как 1.1 день (95% ДИ 1,1–1,2 дня) с дисперсией 1,82 (95% ДИ 1,75–1,90). В 5% случаев норовируса геногруппы I симптомы проявляются через 0,4 дня (95% ДИ 0,4–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы разовьются через 3,0 дня (95% ДИ 2,8–3,2 дня) (таблица).
Геногруппа II
Основываясь на десяти наблюдениях из двух экспериментальных исследований [43,51] и 1417 оценках из десяти обсервационных исследований [46,49], мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы II как 1.2 дня (95% ДИ 1,2–1,3 дня) с дисперсией 1,56 (95% ДИ 1,49–1,62). В 5% случаев норовируса геногруппы II симптомы проявляются через 0,6 дня (95% ДИ 0,5–0,6 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 2,4–2,6 дня) (таблица).
Саповирусы
Саповирусы в первую очередь вызывают гастроэнтерит у младенцев и детей и не являются важными патогенами при вспышках болезней пищевого происхождения [68]. Клинические симптомы включают рвоту, обезвоживание, боль в животе и, в меньшей степени, диарею и лихорадку [69].Опубликованные оценки саповирусов соответствовали инкубационному периоду 1-3 дня (таблица).
Выявлено 13 документов, содержащих 14 отчетов об инкубационном периоде саповирусов. Эти документы содержали семь исходных оценок, две оценки из источников и пять оценок без источников. Цитируемыми источниками были обзорная статья Блэклоу и Гринберга [70], в которой содержалась оценка без источника, и результаты наблюдательного исследования Ноэля и его коллег [71], описывающие вспышку штамма вируса Парквилл.
Основываясь на 106 наблюдениях из четырех обсервационных исследований [53-56], мы оцениваем средний инкубационный период саповирусов в 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) с дисперсией 1,48 (95% ДИ 1,36–1,61) . В 5% случаев симптомы проявляются через 0,9 дня (95% ДИ 0,7–1,0 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 3,3 дня (95% ДИ 2,7–3,8 дня) (таблица).
Ротавирус
Ротавирус передается фекально-оральным путем [22,72]. Ротавирус группы А вызывает более 600 000 случаев смерти младенцев и детей младшего возраста в год, в основном в развивающихся странах [73].Ротавирусы группы B преимущественно наблюдались во взрывных вспышках среди взрослых в Китае [11,74]. Ротавирусы группы C, по-видимому, не имеют значения для общественного здравоохранения [11,74]. Распространенность серотипов ротавирусов в этих группах варьируется в разных частях мира, что чрезвычайно затрудняет широкомасштабную эффективную борьбу с заболеванием [75]. Клинические симптомы включают лихорадку и рвоту, за которыми следует обильная водянистая диарея и обезвоживание [76]. Инфекции, вызывающие острое заболевание, возникают преимущественно в возрасте от 6 до 24 месяцев [76,77].У взрослых инфекции обычно протекают бессимптомно, однако заболевание было вызвано экспериментально у взрослых и описаны вспышки среди взрослого населения [11,57,78,79].
Мы нашли 110 оценок инкубационного периода ротавируса, включая 19 исходных оценок, 54 оценки с источниками и 37 оценок без источников. Большинство опубликованных оценок ротавируса соответствовали двухдневному инкубационному периоду (таблица).
Основываясь на четырех наблюдениях из одного экспериментального исследования на взрослых добровольцах [57] и шести наблюдениях из двух наблюдательных исследований [58,59], мы оцениваем средний инкубационный период ротавируса как 2.0 дней (95% ДИ 1,4–2,4 дня) с дисперсией 1,37 (1,25–1,73). В 25% случаев ротавирус становится симптоматическим через 1,6 дня (95% ДИ 1,1–1,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 1,8–3,0 дня) после заражения (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались.
Обсуждение
Оценка инкубационного периода инфекционных заболеваний, включая гастроэнтерит, имеет решающее значение для обоснования и обоснованности вмешательств, направленных на прерывание текущей передачи.В нашем обзоре трех основных вирусных причин гастроэнтерита мы обнаружили, что 61% из 226 оценок инкубационного периода даны со ссылкой. После изучения деревьев цитирования для этих оценок только 114 (50%) из 226 были фактически основаны на данных. Двадцать три (17%) оценок, полученных из источников, процитировали статью, которая содержала оценку без источников. Эти данные показывают, что инкубационные периоды кишечных вирусов часто считаются общеизвестными. Из источников, основанных на данных, большинство для каждого вируса можно проследить до оценок из небольшого числа оригинальных исследований, таких как Kaplan et al.статьи для геногрупп I и II норовирусов [15,67].
Были некоторые опасения, что отдельные исследования потенциально могут иметь чрезмерное влияние на объединенный анализ. Мы провели анализ чувствительности, удалив все исследования и пересчитав оценки инкубационного периода. Мы не обнаружили качественной разницы в результатах.
Определение инкубационного периода ограничено степенью неопределенности относительно времени заражения. Поскольку инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита короткие, во время вспышки часто бывает трудно различить первичный и вторичный случаи.Это затрудняет получение точной информации об интервале экспозиции. Большинство обсервационных исследований, особенно исследований вспышек пищевого происхождения, решают эту проблему, рассматривая только случаи в течение определенного количества дней после заражения [34,36,37,42,44,52,80-82]. Этот метод выявления случаев может внести систематическую ошибку за счет исключения случаев, попадающих в хвостовую часть распределения инкубационного периода. Несмотря на то, что существует множество наблюдательных исследований, описывающих вспышки, вызванные ротавирусом и астровирусом, поскольку невозможно определить интервал воздействия для отдельных случаев, данные этих исследований не могут использоваться для определения инкубационного периода.
Множество факторов могут привести к тому, что данные экспериментальной инфекции будут отличаться от данных естественной инфекции, например, инфекционная доза или добровольцы, чей статус хозяина отличается от такового в общей популяции. Например, единственное экспериментальное исследование, внесшее данные в объединенный анализ ротавируса, проводилось с поиском добровольцев с низким уровнем антител в сыворотке [57]. Эти предубеждения усугубляются невозможностью проведения экспериментальных исследований проблем среди групп населения, наиболее подверженных риску заболеваний, среди детей и пожилых людей.Это особенно верно в отношении ротавируса и астровируса, болезней, от которых почти всегда страдают маленькие дети.
Этот обзор был ограничен включением только опубликованных данных и условиями поиска. Из-за того, что мы включили некоторую форму «инкубационного периода» в поиск статей, вся литература по каждому вирусу не рассматривалась. Наши оценки для астровируса и ротавируса основаны на трех исследованиях и менее чем 20 наблюдениях. Из-за трудностей экспериментального изучения этих заболеваний необходимы тщательные наблюдательные исследования, чтобы получить больше доказательств, подтверждающих инкубационный период и его распространение.
Точное знание инкубационного периода особенно важно для вирусного гастроэнтерита из-за короткой продолжительности инкубационного периода, относительно высокой частоты вторичных атак и возможности возникновения вспышек заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи. Как ротавирус, так и норовирус особенно трудно контролировать в медицинских учреждениях [11,83]. Фишер и его коллеги определили, что в среднем 27% пациентов в развитых странах и 32% пациентов в развивающихся странах, выписанных с диагнозом ротавирус, заразились этим вирусом в больнице [17].Кроме того, инкубационный период является важным компонентом серийного интервала (разница во времени появления симптомов в случае и в случае инфицирования), который является одним из основных факторов, определяющих скорость распространения эпидемий в популяции.
Несмотря на лицензирование двух безопасных и эффективных вакцин, ротавирус продолжает оставаться важной проблемой общественного здравоохранения. Это особенно верно в развивающихся странах, где происходит подавляющее большинство ротавирусных заболеваний и смертей, и где ротавирусная вакцина имеет самую низкую эффективность [84].Точное знание инкубационного периода важно для понимания динамики ротавирусной болезни и борьбы с ней. По мере того, как охват вакцинацией улучшается и ротавирусная инфекция перестает быть повсеместной, инкубационный период будет полезен для изучения воздействия патогенов, связанного с неэффективностью вакцинации, и потенциальных различий в восприимчивости хозяев к инфекции.
Заключение
Следуя нашей работе по оценке инкубационного периода респираторных вирусов [20], в этом обзоре мы объединили опубликованные данные для оценки инкубационных периодов пяти кишечных вирусов, важных для общественного здравоохранения.Как правило, опубликованные оценки инкубационного периода описывают только центральную тенденцию или указывают на неопределенный диапазон, однако знание распределения всего инкубационного периода важно для полного понимания динамики заболевания и потенциальной эффективности мер контроля. Это особенно верно в условиях, когда инфекции могут быть взрывоопасными и иметь огромное влияние на результаты лечения пациентов. Наши оценки обеспечивают дополнительный уровень детализации, необходимый для этих и других приложений, что делает инкубационный период более полезным для исследований, клинической практики и политики общественного здравоохранения.
Конкурирующие интересы
Авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Вклад авторов
RML провела систематический обзор и анализ данных, а также подготовила рукопись. JL провел анализ данных и помог составить рукопись. RAL и KER провели систематический обзор. JL, DATC, TMP и NGR участвовали в разработке и концепции исследования. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.
Дополнительные материалы
Дополнительный файл 1:
Сравнение логнормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.
Благодарности
Работа JL над этим проектом была профинансирована за счет гранта Фонда Билла и Мелинды Гейтс (Инициатива по моделированию вакцин, 705580–3), и он является лауреатом премии NIH в области развития научных исследований (NIAID, K22). AI0-01). KER финансировался Отделом программ интромуральных исследований Национального института психического здоровья.
Ссылки
Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Заболевания и смертность детей от ротавирусной инфекции в мире.Emerg Infect Dis. 2003. 9: 565–572. DOI: 10.3201 / eid0905.020562. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Деннехи PH, Нельсон С.М., Спангенбергер С., Ноэль Дж. С., Монро С. С., Гласс Р. И.. Проспективное исследование «случай – контроль» роли астровируса в острой диарее среди госпитализированных маленьких детей. J Infect Dis. 2001; 184: 10–15. DOI: 10,1086 / 321007. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Herrmann JE, Taylor DN, Echeverria P, Blacklow NR. Астровирусы как причина гастроэнтерита у детей.N Engl J Med. 1991; 324: 1757–1760. DOI: 10.1056 / NEJM19
03242501. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Курц Дж., Ли Т. Распределение антител по возрасту астровирусного гастроэнтерита. Med Microbiol Immunol. 1978; 166: 227–230. DOI: 10.1007 / BF02121154. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Родригес-Баез Н., О’Брайен Р., Цю С.К., бас-мастер. Астровирус, аденовирус и ротавирус у госпитализированных детей: распространенность и связь с гастроэнтеритом. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002. 35: 64–68.DOI: 10.1097 / 00005176-200207000-00014. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Шастри С., Доан А.М., Гонсалес Дж., Упадхьяюла У., бас-мастер. Распространенность астровирусов в детской больнице. J Clin Microbiol. 1998. 36: 2571–2574. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Lewis DC, Lightfoot NF, Cubitt WD, Wilson SA. Вспышки астровируса типа 1 и ротавирусного гастроэнтерита в гериатрических стационарах. J Hosp Infect. 1989; 14: 9–14. DOI: 10.1016 / 0195-6701 (89)
-X.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Gray JJ, Wreghitt TG, Cubitt WD, Elliot PR. Вспышка гастроэнтерита в доме престарелых, связанная с астровирусом 1 типа и калицивирусом человека. J Med Virol. 1987. 23: 377–381. DOI: 10.1002 / jmv.18410. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Технические данные. http://www.cdc.gov/norovirus/php/illness-outbreaks.html.
Долин Р. Норовирусы — проблемы, которые нужно контролировать. N Engl J Med. 2007; 357: 1072–1073. DOI: 10.1056 / NEJMp078050.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хоули П., Книп Д., Филдс Б. Вирусология Филдса, 5-е изд. Филадельфия: Липпинкотт, Уильямс и Уилкинс; 2007. [Google Scholar]
Lessler J, Brookmeyer R, Perl TM. Оценка правил классификации на основе даты появления симптомов для выявления инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Am J Epidemiol. 2007. 166: 1220–1229. DOI: 10,1093 / AJE / kwm188. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Grotto I, Huerta M, Balicer RD, Halperin T, Cohen D, Orr N, Gdalevich M.Вспышка норовирусного гастроэнтерита на израильской военной базе. Инфекционное заболевание. 2004. 32: 339–343. DOI: 10.1007 / s15010-004-4002-3. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Schmid D, Stuger HP, Lederer I, Pichler AM, Kainz-Arnfelser G, Schreier E, Allerberger F. Вспышка норовируса пищевого происхождения из-за салата, приготовленного вручную, Австрия, 2006 г. Инфекция. 2007. 35: 232–239. DOI: 10.1007 / s15010-007-6327-1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Каплан Дж. Э., Фельдман Р., Кэмпбелл Д. С., Лукабо К., Гэри Г. У.Частота болезни, аналогичной норволкской, во вспышках острого гастроэнтерита. Am J Public Health. 1982; 72: 1329–1332. DOI: 10.2105 / AJPH.72.12.1329. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Фрейзер С., Райли С., Андерсон Р.М., Фергюсон Н.М. Факторы, позволяющие контролировать вспышку инфекционного заболевания. Proc Natl Acad Sci USA. 2004. 101: 6146–6151. DOI: 10.1073 / pnas.0307506101. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Fischer TK, Bresee JS, Glass RI.Ротавирусные вакцины и профилактика госпитальной диареи у детей. Вакцина. 2004; 22 (Приложение 1): S49 – S54. [PubMed] [Google Scholar]
Blacklow NR, Herrmann JE. Астровирусный гастроэнтерит. Trans Am Clin Climatol Assoc. 1995; 106: 58–66. обсуждение 66–58. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Рейх Н.Г., Perl TM, Каммингс Д.А., Лесслер Дж. Визуализация клинических данных: сети цитирования для инкубационных периодов респираторных вирусных инфекций. PLoS One. 2011; 6: e19496.DOI: 10.1371 / journal.pone.0019496. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Lessler J, Reich NG, Brookmeyer R, Perl TM, Nelson KE, Cummings DA. Инкубационные периоды ОРВИ: систематический обзор. Lancet Infect Dis. 2009; 9: 291–300. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (09) 70069-6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хейманн Д. Руководство по борьбе с инфекционными заболеваниями. 19. Вашингтон, округ Колумбия: Американская ассоциация общественного здравоохранения; 2008 г.[Google Scholar]
Манделл Дж., Беннет Дж., Долин Р. Принципы и практика инфекционных заболеваний. Филадельфия: Черчилль Ливингстон; 2005. [Google Scholar]
Пикеринг Л. Красная книга: отчет Комитета по инфекционным болезням за 2009 год. 28. Элк-Гроув-Виллидж, Иллинойс: Американская академия педиатрии; 2009. 225, 241-242, 576-579. [Google Scholar]
Каулинг Б.Дж., Мюллер М.П., Вонг И.О., Хо Л.М., Луи М., МакГир А., Леунг Г.М. Альтернативные методы оценки распределения инкубации: примеры из тяжелого острого респираторного синдрома.Эпидемиология. 2007. 18: 253–259. DOI: 10.1097 / 01.ede.0000254660.07942.fb. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Рейх Н.Г., Лесслер Дж., Каммингс Д.А., Брукмейер Р. Оценка распределения инкубационного периода с помощью грубых данных. Stat Med. 2009. 28: 2769–2784. DOI: 10.1002 / sim.3659. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Sartwell PE. Распределение инкубационных периодов инфекционного заболевания. Am J Hyg. 1950; 51: 310–318. [PubMed] [Google Scholar]
coarseDataTools: набор функций, помогающих анализировать грубо наблюдаемые данные.http://cran.r-project.org/web/packages/coarseDataTools.
Курц Дж. Б., Ли Т. В., Крейг Дж. В., Рид С. Е.. Астровирусная инфекция у добровольцев. J Med Virol. 1979; 3: 221–230. DOI: 10.1002 / jmv.18308. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Midthun K, Greenberg HB, Kurtz JB, Gary GW, Lin FY, Kapikian AZ. Характеристика и сероэпидемиология астровируса типа 5, связанного со вспышкой гастроэнтерита в округе Марин, Калифорния. J Clin Microbiol. 1993; 31: 955–962. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Митчелл Д.К., Ван Р., Морроу А.Л., Монро С.С., Гласс Р.И., Пикеринг Л.К.Вспышки астровирусного гастроэнтерита в детских садах. J Pediatr. 1993; 123: 725–732. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (05) 80846-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Baron RC, Murphy FD, Greenberg HB, Davis CE, Bregman DJ, Gary GW, Hughes JM, Schonberger LB. Желудочно-кишечное заболевание Norwalk: вспышка, связанная с купанием в озере для отдыха, и вторичная передача от человека к человеку. Am J Epidemiol. 1982; 115: 163–172. [PubMed] [Google Scholar]
Becker KM, Moe CL, Southwick KL, MacCormack JN.Передача вируса Norwalk во время футбольного матча. N Engl J Med. 2000; 343: 1223–1227. DOI: 10.1056 / NEJM200010263431704. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Dolin R, Blacklow NR, DuPont H, Formal S, Buscho RF, Kasel JA, Chames RP, Hornick R, Chanock RM. Передача острого инфекционного небактериального гастроэнтерита добровольцам при пероральном приеме фильтрата стула. J Infect Dis. 1971; 123: 307–312. DOI: 10.1093 / infdis / 123.3.307. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Gill ON, Cubitt WD, McSwiggan DA, Watney BM, Bartlett CL.Эпидемия гастроэнтерита, вызванная устрицами, зараженными небольшими вирусами с круглой структурой. Br Med J (Clin Res Ed) 1983; 287: 1532–1534. DOI: 10.1136 / bmj.287.6404.1532. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Hicks NJ, Beynon JH, Bingham P, Soltanpoor N, Green J. Вспышка вирусного гастроэнтерита после свадебного приема. Commun Dis Rep CDR Rev.1996; 6: R136 – R139. [PubMed] [Google Scholar]
Hoebe CJ, Vennema H, de Roda Husman AM, van Duynhoven YT.Вспышка норовируса среди младших школьников, игравших в фонтанчике с водой для отдыха. J Infect Dis. 2004. 189: 699–705. DOI: 10,1086 / 381534. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Курицкий Дж. Н., Остерхольм М. Т., Гринберг Х. Б., Корлат Дж. А., Годес Дж. Р., Хедберг К. В., Форфанг Дж. К., Капикян А.З., Маккалоу Дж. К., Уайт К.Э. Норуолкский гастроэнтерит: вспышка болезни в сообществе, связанная с потреблением хлебобулочных изделий. Ann Intern Med. 1984; 100: 519–521. DOI: 10.7326 / 0003-4819-100-4-519. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Linco SJ, Grohmann GS.Дарвиновская вспышка вирусного гастроэнтерита, связанного с устрицами. Med J Aust. 1980; 1: 211–213. [PubMed] [Google Scholar]
Matshuhashi N, Nishi Y, Nagoshi D., Kanemoto H. A N: Эпидемический энтерколит, возможно, в результате заражения вирусом Норуолк, проявляющегося как ишемический колит . Dig Endosc. 2003. 15: 138–141. DOI: 10.1046 / j.1443-1661.2003.00234.x. [CrossRef] [Google Scholar]
Чендлер Б., Беллер М., Дженкерсон С., Миддо Дж., Робертс С., Рейсдорф Е., Рауш М., Сэвидж Р., Дэвис Дж. Вспышки вирусного гастроэнтерита, похожего на Норуолк — Аляска и Висконсин, 1999.MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2000; 49: 207–211. [PubMed] [Google Scholar]
Тейлор Дж. У., Гэри Г. У. мл., Гринберг HB. Связанный с Норуолком вирусный гастроэнтерит из-за загрязненной питьевой воды. Am J Epidemiol. 1981; 114: 584–592. [PubMed] [Google Scholar]
de Wit MA, Widdowson MA, Vennema H, de Bruin E, Fernandes T, Koopmans M. Крупная вспышка норовируса: пекарь, который должен был знать лучше. J Infect. 2007; 55: 188–193. DOI: 10.1016 / j.jinf.2007.04.005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Dolin R, Reichman RC, Roessner KD, Tralka TS, Schooley RT, Gary W, Morens D.Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии возбудителя острого вирусного гастроэнтерита Снежной горы. J Infect Dis. 1982; 146: 184–189. DOI: 10.1093 / infdis / 146.2.184. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Гаулин С., Фригон М., Пуарье Д., Фурнье С. Передача калицивируса работником еды в предсимптоматической фазе болезни. Epidemiol Infect. 1999; 123: 475–478. DOI: 10.1017 / S095026889^{9X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]}
Gotz H, de Jong B, Lindback J, Parment PA, Hedlund KO, Torven M, Ekdahl K.Эпидемиологическое расследование вспышки пищевого гастроэнтерита, вызванного Норуолк-подобным вирусом, в 30 детских садах. Scand J Infect Dis. 2002; 34: 115–121. DOI: 10.1080 / 00365540110080133. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хираката Ю., Арисава К., Нишио О., Накагоми О. Распространение вспышек гастроэнтерита в нескольких префектурах, вызванных одним штаммом норовируса геногруппы II из туристического ресторана в Нагасаки, Япония. J Clin Microbiol. 2005; 43: 1093–1098. DOI: 10.1128 / JCM.43.3.1093-1098.2005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Исакбаева Е.Т., Буленс С.Н., Борода Р.С., Адамс С., Монро С.С., Чавес С.С., Виддоусон М.А., Гласс Р.И. Норовирус и уход за детьми: проблемы в борьбе со вспышками. Pediatr Infect Dis J. 2005; 24: 561–563. DOI: 10.1097 / 01.inf.0000164764.58715.23. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Киркинг Х.Л., Кортес Дж., Беррер С., Холл А.Дж., Коэн Нью-Джерси, Липман Х., Ким С., Дейли Э.Р., Фишбейн Д.Б. Вероятная передача норовируса в самолете, октябрь 2008 г.Clin Infect Dis. 2010; 50: 1216–1221. DOI: 10,1086 / 651597. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Маркс П.Дж., Випонд И.Б., Карлайл Д., Дикин Д., Фей Р.Э., Кол Е.О. Доказательства воздушно-капельной передачи Норуолк-подобного вируса (NLV) в ресторане отеля. Epidemiol Infect. 2000; 124: 481–487. DOI: 10.1017 / S095026889
05. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Marshall JA, Yuen LK, Catton MG, Gunesekere IC, Wright PJ, Bettelheim KA, Griffith JM, Lightfoot D, Hogg GG, Gregory J.и др. Множественные вспышки норволкского вирусного гастроэнтерита, связанные с рестораном в средиземноморском стиле. J Med Microbiol. 2001; 50: 143–151. [PubMed] [Google Scholar]
Торнхилл Т.С., Вятт Р.Г., Калица А.Р., Долин Р., Чанок Р.М., Капикян А.З. Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии вирусоподобных частиц размером 26–27 нм, связанных с двумя семейными вспышками гастроэнтерита. J Infect Dis. 1977; 135: 20–27. DOI: 10.1093 / infdis / 135.1.20. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Трумэн Б.И., Мадоре Х.П., Менегус М.А., Ницкин Д.Л., Долин Р.Снежная гора возбудитель гастроэнтерита от моллюсков. Am J Epidemiol. 1987; 126: 516–525. [PubMed] [Google Scholar]
Хамфри Т.Дж., Крукшанк Дж. Г., Кубитт В. Д.. Вспышка гастроэнтерита, ассоциированного с калицивирусами, в доме престарелых. Возможный зооноз? Дж. Хиг (Лондон) 1984; 93: 293–299. DOI: 10.1017 / S0022172400064822. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Johansson PJ, Bergentoft K, Larsson PA, Magnusson G, Widell A, Thorhagen M, Hedlund KO. Вспышка гастроэнтерита у взрослых, связанная с внутрибольничными саповирусами.Scand J Infect Dis. 2005. 37: 200–204. DOI: 10.1080 / 00365540410020974. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Усуку С., Кумазаки М., Китамура К., Точикубо О., Ногучи Ю. Вспышка пищевого гастроэнтерита, вызванного саповирусом, среди учеников младших классов средней школы. Jpn J Infect Dis. 2008. 61: 438–441. [PubMed] [Google Scholar]
Yamashita Y, Ootsuka Y, Kondo R, Oseto M, Doi M, Miyamoto T., Ueda T., Kondo H, Tanaka T, Wakita T. и др. Молекулярная характеристика саповируса, обнаруженного при гастроэнтерите вспышка в свадебном зале.J Med Virol. 2010. 82: 720–726. DOI: 10.1002 / jmv.21646. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Капикян А.З., Вятт Р.Г., Левин М.М., Блэк Р.Э., Гринберг Г.Б., Флорес Дж., Калица А.Р., Хошино Ю., Чанок Р.М. Исследования на добровольцах с ротавирусами человека. Dev Biol Stand. 1983; 53: 209–218. [PubMed] [Google Scholar]
Morris CA, Flewett TH, Bryden AS, Davies H. Эпидемический вирусный энтерит в детской палате длительного пребывания. Ланцет. 1975; 1: 4–5. [PubMed] [Google Scholar]
Родригес В.Дж., Ким Х.В., Брандт С.Д., Йолкен Р.Х., Ричард М., Арробио Д.О., Шварц Р.Х., Капикян А.З., Чанок Р.М., Парротт Р.Х.Распространенная вспышка гастроэнтерита, вызванного ротавирусом 2 типа, с высокой частотой вторичных атак в семьях. J Infect Dis. 1979; 140: 353–357. DOI: 10.1093 / infdis / 140.3.353. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Митчелл Д.К., Матсон Д.О., Кубитт В.Д., Джексон Л.Дж., Уиллкокс М.М., Пикеринг Л.К., Картер М.Дж. Распространенность антител к астровирусу 1 и 3 типов у детей и подростков в Норфолке, Вирджиния. Pediatr Infect Dis J. 1999; 18: 249–254. DOI: 10.1097 / 00006454-1990-00008. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Оливер С.Л., Асобайре Э., Дастджерди А.М., Бриджер Дж.Геномная характеристика неклассифицированного кишечного вируса крупного рогатого скота Newbury agent-1 (Newbury1) подтверждает новый род в семействе Caliciviridae. Вирусология. 2006; 350: 240–250. DOI: 10.1016 / j.virol.2006.02.027. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Сципиони А., Маурой А., Винье Дж., Тири Э. Норовирусы животных. Вет Дж. 2008; 178: 32–45. DOI: 10.1016 / j.tvjl.2007.11.012. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Норовирус. http://www.cdc.gov/norovirus/hcp/clinical-overview.html.
Китадзима М., Ока Т., Харамото Е., Фануван С., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Генетическое разнообразие норовирусов геногруппы IV в сточных водах в Японии. Lett Appl Microbiol. 2011; 52: 181–184. DOI: 10.1111 / j.1472-765X.2010.02980.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Китадзима М., Ока Т., Харамото Э., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Сезонное распределение и генетическое разнообразие норовирусов геногрупп I, II и IV в реке Тамагава, Япония . Environ Sci Technol. 2010; 44: 7116–7122.DOI: 10.1021 / es100346a. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Кол Е.О., Эпплтон Х. Электронно-микроскопические и физические характеристики небольших круглых фекальных вирусов человека: временная схема классификации. J Med Virol. 1982; 9: 257–265. DOI: 10.1002 / jmv.18403. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Каплан Дж. Э., Гэри Г. У., Барон Р. К., Сингх Н., Шонбергер Л. Б., Фельдман Р., Гринберг HB. Эпидемиология норволкского гастроэнтерита и роль вируса Норуолк в вспышках острого небактериального гастроэнтерита.Ann Intern Med. 1982; 96: 756–761. DOI: 10.7326 / 0003-4819-96-6-756. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Чиба С., Наката С., Нумата-Киношита К., Хонма С. Вирус Саппоро: история и недавние открытия. J Infect Dis. 2000; 181 (Дополнение 2): S303 – S308. [PubMed] [Google Scholar]
Dey SK, Phan TG, Nguyen TA, Nishio O, Salim AF, Yagyu F, Okitsu S, Ushijima H. Распространенность саповирусной инфекции среди младенцев и детей с острым гастроэнтеритом в городе Дакка, Бангладеш во время 2004–2005 гг.J Med Virol. 2007. 79: 633–638. DOI: 10.1002 / jmv.20859. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Blacklow NR, Greenberg HB. Вирусный гастроэнтерит. N Engl J Med. 1991; 325: 252–264. DOI: 10.1056 / NEJM1953250406. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Ноэль Дж.С., Лю Б.Л., Хамфри С.Д., Родригес Е.М., Лэмбден П.Р., Кларк И.Н., Дуайер Д.М., Андо Т., Гласс Р.И., Монро С.С. Вирус Парквилля: новый генетический вариант калицивируса человека в кладе вируса Саппоро, связанный со вспышкой гастроэнтерита у взрослых.J Med Virol. 1997. 52: 173–178. DOI: 10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199706) 52: 2 <173 :: AID-JMV10> 3.0.CO; 2-M. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Епископ РФ, Дэвидсон Г.П., Холмс И.Х., Рак Б.Дж. Вирусные частицы в эпителиальных клетках слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки у детей с острым небактериальным гастроэнтеритом. Ланцет. 1973; 2: 1281–1283. [PubMed] [Google Scholar]
Парашар Ю.Д., Гибсон С.Дж., Бресс Дж.С., Гласс Р.И. Ротавирус и тяжелая диарея у детей. Emerg Infect Dis. 2006. 12: 304–306. DOI: 10.3201 / eid1202.050006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Mackow E. In: Инфекции желудочно-кишечного тракта. Блазер М., Смит П., Равдин Дж., Гринберг Х., Геррант Р.Л., редактор. Нью-Йорк: Raven Press; 1995. Ротавирусы группы B и C; С. 983–1008. [Google Scholar]
Сантос Н., Хосино Ю. Глобальное распространение серотипов / генотипов ротавируса и его значение для разработки и внедрения эффективной ротавирусной вакцины. Rev Med Virol. 2005; 15: 29–56.DOI: 10.1002 / RMV.448. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Родригес В.Дж., Ким Х.В., Арробио Дж.О., Брандт С.Д., Чанок Р.М., Капикян А.З., Вятт Р.Г., Парротт Р.Х. Клинические особенности острого гастроэнтерита, связанного с реовирусоподобным агентом человека, у младенцев и детей раннего возраста. J Pediatr. 1977; 91: 188–193. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (77) 80810-X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Брандт С.Д., Ким Х.В., Родригес В.Дж., Арробио Д.О., Джеффрис Б.К., Столлингс Е.П., Льюис С., Майлз А.Дж., Чанок Р.М., Капикян А.З., Пэрротт Р.Х.Детский вирусный гастроэнтерит за восемь лет исследования. J Clin Microbiol. 1983; 18: 71–78. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Эдмонсон Л.М., Эбберт Дж. О., Эванс Дж. М.. Сообщение о вспышке ротавируса среди взрослого населения дома престарелых. J Am Med Dir Assoc. 2000; 1: 175–179. [PubMed] [Google Scholar]
Hrdy DB. Эпидемиология ротавирусной инфекции у взрослых. Rev Infect Dis. 1987; 9: 461–469. DOI: 10.1093 / Clinids / 9.3.461. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Гриффин М.Р., Суровец Дж. Дж., Макклоски Д.И., Капуано Б., Пьерзински Б., Куинн М., Войнарски Р., Паркин В.Е., Гринберг Н., Гэри Г.В.Норуолкский вирус пищевого происхождения. Am J Epidemiol. 1982; 115: 178–184. [PubMed] [Google Scholar]
Ганн Р.А., Яновски Х.Т., Либ С., Пратер Е.С., Гринберг Х.Б. Гастроэнтерит, вызванный вирусом Norwalk, возникший после употребления в пищу сырых устриц. Am J Epidemiol. 1982; 115: 348–351. [PubMed] [Google Scholar]
Malek M, Barzilay E, Kramer A, Camp B, Jaykus LA, Escudero-Abarca B, Derrick G, White P, Gerba C, Higgins C. и др. Вспышка норовирусной инфекции среди рек стропила, связанные с упакованным мясом деликатесов, Гранд-Каньон, 2005 г.Clin Infect Dis. 2009. 48: 31–37. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Саид MA, Perl TM, Sears CL. Эпидемиология здравоохранения: желудочно-кишечный грипп: норовирус в учреждениях здравоохранения и длительного ухода. Clin Infect Dis. 2008. 47: 1202–1208. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
O’Ryan M, Linhares AC. Последние новости о Rotarix: пероральная вакцина против ротавируса человека. Экспертные ревакцины. 2009. 8: 1627–1641. DOI: 10.1586 / erv.09.136. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита: систематический обзор
BMC Infect Dis.2013; 13: 446.
, ¹, ², ¹, ², ³, ⁴ и ²
Рейчел М. Ли
¹ Департамент международного здравоохранения, Джонс Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA
Justin Lessler
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США
Rose A Lee
¹ Department of International Health, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA
Kara E Rudolph
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США
Николас Г. Райх
³ Отдел биостатистики и эпидемиологии , Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США
Trish M Perl
⁴ Depar Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США
Дерек А.Т. Каммингс
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США
¹ Департамент Международного здравоохранения, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США
³ Отдел биостатистики и эпидемиологии Школы общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США
⁴ Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США
Автор, отвечающий за переписку.
Поступило 06 марта 2013 г .; Принято 12 сентября 2013 г.
Copyright © 2013 Lee et al .; лицензиат BioMed Central Ltd. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальная работа процитирована должным образом. Эта статья цитировалась в других статьях в PMC.
Дополнительные материалы
Дополнительный файл 1 Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.
GUID: E778F8C8-667E-4C91-903D-7B3CCDE5DCA8
Резюме
Предпосылки
Точное знание инкубационного периода важно для исследования и контроля инфекционных заболеваний и их передачи, однако сведения об инкубационном периоде в литературе остаются часто не цитируются, противоречивы и / или не основаны на доказательствах.
Методы
При систематическом обзоре литературы по пяти кишечным вирусам, имеющим значение для общественного здравоохранения, мы нашли 256 статей с оценками инкубационного периода, в том числе 33 с данными для объединенного анализа.
Результаты
Мы подобрали логарифмически нормальное распределение для объединенных данных и обнаружили, что средний инкубационный период составляет 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) для астровируса, 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) для норовируса. геногрупп I и II, 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) для саповирусов и 2,0 дня (95% ДИ 1,4–2,4 дня) для ротавируса.
Выводы
Наши оценки объединяют опубликованные данные и предоставляют достаточные количественные данные, позволяющие использовать эти оценки в широком спектре клинических приложений и приложений для моделирования.Это может привести к улучшению мер профилактики и контроля в условиях передачи или риска передачи.
Ключевые слова: Инкубационный период, норовирус, ротавирус, калицивирусы, астровирус, систематический обзор
Предпосылки
Острый вирусный гастроэнтерит является важной и часто недооцениваемой причиной заболеваемости и смертности во всем мире. Почти все дети перенесли хотя бы одну ротавирусную инфекцию к пяти годам. Ежегодно на ротавирус приходится около двух миллионов госпитализаций и от 350 000 до 600 000 случаев смерти детей младшего возраста [1].Несколько исследований показали, что астровирус является важной причиной острого гастроэнтерита у детей раннего возраста; исследование распространенности в Соединенном Королевстве показало, что более 70% пятилетних детей имеют антитела к вирусу [2-6]. Астровирус также упоминается как важная причина гастроэнтерита у пожилых людей [7,8]. Калицивирусы, в частности норовирусы, являются наиболее важной причиной эпидемических небактериальных гастроэнтеритов во всем мире, поражают как взрослых, так и детей и составляют от 40 до 50% всех гастроэнтеритов пищевого происхождения в США [9,10].
Астровирус, ротавирус и калицивирусы являются важными причинами инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и вспышек заболеваний в медицинских учреждениях [11]. Инкубационный период (время между заражением и появлением симптомов) важен для точного наблюдения за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, и реализации эффективных мер борьбы со вспышками (например, когортирование и / или карантин). [12] Инкубационный период часто используется для определения заражающего воздействия во время вспышек болезней пищевого происхождения [13,14] и может помочь в диагностике, когда лабораторные ресурсы недоступны.Критерии Каплана были разработаны и часто используются для определения того, была ли вспышка вызвана норовирусом; инкубационный период — один из ключевых элементов этих критериев. [15] Другие применения точно описанного инкубационного периода включают в себя прогностические модели, которые используют инкубационный период для точного моделирования процесса заболевания, а продолжительность инкубационного периода по отношению к латентному периоду (время между заражением и переходом в инфекцию) определяет потенциальная эффективность мер контроля, нацеленных на лиц с симптомами [16].
Несмотря на важность, периоды инкубации кишечных вирусов недостаточно хорошо описаны в медицинской литературе. Информация об инкубационном периоде, как правило, состоит из одного числа («Инкубационный период ротавирусной болезни составляет приблизительно 2 дня» [17]) или плохо определенного диапазона («Инкубационный период для астровирусной болезни составляет от 1 до 5 дней…» [ 18]). Эти утверждения инкубационного периода трудно воплотить в реалии профилактики и контроля. Оценка с одним числом может представлять собой среднее значение, медианное значение, верхний предел или какой-либо другой показатель инкубационного периода.Диапазон может представлять собой исчерпывающий диапазон всех наблюдений или некоторый неопределенный квантиль (например, 95% доверительный интервал, внутренний 75% и т. Д.). Кроме того, часто неясна сила доказательств, лежащих в основе этих оценок. Заявления об инкубационном периоде часто не включают цитату, а когда цитируется, следование цепочке цитирований часто показывает, что оценка основана на ограниченных доказательствах [19].
Мы проанализировали литературу по пяти кишечным вирусам, отобранным с учетом их важности для общественного здравоохранения: астровирусу, калицивирусам (геногруппы норовирусов I и II и саповирусы) и ротавирусу.Посредством систематического обзора и анализа опубликованных оценок и данных мы стремимся (1) зафиксировать консенсус в медицинской литературе по этим инкубационным периодам, (2) охарактеризовать доказательства, лежащие в основе этого консенсуса, и (3) предоставить улучшенные оценки инкубационных периодов для эти инфекции. Поступая таким образом, мы надеемся, что инкубационный период будет использоваться в большем количестве приложений и выявить те области, в которых необходимы дополнительные исследования.
Методы
В этом систематическом обзоре в основном использовались методы, описанные в Lessler et al., 2009 [20]. Подробности и различия в подходах описаны ниже.
Стратегия поиска и критерии выбора
Для каждого вируса мы провели поиск в PubMed, Google Scholar и ISI Web of Knowledge 4.0, как описано Lessler et al., 2009 [20]. В PubMed мы искали слова «инкубация», «период» и название вируса, в Google Scholar мы искали фразы «инкубационный период [название вируса]» и «инкубационный период для [название вируса]», а также ISI Web of Knowledge мы искали по «инкубационному периоду» и названию вируса [20].Поиски проводились в период с 20 января 2011 г. по 16 августа 2011 г., без ограничений по самой ранней дате возврата статей. Общие варианты названия каждого вируса использовались в каждой базе данных, в частности, «астровирус», «калицивирус», «норовирус», «вирус Норо», «Норуолк», «Норуолк-подобный», «NLV», «NLV», «SRSV». »,« Зимняя рвота »,« Hyperemesis hiemis »,« Снежная гора »,« саповирус »,« вирус Саппоро »,« Саппороподобный вирус »,« ротавирус »,« дуовирус »,« агент, подобный реовирусу человека », и «агент инфантильного гастроэнтерита».Мы также рассмотрели четыре широко используемых справочника по инфекционным заболеваниям [11,21-23]. Тезисы рецензировались двумя рецензентами независимо друг от друга. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса. Этот обзор соответствует контрольным спискам систематических обзоров PRISMA и QUORUM.
Оценка
Документы, включенные в полнотекстовый обзор, были классифицированы как содержащие (1) оценку инкубационного периода, основанную на исходных данных и / или анализе, (2) отчет об инкубационном периоде (т. Е. Предоставленную цитату), (3) ) отчет об инкубационном периоде без источника (т.д., без ссылки) или (4) без указания инкубационного периода. Все документы были также проверены на предмет данных индивидуального уровня, пригодных для объединенного анализа. Полные тексты рецензировались независимо двумя рецензентами. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса.
Абстракция данных
Отчеты инкубационного периода и данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа, были извлечены, как описано в Lessler et al., 2009 [20]. Поскольку во многих вспышках болезней пищевого происхождения, описанных в литературе, не сообщалось о точном времени приема пищи, мы установили стандартные интервалы воздействия, которые использовались при абстрагировании данных на индивидуальном уровне для исследований, в которых время приема пищи было указано как просто «завтрак», «обед» или «обед».Воздействие во время завтрака считалось периодом между 0:00 и 10:00, обедом между 10:00 и 14:00 и ужином между 14:00 и 0:00. Мы сообщаем диапазон инкубационных периодов таким образом, чтобы инкубационный период в этом диапазоне соответствовал прогнозам большинства исследователей (т.е.согласовался с более чем 50% опубликованных оценок) и модальным утверждением центральной тенденции.
Объединенный анализ
Сартвелл и другие показали, что натуральный логарифм инкубационных периодов острых инфекционных заболеваний имеет тенденцию к нормальному распределению; следовательно, инкубационный период следует логарифмически нормальному распределению, определяемому средним инкубационным периодом и коэффициентом дисперсии [20,24-26].При нормальном распределении примерно две трети данных попадают в одно стандартное отклонение от среднего; аналогично при логнормальном распределении примерно в двух третях случаев развиваются симптомы между медианной / дисперсией и медианной × дисперсией. Для каждого патогена все наблюдения были объединены в единый набор двухинтервальных цензурированных наблюдений; каждая точка данных содержала диапазон возможных времен воздействия, например «обед», и диапазон возможных времен появления симптомов.Поскольку время воздействия и появления симптомов редко сообщается точно, минимальный временной интервал, который мы рассмотрели, составлял один час. Если сообщалось, что время появления симптома составляет 17:00, мы записывали время появления симптома между 17:00 и 18:00. Оценки максимального правдоподобия были получены с использованием пакета coarseDataTools для R [25,27]. Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций). Объединенные данные для каждой геногруппы норовирусов были проанализированы индивидуально, данные из геногрупп I и II были проанализированы вместе, и, наконец, все данные о калицивирусах человека (как геногруппы норовирусов, так и саповирусы) были объединены и проанализированы.Для выбора подходящих групп использовались байесовский информационный критерий и оценка клинически значимых различий в оценках. Результаты инкубационного периода, полученные с использованием логнормального распределения, сравнивались с результатами, полученными с использованием распределений Вейбулла и гамма-распределения; квантильные оценки оказались согласованными между распределениями (см. дополнительный файл 1). Все анализы были выполнены с использованием статистического пакета R (версия 2.11). Конкретные оценки, содержащиеся в этом обзоре, все данные, использованные в объединенном анализе, и полная библиография доступны у авторов по запросу.В помощь разработчикам моделей результаты подгонки данных с использованием распределения Эрланга доступны в дополнительных материалах (Дополнительный файл 1).
Результаты
Мы идентифицировали 256 статей с одним или несколькими заявлениями об инкубационном периоде (рисунок). Из 317 оценок, включенных в эти статьи, 91 (29%) были оригинальными, 137 (43%) давали источник, а 89 (28%) не предоставляли источник (таблица). 33 статьи содержали данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа (таблица). Шесть (18%) исследований были экспериментальными, а 27 (82%) — наблюдательными.В таблице приведены инкубационные периоды, указанные в литературе, и исходные данные. Оценки инкубационного периода норовирусов получили наибольшую поддержку (23 исследования). Оценка саповирусов была подтверждена меньшим количеством исследований, но эти исследования были относительно большими. Для ротавируса и астровируса было доступно менее 20 наблюдений. Оценки полного распределения каждого инкубационного периода с использованием объединенных данных показаны на рисунке и в таблице. Это обеспечивает периоды, когда 5%, 25%, 50%, 75% и 95% случаев станут симптоматическими.Мы показываем только 5-й и 95-й процентили, когда было более 20 наблюдений для отдельного вируса. Медиана инкубационного периода варьировала от 1,1 дня (для норовирусов I геногруппы) до 4,5 дня (для астровируса). Разброс от 1,22 до 1,82. Полные распределения, наложенные на гистограммы данных латентного периода, показаны на рисунке.
Процесс систематического обзора.
Таблица 1
Сводка оценок инкубационного периода в опубликованной литературе
9017
Исходные оценки
33 Саповирус33
62 89 (28%)
Литературные оценки * (дни)
Количество оценок (%)
Участники экспериментальных исследований (n ) ^ψ
Диапазон Central Tendency Оценки без источника Оценки из источников Исходные оценки 1-5
3
8 (40%)
7 (35%)
5 (25%) [1/4]
1
Калицивирусы
Норовирус
1-2
1
39 (22%)
74 (43%)
60 (35%) [15/45]
189
Геногруппы I и II

2
5 (36%)
2 (14%)
7 (50%) [0/7]
—
Ротавирус
1-4 2
37 (34%)
54 (49%)
19 (17%) [6/13]
42
Всего — — 137 (43%) 91 (29%) [22/69] 232
Таблица 2
Исследования, включенные в объединенный анализ
Местоположение Тип исследования N Население ion Комментарии
Астровирус
Kurtz et al.(1979) [28]
UK
Экспериментальный
4
Взрослые добровольцы в возрасте 18–50 лет
—
Midthun et al. (1993) [29]
USA
Экспериментальный
1
Взрослый доброволец
—
Mitchell et al. (1993) [30]
США
Наблюдательные
5
Дети в возрасте 6–30 месяцев
Вспышка в дневном стационаре
Калицивирусы
2 Норовирус
Геногруппа I
Baron et al.(1982) [31]
США
Наблюдательный
132
Взрослые и дети в возрасте от 9 месяцев до 59 лет
Вспышка, связанная с купанием в озере
Becker et al. (2000) [32]
США
Наблюдательный
54
Мужчины, футболисты колледжа
Вспышка, связанная с упакованными ланчами
Dolin et al.(1971) [33]
США
Экспериментальный
5
Заключенные-мужчины в возрасте 18–45 лет
—
Gill et al. (1983) [34]
UK
Наблюдательный
127
Взрослые
Вспышка, связанная с потреблением сырых устриц
Hicks et al. (1996) [35]
UK
Observational
31
Гости на свадебном приеме
—
Hoebe et al.(2004) [36]
Нидерланды
Наблюдательный
90
Дети в возрасте 4–12 лет
Вспышка, связанная с игрой в зараженном фонтане
Курицкий и др. (1984) [37]
США
Наблюдательный
126
Взрослые и дети, посещающие любое из четырех общественных мероприятий с питанием
Вспышка, связанная с употреблением в пищу замороженных хлебобулочных изделий, приготовленных плохим кулинаром Linco et al.(1980) [38]
Австралия
Наблюдательный
24
Гости на рождественском ужине
Вспышка, связанная с употреблением сырых устриц
Matsuhashi et al. (2003) [39]
Япония
Наблюдательный
1
Взрослый врач-мужчина
Заболевание, связанное с выполнением колоноскопии у двух инфицированных лиц
MMWR 9016 (2000) [2000] USA
Observational
209
Взрослые
Oubreak, связанный с поеданием картофельного салата на корпоративном обеде
Taylor et al.(1981) [41]
США
Наблюдательный
329
Дети в возрасте 5-12 лет
Вспышка, связанная с зараженной питьевой водой в начальной школе
02 Норовирус
Genogroup II
de Wit et al. (2007) [42]
Нидерланды
Наблюдательный
229
Мужчины и женщины в возрасте 17–63 лет
Вспышка, связанная с обедом для персонала
Dolin et al.(1982) [43]
США
Экспериментальный
9
Взрослые добровольцы
—
Gaulin et al. (1999) [44]
Канада
Observational
43
Посетители, посещающие рождественский ужин в ресторане
—
Gotz et al. (2002) [45]
Швеция
Наблюдательный
173
114 детей в возрасте 1–10 лет и 79 взрослых в возрасте 20–61 лет
Вспышка, связанная с обслуживанием обедов в 30 детских садах
Grotto et al.(2004) [13]
Израиль
Наблюдательный
162
Солдаты мужского и женского пола, дислоцированные на военной базе
Вспышка, связанная с салатом из столовой
Hirakata et al. (2005) [46]
Япония
Наблюдательный
628
Учащиеся начальной, младшей и старшей школы
Мексиканский агент. Вспышка, связанная с обедом в ресторане во время экскурсии
Исакбаева и др.(2005) [47]
США
Наблюдательный
2
Взрослая женщина и ребенок
Вспышка, связанная с контактом с больным ребенком во время двухчасовой игровой группы
Kirking et al. (2010) [48]
США
Наблюдательный
7
Взрослые и дети в возрасте 11–73 лет
Вспышка, связанная с воздействием рвотных масс в виде аэрозолей в самолете
.(2000) [49]
UK
Observational
43
Посетители обедают в большом отеле
—
Marshall et al. (2001) [50]
Австралия
Наблюдательный
46
Посетители ресторана
Вспышка, связанная с употреблением зараженной пищи в буфете
Thornhill et al. (1977) [51]
США
Экспериментальный
1
Взрослый доброволец
Гавайский агент
Труман и др.(1987) [52]
США
Наблюдательный
84
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 16–74 лет
Вспышка, связанная с поеданием моллюсков на организованном мероприятии
Sapovirus
Хамфри и др. (1984) [53]
UK
Observational
14
Один ребенок в возрасте 3 лет, девять мужчин и женщин в возрасте 65–95 лет, 5 взрослых мужчин и женщин в возрасте 18–65 лет
Вспышка в учреждении по уходу за престарелыми и в семье, которая владела учреждением
Johansson et al.(2005) [54]
Швеция
Наблюдательный
9
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 25–84 лет
Инфекция в больницах
Usuku et al. (2008) [55]
Япония
Наблюдательный
65
Шестьдесят учеников третьего класса и пять взрослых
Вспышка, связанная с рестораном в отеле
Yamashita et al.(2010) [56]
Япония
Наблюдательный
18
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 20–70 лет
Вспышка после свадебного приема
Ротавирус Капикян и др. (1983) [57]
США
Экспериментальный
4
Взрослые добровольцы
—
Morris et al.(1975) [58]
UK
Наблюдательный
1
Детский
Инфекция в больницах
Rodriguez et al. (1979) [59] USA Observational 6 Две взрослые женщины и 4 ребенка в возрасте 18–24 месяцев Вспышка после игровой группы
Кумулятивное распределение инкубационного периода. Показан совокупный процент случаев, в которых симптомы развиваются к определенному дню согласно оценкам логнормального распределения.Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций).
Таблица 3
Процентили времени появления симптомов и дисперсии для распределения заболеваний
751-1 9326
Оценка (95 % ДИ) времени появления симптомов (дни) 24 * 901
Дисперсия (95 % ДИ)
5-й процентиль 25-й процентиль 50-й процентиль121 9011
Астровирус
—
4.0 (3,5-4,9)
4,5 (3,9-5,2)
5,3 (4,4-5,8)
—
1,22 (1,04-1,30)
Калицивирусы
^**
0,5 (0,5-0,5)
0,9 (0,8-0,9)
1,2 (1,1-1,2)
1,7 (1,6-1,7)
2,6 (2,6- 2,8)
1,64 (1,61-1,71)
Геногруппа I ^α
0.4 (0,4-0,5)
0,8 (0,7-0,8)
1,1 (1,1-1,2)
1,6 (1,6-1,7)
3,0 (2,8-3,2)
1,82 (1,75-1,90 )
Genogroup II ^β
0,6 (0,5-0,6)
0,9 (0,9-1,0)
1,2 (1,2-1,3)
1,6 (1,6 )
2,5 (2,4-2,6)
1,56 (1,49-1,62)
Саповирусы ^***
0.9 (0,7-1,0)
1,3 (1,1-1,4)
1,7 (1,5-1,8)
2,3 (2,0-2,4)
3,3 (2,7-3,8)
1,48 (1,36-1,61 )
Ротавирус — 1,6 (1,1-1,9) 2,0 (1,4-2,4) 2,5 (1,8-3,0) — 1,37 (1,25-1,73)
Кумулятивные распределения данных инкубационного периода и латентного периода.
Астровирус
Астровирус передается фекально-оральным путем [22].Клинические симптомы включают диарею, боль в животе, головную боль, недомогание и рвоту, хотя рвота при астровирусной инфекции встречается реже, чем при ротавирусной или калицивирусной инфекциях [11,22]. Кроме того, астровирус с меньшей вероятностью вызывает обезвоживание или госпитализацию, чем ротавирус [2].
Мы нашли 20 оценок инкубационного периода астровируса, включая пять исходных оценок, семь оценок с источниками и восемь оценок, для которых исходный источник не был предоставлен (оценки без источников).Заявления об инкубационном периоде обычно составляли от 1 до 5 дней (таблица). Было обнаружено три оригинальных исследования, содержащих данные, подходящие для объединенного анализа: два экспериментальных исследования с участием взрослых добровольцев [28,29] и обсервационное исследование, описывающее серию вспышек в детском центре в Хьюстоне, штат Техас, США [30]. На основе этих трех исследований мы оцениваем средний инкубационный период гастроэнтерита, вызванного астровирусом, в 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) с разбросом 1,22 (95% ДИ 1.04-1.30) (таблица). В 25% случаев симптомы проявляются через 4,0 дня (95% ДИ 3,5–4,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 5,3 дня (95% ДИ 4,4–5,8 дней) (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались. Немногие взрослые добровольцы проявляли симптомы при заражении астровирусом [28,30], что свидетельствует о низкой патогенности вируса у взрослых, которые могут быть защищены антителами, приобретенными в детстве [4,60]. Поскольку данные исследований взрослого заражения включают 50% абстрагируемых данных, подходящих для объединенного анализа на астровирус, наши результаты инкубационного периода могут быть неприменимы к первичным инфекциям или инфекциям у детей.
Калицивирусы
Калицивирусы (т. Е. Семейство Caliciviridae ) классически содержат четыре рода, два из которых, норовирус и саповирус , вызывают острый гастроэнтерит у людей [11]. Было предложено, что пятый род калицивирусов включает два генотипа кишечного вируса крупного рогатого скота [61]. Норовирусы разделены на пять антигенно различных геногрупп, три из которых (I, II и IV) вызывают заболевания у людей [62,63]. Норовирусы геногруппы IV были охарактеризованы в сточных водах и речной воде, но, насколько нам известно, не были причастны к вспышкам заболеваний, поэтому в данном обзоре основное внимание будет уделено норовирусам и саповирусам геногрупп I и II [64,65].Важно отметить, что недавние вспышки этих вирусов связаны с увеличением заболеваемости и смертности. Норовирусы и саповирусы передаются фекально-оральным путем и имеют несколько разные клинические проявления [11].
Используя байесовский информационный критерий, мы определили, что все три геногруппы калицивируса человека статистически различаются с точки зрения распределения их инкубационного периода. Однако оценки инкубационных периодов, эпидемиологии и клинических проявлений калицивирусов геногрупп I и II для практических целей очень похожи [43,66].Мы предлагаем рассматривать эти две геногруппы, норовирусы, с одинаковым инкубационным периодом. Саповирусы имеют отличную эпидемиологию и клинические проявления от норовирусов геногрупп I и II, и их следует рассматривать как отдельную группу вирусов.
Норовирусы (геногруппы I и II)
Норовирусы вызывают примерно 90% всех вспышек эпидемического гастроэнтерита и являются важным источником вспышек болезней пищевого происхождения во всем мире [9,10,22]. Хотя передача происходит в основном фекально-оральным путем, имеются также свидетельства передачи через рвотные массы [48].Клинические симптомы включают спазмы в животе, тошноту, частую рвоту и диарею [22]. Большинство опубликованных оценок норовирусов соответствовало инкубационному периоду от 1 до 2 дней (таблица).
Выявлен 131 документ с указанием инкубационного периода норовирусов. Эти документы содержали 60 исходных оценок, 74 оценки из источников и 39 оценок без источников. 54% всех полученных оценок инкубационного периода норовирусов цитировали одну из двух статей Kaplan et al.[15,67], или сослался на статью, в которой цитируется одна или обе эти статьи. Каплан и его коллеги объединили данные 38 вспышек норовируса в период с 1967 по 1980 год и предложили четыре критерия, которые можно использовать для характеристики вспышек норовируса: (1) посев кала, свободный от бактериальных патогенов, (2) средняя или средняя продолжительность болезни 12–60 часов, (3) рвота в ≥ 50% случаев и (4) средний или средний инкубационный период 24–48 часов [67]. Большинство опубликованных оценок инкубационного периода норовирусов соответствовали критериям Каплана (таблица).
На основании 2540 наблюдений из 20 обсервационных исследований и 15 наблюдений из трех экспериментальных исследований, мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов в 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) с дисперсией 1,64 (95% ДИ 1,61- 1.71). В 5% случаев норовируса симптомы проявляются через 0,5 дня (95% ДИ 0,5–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы становятся симптоматическими через 2,6 дня (95% ДИ 2,6–2,8 дня) (таблица).
Геногруппа I
На основании 1123 наблюдений из десяти наблюдательных исследований и пяти наблюдений из одного экспериментального исследования [33] мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы I как 1.1 день (95% ДИ 1,1–1,2 дня) с дисперсией 1,82 (95% ДИ 1,75–1,90). В 5% случаев норовируса геногруппы I симптомы проявляются через 0,4 дня (95% ДИ 0,4–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы разовьются через 3,0 дня (95% ДИ 2,8–3,2 дня) (таблица).
Геногруппа II
Основываясь на десяти наблюдениях из двух экспериментальных исследований [43,51] и 1417 оценках из десяти обсервационных исследований [46,49], мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы II как 1.2 дня (95% ДИ 1,2–1,3 дня) с дисперсией 1,56 (95% ДИ 1,49–1,62). В 5% случаев норовируса геногруппы II симптомы проявляются через 0,6 дня (95% ДИ 0,5–0,6 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 2,4–2,6 дня) (таблица).
Саповирусы
Саповирусы в первую очередь вызывают гастроэнтерит у младенцев и детей и не являются важными патогенами при вспышках болезней пищевого происхождения [68]. Клинические симптомы включают рвоту, обезвоживание, боль в животе и, в меньшей степени, диарею и лихорадку [69].Опубликованные оценки саповирусов соответствовали инкубационному периоду 1-3 дня (таблица).
Выявлено 13 документов, содержащих 14 отчетов об инкубационном периоде саповирусов. Эти документы содержали семь исходных оценок, две оценки из источников и пять оценок без источников. Цитируемыми источниками были обзорная статья Блэклоу и Гринберга [70], в которой содержалась оценка без источника, и результаты наблюдательного исследования Ноэля и его коллег [71], описывающие вспышку штамма вируса Парквилл.
Основываясь на 106 наблюдениях из четырех обсервационных исследований [53-56], мы оцениваем средний инкубационный период саповирусов в 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) с дисперсией 1,48 (95% ДИ 1,36–1,61) . В 5% случаев симптомы проявляются через 0,9 дня (95% ДИ 0,7–1,0 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 3,3 дня (95% ДИ 2,7–3,8 дня) (таблица).
Ротавирус
Ротавирус передается фекально-оральным путем [22,72]. Ротавирус группы А вызывает более 600 000 случаев смерти младенцев и детей младшего возраста в год, в основном в развивающихся странах [73].Ротавирусы группы B преимущественно наблюдались во взрывных вспышках среди взрослых в Китае [11,74]. Ротавирусы группы C, по-видимому, не имеют значения для общественного здравоохранения [11,74]. Распространенность серотипов ротавирусов в этих группах варьируется в разных частях мира, что чрезвычайно затрудняет широкомасштабную эффективную борьбу с заболеванием [75]. Клинические симптомы включают лихорадку и рвоту, за которыми следует обильная водянистая диарея и обезвоживание [76]. Инфекции, вызывающие острое заболевание, возникают преимущественно в возрасте от 6 до 24 месяцев [76,77].У взрослых инфекции обычно протекают бессимптомно, однако заболевание было вызвано экспериментально у взрослых и описаны вспышки среди взрослого населения [11,57,78,79].
Мы нашли 110 оценок инкубационного периода ротавируса, включая 19 исходных оценок, 54 оценки с источниками и 37 оценок без источников. Большинство опубликованных оценок ротавируса соответствовали двухдневному инкубационному периоду (таблица).
Основываясь на четырех наблюдениях из одного экспериментального исследования на взрослых добровольцах [57] и шести наблюдениях из двух наблюдательных исследований [58,59], мы оцениваем средний инкубационный период ротавируса как 2.0 дней (95% ДИ 1,4–2,4 дня) с дисперсией 1,37 (1,25–1,73). В 25% случаев ротавирус становится симптоматическим через 1,6 дня (95% ДИ 1,1–1,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 1,8–3,0 дня) после заражения (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались.
Обсуждение
Оценка инкубационного периода инфекционных заболеваний, включая гастроэнтерит, имеет решающее значение для обоснования и обоснованности вмешательств, направленных на прерывание текущей передачи.В нашем обзоре трех основных вирусных причин гастроэнтерита мы обнаружили, что 61% из 226 оценок инкубационного периода даны со ссылкой. После изучения деревьев цитирования для этих оценок только 114 (50%) из 226 были фактически основаны на данных. Двадцать три (17%) оценок, полученных из источников, процитировали статью, которая содержала оценку без источников. Эти данные показывают, что инкубационные периоды кишечных вирусов часто считаются общеизвестными. Из источников, основанных на данных, большинство для каждого вируса можно проследить до оценок из небольшого числа оригинальных исследований, таких как Kaplan et al.статьи для геногрупп I и II норовирусов [15,67].
Были некоторые опасения, что отдельные исследования потенциально могут иметь чрезмерное влияние на объединенный анализ. Мы провели анализ чувствительности, удалив все исследования и пересчитав оценки инкубационного периода. Мы не обнаружили качественной разницы в результатах.
Определение инкубационного периода ограничено степенью неопределенности относительно времени заражения. Поскольку инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита короткие, во время вспышки часто бывает трудно различить первичный и вторичный случаи.Это затрудняет получение точной информации об интервале экспозиции. Большинство обсервационных исследований, особенно исследований вспышек пищевого происхождения, решают эту проблему, рассматривая только случаи в течение определенного количества дней после заражения [34,36,37,42,44,52,80-82]. Этот метод выявления случаев может внести систематическую ошибку за счет исключения случаев, попадающих в хвостовую часть распределения инкубационного периода. Несмотря на то, что существует множество наблюдательных исследований, описывающих вспышки, вызванные ротавирусом и астровирусом, поскольку невозможно определить интервал воздействия для отдельных случаев, данные этих исследований не могут использоваться для определения инкубационного периода.
Множество факторов могут привести к тому, что данные экспериментальной инфекции будут отличаться от данных естественной инфекции, например, инфекционная доза или добровольцы, чей статус хозяина отличается от такового в общей популяции. Например, единственное экспериментальное исследование, внесшее данные в объединенный анализ ротавируса, проводилось с поиском добровольцев с низким уровнем антител в сыворотке [57]. Эти предубеждения усугубляются невозможностью проведения экспериментальных исследований проблем среди групп населения, наиболее подверженных риску заболеваний, среди детей и пожилых людей.Это особенно верно в отношении ротавируса и астровируса, болезней, от которых почти всегда страдают маленькие дети.
Этот обзор был ограничен включением только опубликованных данных и условиями поиска. Из-за того, что мы включили некоторую форму «инкубационного периода» в поиск статей, вся литература по каждому вирусу не рассматривалась. Наши оценки для астровируса и ротавируса основаны на трех исследованиях и менее чем 20 наблюдениях. Из-за трудностей экспериментального изучения этих заболеваний необходимы тщательные наблюдательные исследования, чтобы получить больше доказательств, подтверждающих инкубационный период и его распространение.
Точное знание инкубационного периода особенно важно для вирусного гастроэнтерита из-за короткой продолжительности инкубационного периода, относительно высокой частоты вторичных атак и возможности возникновения вспышек заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи. Как ротавирус, так и норовирус особенно трудно контролировать в медицинских учреждениях [11,83]. Фишер и его коллеги определили, что в среднем 27% пациентов в развитых странах и 32% пациентов в развивающихся странах, выписанных с диагнозом ротавирус, заразились этим вирусом в больнице [17].Кроме того, инкубационный период является важным компонентом серийного интервала (разница во времени появления симптомов в случае и в случае инфицирования), который является одним из основных факторов, определяющих скорость распространения эпидемий в популяции.
Несмотря на лицензирование двух безопасных и эффективных вакцин, ротавирус продолжает оставаться важной проблемой общественного здравоохранения. Это особенно верно в развивающихся странах, где происходит подавляющее большинство ротавирусных заболеваний и смертей, и где ротавирусная вакцина имеет самую низкую эффективность [84].Точное знание инкубационного периода важно для понимания динамики ротавирусной болезни и борьбы с ней. По мере того, как охват вакцинацией улучшается и ротавирусная инфекция перестает быть повсеместной, инкубационный период будет полезен для изучения воздействия патогенов, связанного с неэффективностью вакцинации, и потенциальных различий в восприимчивости хозяев к инфекции.
Заключение
Следуя нашей работе по оценке инкубационного периода респираторных вирусов [20], в этом обзоре мы объединили опубликованные данные для оценки инкубационных периодов пяти кишечных вирусов, важных для общественного здравоохранения.Как правило, опубликованные оценки инкубационного периода описывают только центральную тенденцию или указывают на неопределенный диапазон, однако знание распределения всего инкубационного периода важно для полного понимания динамики заболевания и потенциальной эффективности мер контроля. Это особенно верно в условиях, когда инфекции могут быть взрывоопасными и иметь огромное влияние на результаты лечения пациентов. Наши оценки обеспечивают дополнительный уровень детализации, необходимый для этих и других приложений, что делает инкубационный период более полезным для исследований, клинической практики и политики общественного здравоохранения.
Конкурирующие интересы
Авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Вклад авторов
RML провела систематический обзор и анализ данных, а также подготовила рукопись. JL провел анализ данных и помог составить рукопись. RAL и KER провели систематический обзор. JL, DATC, TMP и NGR участвовали в разработке и концепции исследования. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.
Дополнительные материалы
Дополнительный файл 1:
Сравнение логнормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.
Благодарности
Работа JL над этим проектом была профинансирована за счет гранта Фонда Билла и Мелинды Гейтс (Инициатива по моделированию вакцин, 705580–3), и он является лауреатом премии NIH в области развития научных исследований (NIAID, K22). AI0-01). KER финансировался Отделом программ интромуральных исследований Национального института психического здоровья.
Ссылки
Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Заболевания и смертность детей от ротавирусной инфекции в мире.Emerg Infect Dis. 2003. 9: 565–572. DOI: 10.3201 / eid0905.020562. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Деннехи PH, Нельсон С.М., Спангенбергер С., Ноэль Дж. С., Монро С. С., Гласс Р. И.. Проспективное исследование «случай – контроль» роли астровируса в острой диарее среди госпитализированных маленьких детей. J Infect Dis. 2001; 184: 10–15. DOI: 10,1086 / 321007. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Herrmann JE, Taylor DN, Echeverria P, Blacklow NR. Астровирусы как причина гастроэнтерита у детей.N Engl J Med. 1991; 324: 1757–1760. DOI: 10.1056 / NEJM19
03242501. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Курц Дж., Ли Т. Распределение антител по возрасту астровирусного гастроэнтерита. Med Microbiol Immunol. 1978; 166: 227–230. DOI: 10.1007 / BF02121154. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Родригес-Баез Н., О’Брайен Р., Цю С.К., бас-мастер. Астровирус, аденовирус и ротавирус у госпитализированных детей: распространенность и связь с гастроэнтеритом. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002. 35: 64–68.DOI: 10.1097 / 00005176-200207000-00014. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Шастри С., Доан А.М., Гонсалес Дж., Упадхьяюла У., бас-мастер. Распространенность астровирусов в детской больнице. J Clin Microbiol. 1998. 36: 2571–2574. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Lewis DC, Lightfoot NF, Cubitt WD, Wilson SA. Вспышки астровируса типа 1 и ротавирусного гастроэнтерита в гериатрических стационарах. J Hosp Infect. 1989; 14: 9–14. DOI: 10.1016 / 0195-6701 (89)
-X.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Gray JJ, Wreghitt TG, Cubitt WD, Elliot PR. Вспышка гастроэнтерита в доме престарелых, связанная с астровирусом 1 типа и калицивирусом человека. J Med Virol. 1987. 23: 377–381. DOI: 10.1002 / jmv.18410. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Технические данные. http://www.cdc.gov/norovirus/php/illness-outbreaks.html.
Долин Р. Норовирусы — проблемы, которые нужно контролировать. N Engl J Med. 2007; 357: 1072–1073. DOI: 10.1056 / NEJMp078050.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хоули П., Книп Д., Филдс Б. Вирусология Филдса, 5-е изд. Филадельфия: Липпинкотт, Уильямс и Уилкинс; 2007. [Google Scholar]
Lessler J, Brookmeyer R, Perl TM. Оценка правил классификации на основе даты появления симптомов для выявления инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Am J Epidemiol. 2007. 166: 1220–1229. DOI: 10,1093 / AJE / kwm188. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Grotto I, Huerta M, Balicer RD, Halperin T, Cohen D, Orr N, Gdalevich M.Вспышка норовирусного гастроэнтерита на израильской военной базе. Инфекционное заболевание. 2004. 32: 339–343. DOI: 10.1007 / s15010-004-4002-3. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Schmid D, Stuger HP, Lederer I, Pichler AM, Kainz-Arnfelser G, Schreier E, Allerberger F. Вспышка норовируса пищевого происхождения из-за салата, приготовленного вручную, Австрия, 2006 г. Инфекция. 2007. 35: 232–239. DOI: 10.1007 / s15010-007-6327-1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Каплан Дж. Э., Фельдман Р., Кэмпбелл Д. С., Лукабо К., Гэри Г. У.Частота болезни, аналогичной норволкской, во вспышках острого гастроэнтерита. Am J Public Health. 1982; 72: 1329–1332. DOI: 10.2105 / AJPH.72.12.1329. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Фрейзер С., Райли С., Андерсон Р.М., Фергюсон Н.М. Факторы, позволяющие контролировать вспышку инфекционного заболевания. Proc Natl Acad Sci USA. 2004. 101: 6146–6151. DOI: 10.1073 / pnas.0307506101. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Fischer TK, Bresee JS, Glass RI.Ротавирусные вакцины и профилактика госпитальной диареи у детей. Вакцина. 2004; 22 (Приложение 1): S49 – S54. [PubMed] [Google Scholar]
Blacklow NR, Herrmann JE. Астровирусный гастроэнтерит. Trans Am Clin Climatol Assoc. 1995; 106: 58–66. обсуждение 66–58. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Рейх Н.Г., Perl TM, Каммингс Д.А., Лесслер Дж. Визуализация клинических данных: сети цитирования для инкубационных периодов респираторных вирусных инфекций. PLoS One. 2011; 6: e19496.DOI: 10.1371 / journal.pone.0019496. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Lessler J, Reich NG, Brookmeyer R, Perl TM, Nelson KE, Cummings DA. Инкубационные периоды ОРВИ: систематический обзор. Lancet Infect Dis. 2009; 9: 291–300. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (09) 70069-6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хейманн Д. Руководство по борьбе с инфекционными заболеваниями. 19. Вашингтон, округ Колумбия: Американская ассоциация общественного здравоохранения; 2008 г.[Google Scholar]
Манделл Дж., Беннет Дж., Долин Р. Принципы и практика инфекционных заболеваний. Филадельфия: Черчилль Ливингстон; 2005. [Google Scholar]
Пикеринг Л. Красная книга: отчет Комитета по инфекционным болезням за 2009 год. 28. Элк-Гроув-Виллидж, Иллинойс: Американская академия педиатрии; 2009. 225, 241-242, 576-579. [Google Scholar]
Каулинг Б.Дж., Мюллер М.П., Вонг И.О., Хо Л.М., Луи М., МакГир А., Леунг Г.М. Альтернативные методы оценки распределения инкубации: примеры из тяжелого острого респираторного синдрома.Эпидемиология. 2007. 18: 253–259. DOI: 10.1097 / 01.ede.0000254660.07942.fb. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Рейх Н.Г., Лесслер Дж., Каммингс Д.А., Брукмейер Р. Оценка распределения инкубационного периода с помощью грубых данных. Stat Med. 2009. 28: 2769–2784. DOI: 10.1002 / sim.3659. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Sartwell PE. Распределение инкубационных периодов инфекционного заболевания. Am J Hyg. 1950; 51: 310–318. [PubMed] [Google Scholar]
coarseDataTools: набор функций, помогающих анализировать грубо наблюдаемые данные.http://cran.r-project.org/web/packages/coarseDataTools.
Курц Дж. Б., Ли Т. В., Крейг Дж. В., Рид С. Е.. Астровирусная инфекция у добровольцев. J Med Virol. 1979; 3: 221–230. DOI: 10.1002 / jmv.18308. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Midthun K, Greenberg HB, Kurtz JB, Gary GW, Lin FY, Kapikian AZ. Характеристика и сероэпидемиология астровируса типа 5, связанного со вспышкой гастроэнтерита в округе Марин, Калифорния. J Clin Microbiol. 1993; 31: 955–962. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Митчелл Д.К., Ван Р., Морроу А.Л., Монро С.С., Гласс Р.И., Пикеринг Л.К.Вспышки астровирусного гастроэнтерита в детских садах. J Pediatr. 1993; 123: 725–732. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (05) 80846-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Baron RC, Murphy FD, Greenberg HB, Davis CE, Bregman DJ, Gary GW, Hughes JM, Schonberger LB. Желудочно-кишечное заболевание Norwalk: вспышка, связанная с купанием в озере для отдыха, и вторичная передача от человека к человеку. Am J Epidemiol. 1982; 115: 163–172. [PubMed] [Google Scholar]
Becker KM, Moe CL, Southwick KL, MacCormack JN.Передача вируса Norwalk во время футбольного матча. N Engl J Med. 2000; 343: 1223–1227. DOI: 10.1056 / NEJM200010263431704. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Dolin R, Blacklow NR, DuPont H, Formal S, Buscho RF, Kasel JA, Chames RP, Hornick R, Chanock RM. Передача острого инфекционного небактериального гастроэнтерита добровольцам при пероральном приеме фильтрата стула. J Infect Dis. 1971; 123: 307–312. DOI: 10.1093 / infdis / 123.3.307. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Gill ON, Cubitt WD, McSwiggan DA, Watney BM, Bartlett CL.Эпидемия гастроэнтерита, вызванная устрицами, зараженными небольшими вирусами с круглой структурой. Br Med J (Clin Res Ed) 1983; 287: 1532–1534. DOI: 10.1136 / bmj.287.6404.1532. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Hicks NJ, Beynon JH, Bingham P, Soltanpoor N, Green J. Вспышка вирусного гастроэнтерита после свадебного приема. Commun Dis Rep CDR Rev.1996; 6: R136 – R139. [PubMed] [Google Scholar]
Hoebe CJ, Vennema H, de Roda Husman AM, van Duynhoven YT.Вспышка норовируса среди младших школьников, игравших в фонтанчике с водой для отдыха. J Infect Dis. 2004. 189: 699–705. DOI: 10,1086 / 381534. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Курицкий Дж. Н., Остерхольм М. Т., Гринберг Х. Б., Корлат Дж. А., Годес Дж. Р., Хедберг К. В., Форфанг Дж. К., Капикян А.З., Маккалоу Дж. К., Уайт К.Э. Норуолкский гастроэнтерит: вспышка болезни в сообществе, связанная с потреблением хлебобулочных изделий. Ann Intern Med. 1984; 100: 519–521. DOI: 10.7326 / 0003-4819-100-4-519. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Linco SJ, Grohmann GS.Дарвиновская вспышка вирусного гастроэнтерита, связанного с устрицами. Med J Aust. 1980; 1: 211–213. [PubMed] [Google Scholar]
Matshuhashi N, Nishi Y, Nagoshi D., Kanemoto H. A N: Эпидемический энтерколит, возможно, в результате заражения вирусом Норуолк, проявляющегося как ишемический колит . Dig Endosc. 2003. 15: 138–141. DOI: 10.1046 / j.1443-1661.2003.00234.x. [CrossRef] [Google Scholar]
Чендлер Б., Беллер М., Дженкерсон С., Миддо Дж., Робертс С., Рейсдорф Е., Рауш М., Сэвидж Р., Дэвис Дж. Вспышки вирусного гастроэнтерита, похожего на Норуолк — Аляска и Висконсин, 1999.MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2000; 49: 207–211. [PubMed] [Google Scholar]
Тейлор Дж. У., Гэри Г. У. мл., Гринберг HB. Связанный с Норуолком вирусный гастроэнтерит из-за загрязненной питьевой воды. Am J Epidemiol. 1981; 114: 584–592. [PubMed] [Google Scholar]
de Wit MA, Widdowson MA, Vennema H, de Bruin E, Fernandes T, Koopmans M. Крупная вспышка норовируса: пекарь, который должен был знать лучше. J Infect. 2007; 55: 188–193. DOI: 10.1016 / j.jinf.2007.04.005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Dolin R, Reichman RC, Roessner KD, Tralka TS, Schooley RT, Gary W, Morens D.Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии возбудителя острого вирусного гастроэнтерита Снежной горы. J Infect Dis. 1982; 146: 184–189. DOI: 10.1093 / infdis / 146.2.184. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Гаулин С., Фригон М., Пуарье Д., Фурнье С. Передача калицивируса работником еды в предсимптоматической фазе болезни. Epidemiol Infect. 1999; 123: 475–478. DOI: 10.1017 / S095026889^{9X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]}
Gotz H, de Jong B, Lindback J, Parment PA, Hedlund KO, Torven M, Ekdahl K.Эпидемиологическое расследование вспышки пищевого гастроэнтерита, вызванного Норуолк-подобным вирусом, в 30 детских садах. Scand J Infect Dis. 2002; 34: 115–121. DOI: 10.1080 / 00365540110080133. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хираката Ю., Арисава К., Нишио О., Накагоми О. Распространение вспышек гастроэнтерита в нескольких префектурах, вызванных одним штаммом норовируса геногруппы II из туристического ресторана в Нагасаки, Япония. J Clin Microbiol. 2005; 43: 1093–1098. DOI: 10.1128 / JCM.43.3.1093-1098.2005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Исакбаева Е.Т., Буленс С.Н., Борода Р.С., Адамс С., Монро С.С., Чавес С.С., Виддоусон М.А., Гласс Р.И. Норовирус и уход за детьми: проблемы в борьбе со вспышками. Pediatr Infect Dis J. 2005; 24: 561–563. DOI: 10.1097 / 01.inf.0000164764.58715.23. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Киркинг Х.Л., Кортес Дж., Беррер С., Холл А.Дж., Коэн Нью-Джерси, Липман Х., Ким С., Дейли Э.Р., Фишбейн Д.Б. Вероятная передача норовируса в самолете, октябрь 2008 г.Clin Infect Dis. 2010; 50: 1216–1221. DOI: 10,1086 / 651597. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Маркс П.Дж., Випонд И.Б., Карлайл Д., Дикин Д., Фей Р.Э., Кол Е.О. Доказательства воздушно-капельной передачи Норуолк-подобного вируса (NLV) в ресторане отеля. Epidemiol Infect. 2000; 124: 481–487. DOI: 10.1017 / S095026889
05. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Marshall JA, Yuen LK, Catton MG, Gunesekere IC, Wright PJ, Bettelheim KA, Griffith JM, Lightfoot D, Hogg GG, Gregory J.и др. Множественные вспышки норволкского вирусного гастроэнтерита, связанные с рестораном в средиземноморском стиле. J Med Microbiol. 2001; 50: 143–151. [PubMed] [Google Scholar]
Торнхилл Т.С., Вятт Р.Г., Калица А.Р., Долин Р., Чанок Р.М., Капикян А.З. Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии вирусоподобных частиц размером 26–27 нм, связанных с двумя семейными вспышками гастроэнтерита. J Infect Dis. 1977; 135: 20–27. DOI: 10.1093 / infdis / 135.1.20. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Трумэн Б.И., Мадоре Х.П., Менегус М.А., Ницкин Д.Л., Долин Р.Снежная гора возбудитель гастроэнтерита от моллюсков. Am J Epidemiol. 1987; 126: 516–525. [PubMed] [Google Scholar]
Хамфри Т.Дж., Крукшанк Дж. Г., Кубитт В. Д.. Вспышка гастроэнтерита, ассоциированного с калицивирусами, в доме престарелых. Возможный зооноз? Дж. Хиг (Лондон) 1984; 93: 293–299. DOI: 10.1017 / S0022172400064822. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Johansson PJ, Bergentoft K, Larsson PA, Magnusson G, Widell A, Thorhagen M, Hedlund KO. Вспышка гастроэнтерита у взрослых, связанная с внутрибольничными саповирусами.Scand J Infect Dis. 2005. 37: 200–204. DOI: 10.1080 / 00365540410020974. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Усуку С., Кумазаки М., Китамура К., Точикубо О., Ногучи Ю. Вспышка пищевого гастроэнтерита, вызванного саповирусом, среди учеников младших классов средней школы. Jpn J Infect Dis. 2008. 61: 438–441. [PubMed] [Google Scholar]
Yamashita Y, Ootsuka Y, Kondo R, Oseto M, Doi M, Miyamoto T., Ueda T., Kondo H, Tanaka T, Wakita T. и др. Молекулярная характеристика саповируса, обнаруженного при гастроэнтерите вспышка в свадебном зале.J Med Virol. 2010. 82: 720–726. DOI: 10.1002 / jmv.21646. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Капикян А.З., Вятт Р.Г., Левин М.М., Блэк Р.Э., Гринберг Г.Б., Флорес Дж., Калица А.Р., Хошино Ю., Чанок Р.М. Исследования на добровольцах с ротавирусами человека. Dev Biol Stand. 1983; 53: 209–218. [PubMed] [Google Scholar]
Morris CA, Flewett TH, Bryden AS, Davies H. Эпидемический вирусный энтерит в детской палате длительного пребывания. Ланцет. 1975; 1: 4–5. [PubMed] [Google Scholar]
Родригес В.Дж., Ким Х.В., Брандт С.Д., Йолкен Р.Х., Ричард М., Арробио Д.О., Шварц Р.Х., Капикян А.З., Чанок Р.М., Парротт Р.Х.Распространенная вспышка гастроэнтерита, вызванного ротавирусом 2 типа, с высокой частотой вторичных атак в семьях. J Infect Dis. 1979; 140: 353–357. DOI: 10.1093 / infdis / 140.3.353. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Митчелл Д.К., Матсон Д.О., Кубитт В.Д., Джексон Л.Дж., Уиллкокс М.М., Пикеринг Л.К., Картер М.Дж. Распространенность антител к астровирусу 1 и 3 типов у детей и подростков в Норфолке, Вирджиния. Pediatr Infect Dis J. 1999; 18: 249–254. DOI: 10.1097 / 00006454-1990-00008. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Оливер С.Л., Асобайре Э., Дастджерди А.М., Бриджер Дж.Геномная характеристика неклассифицированного кишечного вируса крупного рогатого скота Newbury agent-1 (Newbury1) подтверждает новый род в семействе Caliciviridae. Вирусология. 2006; 350: 240–250. DOI: 10.1016 / j.virol.2006.02.027. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Сципиони А., Маурой А., Винье Дж., Тири Э. Норовирусы животных. Вет Дж. 2008; 178: 32–45. DOI: 10.1016 / j.tvjl.2007.11.012. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Норовирус. http://www.cdc.gov/norovirus/hcp/clinical-overview.html.
Китадзима М., Ока Т., Харамото Е., Фануван С., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Генетическое разнообразие норовирусов геногруппы IV в сточных водах в Японии. Lett Appl Microbiol. 2011; 52: 181–184. DOI: 10.1111 / j.1472-765X.2010.02980.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Китадзима М., Ока Т., Харамото Э., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Сезонное распределение и генетическое разнообразие норовирусов геногрупп I, II и IV в реке Тамагава, Япония . Environ Sci Technol. 2010; 44: 7116–7122.DOI: 10.1021 / es100346a. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Кол Е.О., Эпплтон Х. Электронно-микроскопические и физические характеристики небольших круглых фекальных вирусов человека: временная схема классификации. J Med Virol. 1982; 9: 257–265. DOI: 10.1002 / jmv.18403. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Каплан Дж. Э., Гэри Г. У., Барон Р. К., Сингх Н., Шонбергер Л. Б., Фельдман Р., Гринберг HB. Эпидемиология норволкского гастроэнтерита и роль вируса Норуолк в вспышках острого небактериального гастроэнтерита.Ann Intern Med. 1982; 96: 756–761. DOI: 10.7326 / 0003-4819-96-6-756. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Чиба С., Наката С., Нумата-Киношита К., Хонма С. Вирус Саппоро: история и недавние открытия. J Infect Dis. 2000; 181 (Дополнение 2): S303 – S308. [PubMed] [Google Scholar]
Dey SK, Phan TG, Nguyen TA, Nishio O, Salim AF, Yagyu F, Okitsu S, Ushijima H. Распространенность саповирусной инфекции среди младенцев и детей с острым гастроэнтеритом в городе Дакка, Бангладеш во время 2004–2005 гг.J Med Virol. 2007. 79: 633–638. DOI: 10.1002 / jmv.20859. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Blacklow NR, Greenberg HB. Вирусный гастроэнтерит. N Engl J Med. 1991; 325: 252–264. DOI: 10.1056 / NEJM1953250406. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Ноэль Дж.С., Лю Б.Л., Хамфри С.Д., Родригес Е.М., Лэмбден П.Р., Кларк И.Н., Дуайер Д.М., Андо Т., Гласс Р.И., Монро С.С. Вирус Парквилля: новый генетический вариант калицивируса человека в кладе вируса Саппоро, связанный со вспышкой гастроэнтерита у взрослых.J Med Virol. 1997. 52: 173–178. DOI: 10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199706) 52: 2 <173 :: AID-JMV10> 3.0.CO; 2-M. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Епископ РФ, Дэвидсон Г.П., Холмс И.Х., Рак Б.Дж. Вирусные частицы в эпителиальных клетках слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки у детей с острым небактериальным гастроэнтеритом. Ланцет. 1973; 2: 1281–1283. [PubMed] [Google Scholar]
Парашар Ю.Д., Гибсон С.Дж., Бресс Дж.С., Гласс Р.И. Ротавирус и тяжелая диарея у детей. Emerg Infect Dis. 2006. 12: 304–306. DOI: 10.3201 / eid1202.050006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Mackow E. In: Инфекции желудочно-кишечного тракта. Блазер М., Смит П., Равдин Дж., Гринберг Х., Геррант Р.Л., редактор. Нью-Йорк: Raven Press; 1995. Ротавирусы группы B и C; С. 983–1008. [Google Scholar]
Сантос Н., Хосино Ю. Глобальное распространение серотипов / генотипов ротавируса и его значение для разработки и внедрения эффективной ротавирусной вакцины. Rev Med Virol. 2005; 15: 29–56.DOI: 10.1002 / RMV.448. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Родригес В.Дж., Ким Х.В., Арробио Дж.О., Брандт С.Д., Чанок Р.М., Капикян А.З., Вятт Р.Г., Парротт Р.Х. Клинические особенности острого гастроэнтерита, связанного с реовирусоподобным агентом человека, у младенцев и детей раннего возраста. J Pediatr. 1977; 91: 188–193. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (77) 80810-X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Брандт С.Д., Ким Х.В., Родригес В.Дж., Арробио Д.О., Джеффрис Б.К., Столлингс Е.П., Льюис С., Майлз А.Дж., Чанок Р.М., Капикян А.З., Пэрротт Р.Х.Детский вирусный гастроэнтерит за восемь лет исследования. J Clin Microbiol. 1983; 18: 71–78. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Эдмонсон Л.М., Эбберт Дж. О., Эванс Дж. М.. Сообщение о вспышке ротавируса среди взрослого населения дома престарелых. J Am Med Dir Assoc. 2000; 1: 175–179. [PubMed] [Google Scholar]
Hrdy DB. Эпидемиология ротавирусной инфекции у взрослых. Rev Infect Dis. 1987; 9: 461–469. DOI: 10.1093 / Clinids / 9.3.461. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Гриффин М.Р., Суровец Дж. Дж., Макклоски Д.И., Капуано Б., Пьерзински Б., Куинн М., Войнарски Р., Паркин В.Е., Гринберг Н., Гэри Г.В.Норуолкский вирус пищевого происхождения. Am J Epidemiol. 1982; 115: 178–184. [PubMed] [Google Scholar]
Ганн Р.А., Яновски Х.Т., Либ С., Пратер Е.С., Гринберг Х.Б. Гастроэнтерит, вызванный вирусом Norwalk, возникший после употребления в пищу сырых устриц. Am J Epidemiol. 1982; 115: 348–351. [PubMed] [Google Scholar]
Malek M, Barzilay E, Kramer A, Camp B, Jaykus LA, Escudero-Abarca B, Derrick G, White P, Gerba C, Higgins C. и др. Вспышка норовирусной инфекции среди рек стропила, связанные с упакованным мясом деликатесов, Гранд-Каньон, 2005 г.Clin Infect Dis. 2009. 48: 31–37. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Саид MA, Perl TM, Sears CL. Эпидемиология здравоохранения: желудочно-кишечный грипп: норовирус в учреждениях здравоохранения и длительного ухода. Clin Infect Dis. 2008. 47: 1202–1208. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
O’Ryan M, Linhares AC. Последние новости о Rotarix: пероральная вакцина против ротавируса человека. Экспертные ревакцины. 2009. 8: 1627–1641. DOI: 10.1586 / erv.09.136. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита: систематический обзор
BMC Infect Dis.2013; 13: 446.
, ¹, ², ¹, ², ³, ⁴ и ²
Рейчел М. Ли
¹ Департамент международного здравоохранения, Джонс Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA
Justin Lessler
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США
Rose A Lee
¹ Department of International Health, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA
Kara E Rudolph
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Bloomberg Джонса Хопкинса, Балтимор, США
Николас Г. Райх
³ Отдел биостатистики и эпидемиологии , Школа общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США
Trish M Perl
⁴ Depar Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США
Дерек А.Т. Каммингс
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США
¹ Департамент Международного здравоохранения, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США
² Департамент эпидемиологии, Школа общественного здравоохранения Блумберга Джонса Хопкинса, Балтимор, США
³ Отдел биостатистики и эпидемиологии Школы общественного здравоохранения и медицинских наук, Массачусетский университет, Амхерст, Амхерст, США
⁴ Департамент медицины, Отделение инфекционных заболеваний, Медицинская школа Университета Джона Хопкинса, Балтимор, США
Автор, отвечающий за переписку.
Поступило 06 марта 2013 г .; Принято 12 сентября 2013 г.
Copyright © 2013 Lee et al .; лицензиат BioMed Central Ltd. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License (http://creativecommons.org/licenses/by/2.0), которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальная работа процитирована должным образом. Эта статья цитировалась в других статьях в PMC.
Дополнительные материалы
Дополнительный файл 1 Сравнение логарифмически нормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.
GUID: E778F8C8-667E-4C91-903D-7B3CCDE5DCA8
Резюме
Предпосылки
Точное знание инкубационного периода важно для исследования и контроля инфекционных заболеваний и их передачи, однако сведения об инкубационном периоде в литературе остаются часто не цитируются, противоречивы и / или не основаны на доказательствах.
Методы
При систематическом обзоре литературы по пяти кишечным вирусам, имеющим значение для общественного здравоохранения, мы нашли 256 статей с оценками инкубационного периода, в том числе 33 с данными для объединенного анализа.
Результаты
Мы подобрали логарифмически нормальное распределение для объединенных данных и обнаружили, что средний инкубационный период составляет 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) для астровируса, 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) для норовируса. геногрупп I и II, 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) для саповирусов и 2,0 дня (95% ДИ 1,4–2,4 дня) для ротавируса.
Выводы
Наши оценки объединяют опубликованные данные и предоставляют достаточные количественные данные, позволяющие использовать эти оценки в широком спектре клинических приложений и приложений для моделирования.Это может привести к улучшению мер профилактики и контроля в условиях передачи или риска передачи.
Ключевые слова: Инкубационный период, норовирус, ротавирус, калицивирусы, астровирус, систематический обзор
Предпосылки
Острый вирусный гастроэнтерит является важной и часто недооцениваемой причиной заболеваемости и смертности во всем мире. Почти все дети перенесли хотя бы одну ротавирусную инфекцию к пяти годам. Ежегодно на ротавирус приходится около двух миллионов госпитализаций и от 350 000 до 600 000 случаев смерти детей младшего возраста [1].Несколько исследований показали, что астровирус является важной причиной острого гастроэнтерита у детей раннего возраста; исследование распространенности в Соединенном Королевстве показало, что более 70% пятилетних детей имеют антитела к вирусу [2-6]. Астровирус также упоминается как важная причина гастроэнтерита у пожилых людей [7,8]. Калицивирусы, в частности норовирусы, являются наиболее важной причиной эпидемических небактериальных гастроэнтеритов во всем мире, поражают как взрослых, так и детей и составляют от 40 до 50% всех гастроэнтеритов пищевого происхождения в США [9,10].
Астровирус, ротавирус и калицивирусы являются важными причинами инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, и вспышек заболеваний в медицинских учреждениях [11]. Инкубационный период (время между заражением и появлением симптомов) важен для точного наблюдения за инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, и реализации эффективных мер борьбы со вспышками (например, когортирование и / или карантин). [12] Инкубационный период часто используется для определения заражающего воздействия во время вспышек болезней пищевого происхождения [13,14] и может помочь в диагностике, когда лабораторные ресурсы недоступны.Критерии Каплана были разработаны и часто используются для определения того, была ли вспышка вызвана норовирусом; инкубационный период — один из ключевых элементов этих критериев. [15] Другие применения точно описанного инкубационного периода включают в себя прогностические модели, которые используют инкубационный период для точного моделирования процесса заболевания, а продолжительность инкубационного периода по отношению к латентному периоду (время между заражением и переходом в инфекцию) определяет потенциальная эффективность мер контроля, нацеленных на лиц с симптомами [16].
Несмотря на важность, периоды инкубации кишечных вирусов недостаточно хорошо описаны в медицинской литературе. Информация об инкубационном периоде, как правило, состоит из одного числа («Инкубационный период ротавирусной болезни составляет приблизительно 2 дня» [17]) или плохо определенного диапазона («Инкубационный период для астровирусной болезни составляет от 1 до 5 дней…» [ 18]). Эти утверждения инкубационного периода трудно воплотить в реалии профилактики и контроля. Оценка с одним числом может представлять собой среднее значение, медианное значение, верхний предел или какой-либо другой показатель инкубационного периода.Диапазон может представлять собой исчерпывающий диапазон всех наблюдений или некоторый неопределенный квантиль (например, 95% доверительный интервал, внутренний 75% и т. Д.). Кроме того, часто неясна сила доказательств, лежащих в основе этих оценок. Заявления об инкубационном периоде часто не включают цитату, а когда цитируется, следование цепочке цитирований часто показывает, что оценка основана на ограниченных доказательствах [19].
Мы проанализировали литературу по пяти кишечным вирусам, отобранным с учетом их важности для общественного здравоохранения: астровирусу, калицивирусам (геногруппы норовирусов I и II и саповирусы) и ротавирусу.Посредством систематического обзора и анализа опубликованных оценок и данных мы стремимся (1) зафиксировать консенсус в медицинской литературе по этим инкубационным периодам, (2) охарактеризовать доказательства, лежащие в основе этого консенсуса, и (3) предоставить улучшенные оценки инкубационных периодов для эти инфекции. Поступая таким образом, мы надеемся, что инкубационный период будет использоваться в большем количестве приложений и выявить те области, в которых необходимы дополнительные исследования.
Методы
В этом систематическом обзоре в основном использовались методы, описанные в Lessler et al., 2009 [20]. Подробности и различия в подходах описаны ниже.
Стратегия поиска и критерии выбора
Для каждого вируса мы провели поиск в PubMed, Google Scholar и ISI Web of Knowledge 4.0, как описано Lessler et al., 2009 [20]. В PubMed мы искали слова «инкубация», «период» и название вируса, в Google Scholar мы искали фразы «инкубационный период [название вируса]» и «инкубационный период для [название вируса]», а также ISI Web of Knowledge мы искали по «инкубационному периоду» и названию вируса [20].Поиски проводились в период с 20 января 2011 г. по 16 августа 2011 г., без ограничений по самой ранней дате возврата статей. Общие варианты названия каждого вируса использовались в каждой базе данных, в частности, «астровирус», «калицивирус», «норовирус», «вирус Норо», «Норуолк», «Норуолк-подобный», «NLV», «NLV», «SRSV». »,« Зимняя рвота »,« Hyperemesis hiemis »,« Снежная гора »,« саповирус »,« вирус Саппоро »,« Саппороподобный вирус »,« ротавирус »,« дуовирус »,« агент, подобный реовирусу человека », и «агент инфантильного гастроэнтерита».Мы также рассмотрели четыре широко используемых справочника по инфекционным заболеваниям [11,21-23]. Тезисы рецензировались двумя рецензентами независимо друг от друга. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса. Этот обзор соответствует контрольным спискам систематических обзоров PRISMA и QUORUM.
Оценка
Документы, включенные в полнотекстовый обзор, были классифицированы как содержащие (1) оценку инкубационного периода, основанную на исходных данных и / или анализе, (2) отчет об инкубационном периоде (т. Е. Предоставленную цитату), (3) ) отчет об инкубационном периоде без источника (т.д., без ссылки) или (4) без указания инкубационного периода. Все документы были также проверены на предмет данных индивидуального уровня, пригодных для объединенного анализа. Полные тексты рецензировались независимо двумя рецензентами. Расхождения были устранены путем обсуждения и консенсуса.
Абстракция данных
Отчеты инкубационного периода и данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа, были извлечены, как описано в Lessler et al., 2009 [20]. Поскольку во многих вспышках болезней пищевого происхождения, описанных в литературе, не сообщалось о точном времени приема пищи, мы установили стандартные интервалы воздействия, которые использовались при абстрагировании данных на индивидуальном уровне для исследований, в которых время приема пищи было указано как просто «завтрак», «обед» или «обед».Воздействие во время завтрака считалось периодом между 0:00 и 10:00, обедом между 10:00 и 14:00 и ужином между 14:00 и 0:00. Мы сообщаем диапазон инкубационных периодов таким образом, чтобы инкубационный период в этом диапазоне соответствовал прогнозам большинства исследователей (т.е.согласовался с более чем 50% опубликованных оценок) и модальным утверждением центральной тенденции.
Объединенный анализ
Сартвелл и другие показали, что натуральный логарифм инкубационных периодов острых инфекционных заболеваний имеет тенденцию к нормальному распределению; следовательно, инкубационный период следует логарифмически нормальному распределению, определяемому средним инкубационным периодом и коэффициентом дисперсии [20,24-26].При нормальном распределении примерно две трети данных попадают в одно стандартное отклонение от среднего; аналогично при логнормальном распределении примерно в двух третях случаев развиваются симптомы между медианной / дисперсией и медианной × дисперсией. Для каждого патогена все наблюдения были объединены в единый набор двухинтервальных цензурированных наблюдений; каждая точка данных содержала диапазон возможных времен воздействия, например «обед», и диапазон возможных времен появления симптомов.Поскольку время воздействия и появления симптомов редко сообщается точно, минимальный временной интервал, который мы рассмотрели, составлял один час. Если сообщалось, что время появления симптома составляет 17:00, мы записывали время появления симптома между 17:00 и 18:00. Оценки максимального правдоподобия были получены с использованием пакета coarseDataTools для R [25,27]. Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций). Объединенные данные для каждой геногруппы норовирусов были проанализированы индивидуально, данные из геногрупп I и II были проанализированы вместе, и, наконец, все данные о калицивирусах человека (как геногруппы норовирусов, так и саповирусы) были объединены и проанализированы.Для выбора подходящих групп использовались байесовский информационный критерий и оценка клинически значимых различий в оценках. Результаты инкубационного периода, полученные с использованием логнормального распределения, сравнивались с результатами, полученными с использованием распределений Вейбулла и гамма-распределения; квантильные оценки оказались согласованными между распределениями (см. дополнительный файл 1). Все анализы были выполнены с использованием статистического пакета R (версия 2.11). Конкретные оценки, содержащиеся в этом обзоре, все данные, использованные в объединенном анализе, и полная библиография доступны у авторов по запросу.В помощь разработчикам моделей результаты подгонки данных с использованием распределения Эрланга доступны в дополнительных материалах (Дополнительный файл 1).
Результаты
Мы идентифицировали 256 статей с одним или несколькими заявлениями об инкубационном периоде (рисунок). Из 317 оценок, включенных в эти статьи, 91 (29%) были оригинальными, 137 (43%) давали источник, а 89 (28%) не предоставляли источник (таблица). 33 статьи содержали данные на индивидуальном уровне, подходящие для объединенного анализа (таблица). Шесть (18%) исследований были экспериментальными, а 27 (82%) — наблюдательными.В таблице приведены инкубационные периоды, указанные в литературе, и исходные данные. Оценки инкубационного периода норовирусов получили наибольшую поддержку (23 исследования). Оценка саповирусов была подтверждена меньшим количеством исследований, но эти исследования были относительно большими. Для ротавируса и астровируса было доступно менее 20 наблюдений. Оценки полного распределения каждого инкубационного периода с использованием объединенных данных показаны на рисунке и в таблице. Это обеспечивает периоды, когда 5%, 25%, 50%, 75% и 95% случаев станут симптоматическими.Мы показываем только 5-й и 95-й процентили, когда было более 20 наблюдений для отдельного вируса. Медиана инкубационного периода варьировала от 1,1 дня (для норовирусов I геногруппы) до 4,5 дня (для астровируса). Разброс от 1,22 до 1,82. Полные распределения, наложенные на гистограммы данных латентного периода, показаны на рисунке.
Процесс систематического обзора.
Таблица 1
Сводка оценок инкубационного периода в опубликованной литературе
9017
Исходные оценки
33 Саповирус33
62 89 (28%)
Литературные оценки * (дни)
Количество оценок (%)
Участники экспериментальных исследований (n ) ^ψ
Диапазон Central Tendency Оценки без источника Оценки из источников Исходные оценки 1-5
3
8 (40%)
7 (35%)
5 (25%) [1/4]
1
Калицивирусы
Норовирус
1-2
1
39 (22%)
74 (43%)
60 (35%) [15/45]
189
Геногруппы I и II

2
5 (36%)
2 (14%)
7 (50%) [0/7]
—
Ротавирус
1-4 2
37 (34%)
54 (49%)
19 (17%) [6/13]
42
Всего — — 137 (43%) 91 (29%) [22/69] 232
Таблица 2
Исследования, включенные в объединенный анализ
Местоположение Тип исследования N Население ion Комментарии
Астровирус
Kurtz et al.(1979) [28]
UK
Экспериментальный
4
Взрослые добровольцы в возрасте 18–50 лет
—
Midthun et al. (1993) [29]
USA
Экспериментальный
1
Взрослый доброволец
—
Mitchell et al. (1993) [30]
США
Наблюдательные
5
Дети в возрасте 6–30 месяцев
Вспышка в дневном стационаре
Калицивирусы
2 Норовирус
Геногруппа I
Baron et al.(1982) [31]
США
Наблюдательный
132
Взрослые и дети в возрасте от 9 месяцев до 59 лет
Вспышка, связанная с купанием в озере
Becker et al. (2000) [32]
США
Наблюдательный
54
Мужчины, футболисты колледжа
Вспышка, связанная с упакованными ланчами
Dolin et al.(1971) [33]
США
Экспериментальный
5
Заключенные-мужчины в возрасте 18–45 лет
—
Gill et al. (1983) [34]
UK
Наблюдательный
127
Взрослые
Вспышка, связанная с потреблением сырых устриц
Hicks et al. (1996) [35]
UK
Observational
31
Гости на свадебном приеме
—
Hoebe et al.(2004) [36]
Нидерланды
Наблюдательный
90
Дети в возрасте 4–12 лет
Вспышка, связанная с игрой в зараженном фонтане
Курицкий и др. (1984) [37]
США
Наблюдательный
126
Взрослые и дети, посещающие любое из четырех общественных мероприятий с питанием
Вспышка, связанная с употреблением в пищу замороженных хлебобулочных изделий, приготовленных плохим кулинаром Linco et al.(1980) [38]
Австралия
Наблюдательный
24
Гости на рождественском ужине
Вспышка, связанная с употреблением сырых устриц
Matsuhashi et al. (2003) [39]
Япония
Наблюдательный
1
Взрослый врач-мужчина
Заболевание, связанное с выполнением колоноскопии у двух инфицированных лиц
MMWR 9016 (2000) [2000] USA
Observational
209
Взрослые
Oubreak, связанный с поеданием картофельного салата на корпоративном обеде
Taylor et al.(1981) [41]
США
Наблюдательный
329
Дети в возрасте 5-12 лет
Вспышка, связанная с зараженной питьевой водой в начальной школе
02 Норовирус
Genogroup II
de Wit et al. (2007) [42]
Нидерланды
Наблюдательный
229
Мужчины и женщины в возрасте 17–63 лет
Вспышка, связанная с обедом для персонала
Dolin et al.(1982) [43]
США
Экспериментальный
9
Взрослые добровольцы
—
Gaulin et al. (1999) [44]
Канада
Observational
43
Посетители, посещающие рождественский ужин в ресторане
—
Gotz et al. (2002) [45]
Швеция
Наблюдательный
173
114 детей в возрасте 1–10 лет и 79 взрослых в возрасте 20–61 лет
Вспышка, связанная с обслуживанием обедов в 30 детских садах
Grotto et al.(2004) [13]
Израиль
Наблюдательный
162
Солдаты мужского и женского пола, дислоцированные на военной базе
Вспышка, связанная с салатом из столовой
Hirakata et al. (2005) [46]
Япония
Наблюдательный
628
Учащиеся начальной, младшей и старшей школы
Мексиканский агент. Вспышка, связанная с обедом в ресторане во время экскурсии
Исакбаева и др.(2005) [47]
США
Наблюдательный
2
Взрослая женщина и ребенок
Вспышка, связанная с контактом с больным ребенком во время двухчасовой игровой группы
Kirking et al. (2010) [48]
США
Наблюдательный
7
Взрослые и дети в возрасте 11–73 лет
Вспышка, связанная с воздействием рвотных масс в виде аэрозолей в самолете
.(2000) [49]
UK
Observational
43
Посетители обедают в большом отеле
—
Marshall et al. (2001) [50]
Австралия
Наблюдательный
46
Посетители ресторана
Вспышка, связанная с употреблением зараженной пищи в буфете
Thornhill et al. (1977) [51]
США
Экспериментальный
1
Взрослый доброволец
Гавайский агент
Труман и др.(1987) [52]
США
Наблюдательный
84
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 16–74 лет
Вспышка, связанная с поеданием моллюсков на организованном мероприятии
Sapovirus
Хамфри и др. (1984) [53]
UK
Observational
14
Один ребенок в возрасте 3 лет, девять мужчин и женщин в возрасте 65–95 лет, 5 взрослых мужчин и женщин в возрасте 18–65 лет
Вспышка в учреждении по уходу за престарелыми и в семье, которая владела учреждением
Johansson et al.(2005) [54]
Швеция
Наблюдательный
9
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 25–84 лет
Инфекция в больницах
Usuku et al. (2008) [55]
Япония
Наблюдательный
65
Шестьдесят учеников третьего класса и пять взрослых
Вспышка, связанная с рестораном в отеле
Yamashita et al.(2010) [56]
Япония
Наблюдательный
18
Взрослые мужчины и женщины в возрасте 20–70 лет
Вспышка после свадебного приема
Ротавирус Капикян и др. (1983) [57]
США
Экспериментальный
4
Взрослые добровольцы
—
Morris et al.(1975) [58]
UK
Наблюдательный
1
Детский
Инфекция в больницах
Rodriguez et al. (1979) [59] USA Observational 6 Две взрослые женщины и 4 ребенка в возрасте 18–24 месяцев Вспышка после игровой группы
Кумулятивное распределение инкубационного периода. Показан совокупный процент случаев, в которых симптомы развиваются к определенному дню согласно оценкам логнормального распределения.Доверительные интервалы рассчитывались методом начальной загрузки (500 итераций).
Таблица 3
Процентили времени появления симптомов и дисперсии для распределения заболеваний
751-1 9326
Оценка (95 % ДИ) времени появления симптомов (дни) 24 * 901
Дисперсия (95 % ДИ)
5-й процентиль 25-й процентиль 50-й процентиль121 9011
Астровирус
—
4.0 (3,5-4,9)
4,5 (3,9-5,2)
5,3 (4,4-5,8)
—
1,22 (1,04-1,30)
Калицивирусы
^**
0,5 (0,5-0,5)
0,9 (0,8-0,9)
1,2 (1,1-1,2)
1,7 (1,6-1,7)
2,6 (2,6- 2,8)
1,64 (1,61-1,71)
Геногруппа I ^α
0.4 (0,4-0,5)
0,8 (0,7-0,8)
1,1 (1,1-1,2)
1,6 (1,6-1,7)
3,0 (2,8-3,2)
1,82 (1,75-1,90 )
Genogroup II ^β
0,6 (0,5-0,6)
0,9 (0,9-1,0)
1,2 (1,2-1,3)
1,6 (1,6 )
2,5 (2,4-2,6)
1,56 (1,49-1,62)
Саповирусы ^***
0.9 (0,7-1,0)
1,3 (1,1-1,4)
1,7 (1,5-1,8)
2,3 (2,0-2,4)
3,3 (2,7-3,8)
1,48 (1,36-1,61 )
Ротавирус — 1,6 (1,1-1,9) 2,0 (1,4-2,4) 2,5 (1,8-3,0) — 1,37 (1,25-1,73)
Кумулятивные распределения данных инкубационного периода и латентного периода.
Астровирус
Астровирус передается фекально-оральным путем [22].Клинические симптомы включают диарею, боль в животе, головную боль, недомогание и рвоту, хотя рвота при астровирусной инфекции встречается реже, чем при ротавирусной или калицивирусной инфекциях [11,22]. Кроме того, астровирус с меньшей вероятностью вызывает обезвоживание или госпитализацию, чем ротавирус [2].
Мы нашли 20 оценок инкубационного периода астровируса, включая пять исходных оценок, семь оценок с источниками и восемь оценок, для которых исходный источник не был предоставлен (оценки без источников).Заявления об инкубационном периоде обычно составляли от 1 до 5 дней (таблица). Было обнаружено три оригинальных исследования, содержащих данные, подходящие для объединенного анализа: два экспериментальных исследования с участием взрослых добровольцев [28,29] и обсервационное исследование, описывающее серию вспышек в детском центре в Хьюстоне, штат Техас, США [30]. На основе этих трех исследований мы оцениваем средний инкубационный период гастроэнтерита, вызванного астровирусом, в 4,5 дня (95% ДИ 3,9-5,2 дня) с разбросом 1,22 (95% ДИ 1.04-1.30) (таблица). В 25% случаев симптомы проявляются через 4,0 дня (95% ДИ 3,5–4,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 5,3 дня (95% ДИ 4,4–5,8 дней) (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались. Немногие взрослые добровольцы проявляли симптомы при заражении астровирусом [28,30], что свидетельствует о низкой патогенности вируса у взрослых, которые могут быть защищены антителами, приобретенными в детстве [4,60]. Поскольку данные исследований взрослого заражения включают 50% абстрагируемых данных, подходящих для объединенного анализа на астровирус, наши результаты инкубационного периода могут быть неприменимы к первичным инфекциям или инфекциям у детей.
Калицивирусы
Калицивирусы (т. Е. Семейство Caliciviridae ) классически содержат четыре рода, два из которых, норовирус и саповирус , вызывают острый гастроэнтерит у людей [11]. Было предложено, что пятый род калицивирусов включает два генотипа кишечного вируса крупного рогатого скота [61]. Норовирусы разделены на пять антигенно различных геногрупп, три из которых (I, II и IV) вызывают заболевания у людей [62,63]. Норовирусы геногруппы IV были охарактеризованы в сточных водах и речной воде, но, насколько нам известно, не были причастны к вспышкам заболеваний, поэтому в данном обзоре основное внимание будет уделено норовирусам и саповирусам геногрупп I и II [64,65].Важно отметить, что недавние вспышки этих вирусов связаны с увеличением заболеваемости и смертности. Норовирусы и саповирусы передаются фекально-оральным путем и имеют несколько разные клинические проявления [11].
Используя байесовский информационный критерий, мы определили, что все три геногруппы калицивируса человека статистически различаются с точки зрения распределения их инкубационного периода. Однако оценки инкубационных периодов, эпидемиологии и клинических проявлений калицивирусов геногрупп I и II для практических целей очень похожи [43,66].Мы предлагаем рассматривать эти две геногруппы, норовирусы, с одинаковым инкубационным периодом. Саповирусы имеют отличную эпидемиологию и клинические проявления от норовирусов геногрупп I и II, и их следует рассматривать как отдельную группу вирусов.
Норовирусы (геногруппы I и II)
Норовирусы вызывают примерно 90% всех вспышек эпидемического гастроэнтерита и являются важным источником вспышек болезней пищевого происхождения во всем мире [9,10,22]. Хотя передача происходит в основном фекально-оральным путем, имеются также свидетельства передачи через рвотные массы [48].Клинические симптомы включают спазмы в животе, тошноту, частую рвоту и диарею [22]. Большинство опубликованных оценок норовирусов соответствовало инкубационному периоду от 1 до 2 дней (таблица).
Выявлен 131 документ с указанием инкубационного периода норовирусов. Эти документы содержали 60 исходных оценок, 74 оценки из источников и 39 оценок без источников. 54% всех полученных оценок инкубационного периода норовирусов цитировали одну из двух статей Kaplan et al.[15,67], или сослался на статью, в которой цитируется одна или обе эти статьи. Каплан и его коллеги объединили данные 38 вспышек норовируса в период с 1967 по 1980 год и предложили четыре критерия, которые можно использовать для характеристики вспышек норовируса: (1) посев кала, свободный от бактериальных патогенов, (2) средняя или средняя продолжительность болезни 12–60 часов, (3) рвота в ≥ 50% случаев и (4) средний или средний инкубационный период 24–48 часов [67]. Большинство опубликованных оценок инкубационного периода норовирусов соответствовали критериям Каплана (таблица).
На основании 2540 наблюдений из 20 обсервационных исследований и 15 наблюдений из трех экспериментальных исследований, мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов в 1,2 дня (95% ДИ 1,1-1,2 дня) с дисперсией 1,64 (95% ДИ 1,61- 1.71). В 5% случаев норовируса симптомы проявляются через 0,5 дня (95% ДИ 0,5–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы становятся симптоматическими через 2,6 дня (95% ДИ 2,6–2,8 дня) (таблица).
Геногруппа I
На основании 1123 наблюдений из десяти наблюдательных исследований и пяти наблюдений из одного экспериментального исследования [33] мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы I как 1.1 день (95% ДИ 1,1–1,2 дня) с дисперсией 1,82 (95% ДИ 1,75–1,90). В 5% случаев норовируса геногруппы I симптомы проявляются через 0,4 дня (95% ДИ 0,4–0,5 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы разовьются через 3,0 дня (95% ДИ 2,8–3,2 дня) (таблица).
Геногруппа II
Основываясь на десяти наблюдениях из двух экспериментальных исследований [43,51] и 1417 оценках из десяти обсервационных исследований [46,49], мы оцениваем средний инкубационный период для норовирусов геногруппы II как 1.2 дня (95% ДИ 1,2–1,3 дня) с дисперсией 1,56 (95% ДИ 1,49–1,62). В 5% случаев норовируса геногруппы II симптомы проявляются через 0,6 дня (95% ДИ 0,5–0,6 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 2,4–2,6 дня) (таблица).
Саповирусы
Саповирусы в первую очередь вызывают гастроэнтерит у младенцев и детей и не являются важными патогенами при вспышках болезней пищевого происхождения [68]. Клинические симптомы включают рвоту, обезвоживание, боль в животе и, в меньшей степени, диарею и лихорадку [69].Опубликованные оценки саповирусов соответствовали инкубационному периоду 1-3 дня (таблица).
Выявлено 13 документов, содержащих 14 отчетов об инкубационном периоде саповирусов. Эти документы содержали семь исходных оценок, две оценки из источников и пять оценок без источников. Цитируемыми источниками были обзорная статья Блэклоу и Гринберга [70], в которой содержалась оценка без источника, и результаты наблюдательного исследования Ноэля и его коллег [71], описывающие вспышку штамма вируса Парквилл.
Основываясь на 106 наблюдениях из четырех обсервационных исследований [53-56], мы оцениваем средний инкубационный период саповирусов в 1,7 дня (95% ДИ 1,5–1,8 дня) с дисперсией 1,48 (95% ДИ 1,36–1,61) . В 5% случаев симптомы проявляются через 0,9 дня (95% ДИ 0,7–1,0 дня) после заражения, а в 95% случаев симптомы проявляются через 3,3 дня (95% ДИ 2,7–3,8 дня) (таблица).
Ротавирус
Ротавирус передается фекально-оральным путем [22,72]. Ротавирус группы А вызывает более 600 000 случаев смерти младенцев и детей младшего возраста в год, в основном в развивающихся странах [73].Ротавирусы группы B преимущественно наблюдались во взрывных вспышках среди взрослых в Китае [11,74]. Ротавирусы группы C, по-видимому, не имеют значения для общественного здравоохранения [11,74]. Распространенность серотипов ротавирусов в этих группах варьируется в разных частях мира, что чрезвычайно затрудняет широкомасштабную эффективную борьбу с заболеванием [75]. Клинические симптомы включают лихорадку и рвоту, за которыми следует обильная водянистая диарея и обезвоживание [76]. Инфекции, вызывающие острое заболевание, возникают преимущественно в возрасте от 6 до 24 месяцев [76,77].У взрослых инфекции обычно протекают бессимптомно, однако заболевание было вызвано экспериментально у взрослых и описаны вспышки среди взрослого населения [11,57,78,79].
Мы нашли 110 оценок инкубационного периода ротавируса, включая 19 исходных оценок, 54 оценки с источниками и 37 оценок без источников. Большинство опубликованных оценок ротавируса соответствовали двухдневному инкубационному периоду (таблица).
Основываясь на четырех наблюдениях из одного экспериментального исследования на взрослых добровольцах [57] и шести наблюдениях из двух наблюдательных исследований [58,59], мы оцениваем средний инкубационный период ротавируса как 2.0 дней (95% ДИ 1,4–2,4 дня) с дисперсией 1,37 (1,25–1,73). В 25% случаев ротавирус становится симптоматическим через 1,6 дня (95% ДИ 1,1–1,9 дня), а в 75% случаев симптомы проявляются через 2,5 дня (95% ДИ 1,8–3,0 дня) после заражения (таблица). Из-за ограниченности данных 5-й и 95-й процентили не оценивались.
Обсуждение
Оценка инкубационного периода инфекционных заболеваний, включая гастроэнтерит, имеет решающее значение для обоснования и обоснованности вмешательств, направленных на прерывание текущей передачи.В нашем обзоре трех основных вирусных причин гастроэнтерита мы обнаружили, что 61% из 226 оценок инкубационного периода даны со ссылкой. После изучения деревьев цитирования для этих оценок только 114 (50%) из 226 были фактически основаны на данных. Двадцать три (17%) оценок, полученных из источников, процитировали статью, которая содержала оценку без источников. Эти данные показывают, что инкубационные периоды кишечных вирусов часто считаются общеизвестными. Из источников, основанных на данных, большинство для каждого вируса можно проследить до оценок из небольшого числа оригинальных исследований, таких как Kaplan et al.статьи для геногрупп I и II норовирусов [15,67].
Были некоторые опасения, что отдельные исследования потенциально могут иметь чрезмерное влияние на объединенный анализ. Мы провели анализ чувствительности, удалив все исследования и пересчитав оценки инкубационного периода. Мы не обнаружили качественной разницы в результатах.
Определение инкубационного периода ограничено степенью неопределенности относительно времени заражения. Поскольку инкубационные периоды вирусного гастроэнтерита короткие, во время вспышки часто бывает трудно различить первичный и вторичный случаи.Это затрудняет получение точной информации об интервале экспозиции. Большинство обсервационных исследований, особенно исследований вспышек пищевого происхождения, решают эту проблему, рассматривая только случаи в течение определенного количества дней после заражения [34,36,37,42,44,52,80-82]. Этот метод выявления случаев может внести систематическую ошибку за счет исключения случаев, попадающих в хвостовую часть распределения инкубационного периода. Несмотря на то, что существует множество наблюдательных исследований, описывающих вспышки, вызванные ротавирусом и астровирусом, поскольку невозможно определить интервал воздействия для отдельных случаев, данные этих исследований не могут использоваться для определения инкубационного периода.
Множество факторов могут привести к тому, что данные экспериментальной инфекции будут отличаться от данных естественной инфекции, например, инфекционная доза или добровольцы, чей статус хозяина отличается от такового в общей популяции. Например, единственное экспериментальное исследование, внесшее данные в объединенный анализ ротавируса, проводилось с поиском добровольцев с низким уровнем антител в сыворотке [57]. Эти предубеждения усугубляются невозможностью проведения экспериментальных исследований проблем среди групп населения, наиболее подверженных риску заболеваний, среди детей и пожилых людей.Это особенно верно в отношении ротавируса и астровируса, болезней, от которых почти всегда страдают маленькие дети.
Этот обзор был ограничен включением только опубликованных данных и условиями поиска. Из-за того, что мы включили некоторую форму «инкубационного периода» в поиск статей, вся литература по каждому вирусу не рассматривалась. Наши оценки для астровируса и ротавируса основаны на трех исследованиях и менее чем 20 наблюдениях. Из-за трудностей экспериментального изучения этих заболеваний необходимы тщательные наблюдательные исследования, чтобы получить больше доказательств, подтверждающих инкубационный период и его распространение.
Точное знание инкубационного периода особенно важно для вирусного гастроэнтерита из-за короткой продолжительности инкубационного периода, относительно высокой частоты вторичных атак и возможности возникновения вспышек заболеваний, связанных с оказанием медицинской помощи. Как ротавирус, так и норовирус особенно трудно контролировать в медицинских учреждениях [11,83]. Фишер и его коллеги определили, что в среднем 27% пациентов в развитых странах и 32% пациентов в развивающихся странах, выписанных с диагнозом ротавирус, заразились этим вирусом в больнице [17].Кроме того, инкубационный период является важным компонентом серийного интервала (разница во времени появления симптомов в случае и в случае инфицирования), который является одним из основных факторов, определяющих скорость распространения эпидемий в популяции.
Несмотря на лицензирование двух безопасных и эффективных вакцин, ротавирус продолжает оставаться важной проблемой общественного здравоохранения. Это особенно верно в развивающихся странах, где происходит подавляющее большинство ротавирусных заболеваний и смертей, и где ротавирусная вакцина имеет самую низкую эффективность [84].Точное знание инкубационного периода важно для понимания динамики ротавирусной болезни и борьбы с ней. По мере того, как охват вакцинацией улучшается и ротавирусная инфекция перестает быть повсеместной, инкубационный период будет полезен для изучения воздействия патогенов, связанного с неэффективностью вакцинации, и потенциальных различий в восприимчивости хозяев к инфекции.
Заключение
Следуя нашей работе по оценке инкубационного периода респираторных вирусов [20], в этом обзоре мы объединили опубликованные данные для оценки инкубационных периодов пяти кишечных вирусов, важных для общественного здравоохранения.Как правило, опубликованные оценки инкубационного периода описывают только центральную тенденцию или указывают на неопределенный диапазон, однако знание распределения всего инкубационного периода важно для полного понимания динамики заболевания и потенциальной эффективности мер контроля. Это особенно верно в условиях, когда инфекции могут быть взрывоопасными и иметь огромное влияние на результаты лечения пациентов. Наши оценки обеспечивают дополнительный уровень детализации, необходимый для этих и других приложений, что делает инкубационный период более полезным для исследований, клинической практики и политики общественного здравоохранения.
Конкурирующие интересы
Авторы заявляют об отсутствии конкурирующих интересов.
Вклад авторов
RML провела систематический обзор и анализ данных, а также подготовила рукопись. JL провел анализ данных и помог составить рукопись. RAL и KER провели систематический обзор. JL, DATC, TMP и NGR участвовали в разработке и концепции исследования. Все авторы прочитали и одобрили окончательную рукопись.
Дополнительные материалы
Дополнительный файл 1:
Сравнение логнормального, гамма-распределений, распределений Вейбулла и Эрлинга.
Благодарности
Работа JL над этим проектом была профинансирована за счет гранта Фонда Билла и Мелинды Гейтс (Инициатива по моделированию вакцин, 705580–3), и он является лауреатом премии NIH в области развития научных исследований (NIAID, K22). AI0-01). KER финансировался Отделом программ интромуральных исследований Национального института психического здоровья.
Ссылки
Parashar UD, Hummelman EG, Bresee JS, Miller MA, Glass RI. Заболевания и смертность детей от ротавирусной инфекции в мире.Emerg Infect Dis. 2003. 9: 565–572. DOI: 10.3201 / eid0905.020562. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Деннехи PH, Нельсон С.М., Спангенбергер С., Ноэль Дж. С., Монро С. С., Гласс Р. И.. Проспективное исследование «случай – контроль» роли астровируса в острой диарее среди госпитализированных маленьких детей. J Infect Dis. 2001; 184: 10–15. DOI: 10,1086 / 321007. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Herrmann JE, Taylor DN, Echeverria P, Blacklow NR. Астровирусы как причина гастроэнтерита у детей.N Engl J Med. 1991; 324: 1757–1760. DOI: 10.1056 / NEJM19
03242501. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Курц Дж., Ли Т. Распределение антител по возрасту астровирусного гастроэнтерита. Med Microbiol Immunol. 1978; 166: 227–230. DOI: 10.1007 / BF02121154. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Родригес-Баез Н., О’Брайен Р., Цю С.К., бас-мастер. Астровирус, аденовирус и ротавирус у госпитализированных детей: распространенность и связь с гастроэнтеритом. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2002. 35: 64–68.DOI: 10.1097 / 00005176-200207000-00014. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Шастри С., Доан А.М., Гонсалес Дж., Упадхьяюла У., бас-мастер. Распространенность астровирусов в детской больнице. J Clin Microbiol. 1998. 36: 2571–2574. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Lewis DC, Lightfoot NF, Cubitt WD, Wilson SA. Вспышки астровируса типа 1 и ротавирусного гастроэнтерита в гериатрических стационарах. J Hosp Infect. 1989; 14: 9–14. DOI: 10.1016 / 0195-6701 (89)
-X.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Gray JJ, Wreghitt TG, Cubitt WD, Elliot PR. Вспышка гастроэнтерита в доме престарелых, связанная с астровирусом 1 типа и калицивирусом человека. J Med Virol. 1987. 23: 377–381. DOI: 10.1002 / jmv.18410. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Технические данные. http://www.cdc.gov/norovirus/php/illness-outbreaks.html.
Долин Р. Норовирусы — проблемы, которые нужно контролировать. N Engl J Med. 2007; 357: 1072–1073. DOI: 10.1056 / NEJMp078050.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хоули П., Книп Д., Филдс Б. Вирусология Филдса, 5-е изд. Филадельфия: Липпинкотт, Уильямс и Уилкинс; 2007. [Google Scholar]
Lessler J, Brookmeyer R, Perl TM. Оценка правил классификации на основе даты появления симптомов для выявления инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи. Am J Epidemiol. 2007. 166: 1220–1229. DOI: 10,1093 / AJE / kwm188. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Grotto I, Huerta M, Balicer RD, Halperin T, Cohen D, Orr N, Gdalevich M.Вспышка норовирусного гастроэнтерита на израильской военной базе. Инфекционное заболевание. 2004. 32: 339–343. DOI: 10.1007 / s15010-004-4002-3. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Schmid D, Stuger HP, Lederer I, Pichler AM, Kainz-Arnfelser G, Schreier E, Allerberger F. Вспышка норовируса пищевого происхождения из-за салата, приготовленного вручную, Австрия, 2006 г. Инфекция. 2007. 35: 232–239. DOI: 10.1007 / s15010-007-6327-1. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Каплан Дж. Э., Фельдман Р., Кэмпбелл Д. С., Лукабо К., Гэри Г. У.Частота болезни, аналогичной норволкской, во вспышках острого гастроэнтерита. Am J Public Health. 1982; 72: 1329–1332. DOI: 10.2105 / AJPH.72.12.1329. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Фрейзер С., Райли С., Андерсон Р.М., Фергюсон Н.М. Факторы, позволяющие контролировать вспышку инфекционного заболевания. Proc Natl Acad Sci USA. 2004. 101: 6146–6151. DOI: 10.1073 / pnas.0307506101. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Fischer TK, Bresee JS, Glass RI.Ротавирусные вакцины и профилактика госпитальной диареи у детей. Вакцина. 2004; 22 (Приложение 1): S49 – S54. [PubMed] [Google Scholar]
Blacklow NR, Herrmann JE. Астровирусный гастроэнтерит. Trans Am Clin Climatol Assoc. 1995; 106: 58–66. обсуждение 66–58. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Рейх Н.Г., Perl TM, Каммингс Д.А., Лесслер Дж. Визуализация клинических данных: сети цитирования для инкубационных периодов респираторных вирусных инфекций. PLoS One. 2011; 6: e19496.DOI: 10.1371 / journal.pone.0019496. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Lessler J, Reich NG, Brookmeyer R, Perl TM, Nelson KE, Cummings DA. Инкубационные периоды ОРВИ: систематический обзор. Lancet Infect Dis. 2009; 9: 291–300. DOI: 10.1016 / S1473-3099 (09) 70069-6. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хейманн Д. Руководство по борьбе с инфекционными заболеваниями. 19. Вашингтон, округ Колумбия: Американская ассоциация общественного здравоохранения; 2008 г.[Google Scholar]
Манделл Дж., Беннет Дж., Долин Р. Принципы и практика инфекционных заболеваний. Филадельфия: Черчилль Ливингстон; 2005. [Google Scholar]
Пикеринг Л. Красная книга: отчет Комитета по инфекционным болезням за 2009 год. 28. Элк-Гроув-Виллидж, Иллинойс: Американская академия педиатрии; 2009. 225, 241-242, 576-579. [Google Scholar]
Каулинг Б.Дж., Мюллер М.П., Вонг И.О., Хо Л.М., Луи М., МакГир А., Леунг Г.М. Альтернативные методы оценки распределения инкубации: примеры из тяжелого острого респираторного синдрома.Эпидемиология. 2007. 18: 253–259. DOI: 10.1097 / 01.ede.0000254660.07942.fb. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Рейх Н.Г., Лесслер Дж., Каммингс Д.А., Брукмейер Р. Оценка распределения инкубационного периода с помощью грубых данных. Stat Med. 2009. 28: 2769–2784. DOI: 10.1002 / sim.3659. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Sartwell PE. Распределение инкубационных периодов инфекционного заболевания. Am J Hyg. 1950; 51: 310–318. [PubMed] [Google Scholar]
coarseDataTools: набор функций, помогающих анализировать грубо наблюдаемые данные.http://cran.r-project.org/web/packages/coarseDataTools.
Курц Дж. Б., Ли Т. В., Крейг Дж. В., Рид С. Е.. Астровирусная инфекция у добровольцев. J Med Virol. 1979; 3: 221–230. DOI: 10.1002 / jmv.18308. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Midthun K, Greenberg HB, Kurtz JB, Gary GW, Lin FY, Kapikian AZ. Характеристика и сероэпидемиология астровируса типа 5, связанного со вспышкой гастроэнтерита в округе Марин, Калифорния. J Clin Microbiol. 1993; 31: 955–962. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Митчелл Д.К., Ван Р., Морроу А.Л., Монро С.С., Гласс Р.И., Пикеринг Л.К.Вспышки астровирусного гастроэнтерита в детских садах. J Pediatr. 1993; 123: 725–732. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (05) 80846-7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Baron RC, Murphy FD, Greenberg HB, Davis CE, Bregman DJ, Gary GW, Hughes JM, Schonberger LB. Желудочно-кишечное заболевание Norwalk: вспышка, связанная с купанием в озере для отдыха, и вторичная передача от человека к человеку. Am J Epidemiol. 1982; 115: 163–172. [PubMed] [Google Scholar]
Becker KM, Moe CL, Southwick KL, MacCormack JN.Передача вируса Norwalk во время футбольного матча. N Engl J Med. 2000; 343: 1223–1227. DOI: 10.1056 / NEJM200010263431704. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Dolin R, Blacklow NR, DuPont H, Formal S, Buscho RF, Kasel JA, Chames RP, Hornick R, Chanock RM. Передача острого инфекционного небактериального гастроэнтерита добровольцам при пероральном приеме фильтрата стула. J Infect Dis. 1971; 123: 307–312. DOI: 10.1093 / infdis / 123.3.307. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Gill ON, Cubitt WD, McSwiggan DA, Watney BM, Bartlett CL.Эпидемия гастроэнтерита, вызванная устрицами, зараженными небольшими вирусами с круглой структурой. Br Med J (Clin Res Ed) 1983; 287: 1532–1534. DOI: 10.1136 / bmj.287.6404.1532. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Hicks NJ, Beynon JH, Bingham P, Soltanpoor N, Green J. Вспышка вирусного гастроэнтерита после свадебного приема. Commun Dis Rep CDR Rev.1996; 6: R136 – R139. [PubMed] [Google Scholar]
Hoebe CJ, Vennema H, de Roda Husman AM, van Duynhoven YT.Вспышка норовируса среди младших школьников, игравших в фонтанчике с водой для отдыха. J Infect Dis. 2004. 189: 699–705. DOI: 10,1086 / 381534. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Курицкий Дж. Н., Остерхольм М. Т., Гринберг Х. Б., Корлат Дж. А., Годес Дж. Р., Хедберг К. В., Форфанг Дж. К., Капикян А.З., Маккалоу Дж. К., Уайт К.Э. Норуолкский гастроэнтерит: вспышка болезни в сообществе, связанная с потреблением хлебобулочных изделий. Ann Intern Med. 1984; 100: 519–521. DOI: 10.7326 / 0003-4819-100-4-519. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Linco SJ, Grohmann GS.Дарвиновская вспышка вирусного гастроэнтерита, связанного с устрицами. Med J Aust. 1980; 1: 211–213. [PubMed] [Google Scholar]
Matshuhashi N, Nishi Y, Nagoshi D., Kanemoto H. A N: Эпидемический энтерколит, возможно, в результате заражения вирусом Норуолк, проявляющегося как ишемический колит . Dig Endosc. 2003. 15: 138–141. DOI: 10.1046 / j.1443-1661.2003.00234.x. [CrossRef] [Google Scholar]
Чендлер Б., Беллер М., Дженкерсон С., Миддо Дж., Робертс С., Рейсдорф Е., Рауш М., Сэвидж Р., Дэвис Дж. Вспышки вирусного гастроэнтерита, похожего на Норуолк — Аляска и Висконсин, 1999.MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2000; 49: 207–211. [PubMed] [Google Scholar]
Тейлор Дж. У., Гэри Г. У. мл., Гринберг HB. Связанный с Норуолком вирусный гастроэнтерит из-за загрязненной питьевой воды. Am J Epidemiol. 1981; 114: 584–592. [PubMed] [Google Scholar]
de Wit MA, Widdowson MA, Vennema H, de Bruin E, Fernandes T, Koopmans M. Крупная вспышка норовируса: пекарь, который должен был знать лучше. J Infect. 2007; 55: 188–193. DOI: 10.1016 / j.jinf.2007.04.005. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Dolin R, Reichman RC, Roessner KD, Tralka TS, Schooley RT, Gary W, Morens D.Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии возбудителя острого вирусного гастроэнтерита Снежной горы. J Infect Dis. 1982; 146: 184–189. DOI: 10.1093 / infdis / 146.2.184. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Гаулин С., Фригон М., Пуарье Д., Фурнье С. Передача калицивируса работником еды в предсимптоматической фазе болезни. Epidemiol Infect. 1999; 123: 475–478. DOI: 10.1017 / S095026889^{9X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]}
Gotz H, de Jong B, Lindback J, Parment PA, Hedlund KO, Torven M, Ekdahl K.Эпидемиологическое расследование вспышки пищевого гастроэнтерита, вызванного Норуолк-подобным вирусом, в 30 детских садах. Scand J Infect Dis. 2002; 34: 115–121. DOI: 10.1080 / 00365540110080133. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Хираката Ю., Арисава К., Нишио О., Накагоми О. Распространение вспышек гастроэнтерита в нескольких префектурах, вызванных одним штаммом норовируса геногруппы II из туристического ресторана в Нагасаки, Япония. J Clin Microbiol. 2005; 43: 1093–1098. DOI: 10.1128 / JCM.43.3.1093-1098.2005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Исакбаева Е.Т., Буленс С.Н., Борода Р.С., Адамс С., Монро С.С., Чавес С.С., Виддоусон М.А., Гласс Р.И. Норовирус и уход за детьми: проблемы в борьбе со вспышками. Pediatr Infect Dis J. 2005; 24: 561–563. DOI: 10.1097 / 01.inf.0000164764.58715.23. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Киркинг Х.Л., Кортес Дж., Беррер С., Холл А.Дж., Коэн Нью-Джерси, Липман Х., Ким С., Дейли Э.Р., Фишбейн Д.Б. Вероятная передача норовируса в самолете, октябрь 2008 г.Clin Infect Dis. 2010; 50: 1216–1221. DOI: 10,1086 / 651597. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Маркс П.Дж., Випонд И.Б., Карлайл Д., Дикин Д., Фей Р.Э., Кол Е.О. Доказательства воздушно-капельной передачи Норуолк-подобного вируса (NLV) в ресторане отеля. Epidemiol Infect. 2000; 124: 481–487. DOI: 10.1017 / S095026889
05. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Marshall JA, Yuen LK, Catton MG, Gunesekere IC, Wright PJ, Bettelheim KA, Griffith JM, Lightfoot D, Hogg GG, Gregory J.и др. Множественные вспышки норволкского вирусного гастроэнтерита, связанные с рестораном в средиземноморском стиле. J Med Microbiol. 2001; 50: 143–151. [PubMed] [Google Scholar]
Торнхилл Т.С., Вятт Р.Г., Калица А.Р., Долин Р., Чанок Р.М., Капикян А.З. Обнаружение с помощью иммунной электронной микроскопии вирусоподобных частиц размером 26–27 нм, связанных с двумя семейными вспышками гастроэнтерита. J Infect Dis. 1977; 135: 20–27. DOI: 10.1093 / infdis / 135.1.20. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Трумэн Б.И., Мадоре Х.П., Менегус М.А., Ницкин Д.Л., Долин Р.Снежная гора возбудитель гастроэнтерита от моллюсков. Am J Epidemiol. 1987; 126: 516–525. [PubMed] [Google Scholar]
Хамфри Т.Дж., Крукшанк Дж. Г., Кубитт В. Д.. Вспышка гастроэнтерита, ассоциированного с калицивирусами, в доме престарелых. Возможный зооноз? Дж. Хиг (Лондон) 1984; 93: 293–299. DOI: 10.1017 / S0022172400064822. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Johansson PJ, Bergentoft K, Larsson PA, Magnusson G, Widell A, Thorhagen M, Hedlund KO. Вспышка гастроэнтерита у взрослых, связанная с внутрибольничными саповирусами.Scand J Infect Dis. 2005. 37: 200–204. DOI: 10.1080 / 00365540410020974. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Усуку С., Кумазаки М., Китамура К., Точикубо О., Ногучи Ю. Вспышка пищевого гастроэнтерита, вызванного саповирусом, среди учеников младших классов средней школы. Jpn J Infect Dis. 2008. 61: 438–441. [PubMed] [Google Scholar]
Yamashita Y, Ootsuka Y, Kondo R, Oseto M, Doi M, Miyamoto T., Ueda T., Kondo H, Tanaka T, Wakita T. и др. Молекулярная характеристика саповируса, обнаруженного при гастроэнтерите вспышка в свадебном зале.J Med Virol. 2010. 82: 720–726. DOI: 10.1002 / jmv.21646. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Капикян А.З., Вятт Р.Г., Левин М.М., Блэк Р.Э., Гринберг Г.Б., Флорес Дж., Калица А.Р., Хошино Ю., Чанок Р.М. Исследования на добровольцах с ротавирусами человека. Dev Biol Stand. 1983; 53: 209–218. [PubMed] [Google Scholar]
Morris CA, Flewett TH, Bryden AS, Davies H. Эпидемический вирусный энтерит в детской палате длительного пребывания. Ланцет. 1975; 1: 4–5. [PubMed] [Google Scholar]
Родригес В.Дж., Ким Х.В., Брандт С.Д., Йолкен Р.Х., Ричард М., Арробио Д.О., Шварц Р.Х., Капикян А.З., Чанок Р.М., Парротт Р.Х.Распространенная вспышка гастроэнтерита, вызванного ротавирусом 2 типа, с высокой частотой вторичных атак в семьях. J Infect Dis. 1979; 140: 353–357. DOI: 10.1093 / infdis / 140.3.353. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Митчелл Д.К., Матсон Д.О., Кубитт В.Д., Джексон Л.Дж., Уиллкокс М.М., Пикеринг Л.К., Картер М.Дж. Распространенность антител к астровирусу 1 и 3 типов у детей и подростков в Норфолке, Вирджиния. Pediatr Infect Dis J. 1999; 18: 249–254. DOI: 10.1097 / 00006454-1990-00008. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Оливер С.Л., Асобайре Э., Дастджерди А.М., Бриджер Дж.Геномная характеристика неклассифицированного кишечного вируса крупного рогатого скота Newbury agent-1 (Newbury1) подтверждает новый род в семействе Caliciviridae. Вирусология. 2006; 350: 240–250. DOI: 10.1016 / j.virol.2006.02.027. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Сципиони А., Маурой А., Винье Дж., Тири Э. Норовирусы животных. Вет Дж. 2008; 178: 32–45. DOI: 10.1016 / j.tvjl.2007.11.012. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Норовирус. http://www.cdc.gov/norovirus/hcp/clinical-overview.html.
Китадзима М., Ока Т., Харамото Е., Фануван С., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Генетическое разнообразие норовирусов геногруппы IV в сточных водах в Японии. Lett Appl Microbiol. 2011; 52: 181–184. DOI: 10.1111 / j.1472-765X.2010.02980.x. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Китадзима М., Ока Т., Харамото Э., Такеда Н., Катаяма К., Катаяма Х. Сезонное распределение и генетическое разнообразие норовирусов геногрупп I, II и IV в реке Тамагава, Япония . Environ Sci Technol. 2010; 44: 7116–7122.DOI: 10.1021 / es100346a. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Кол Е.О., Эпплтон Х. Электронно-микроскопические и физические характеристики небольших круглых фекальных вирусов человека: временная схема классификации. J Med Virol. 1982; 9: 257–265. DOI: 10.1002 / jmv.18403. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Каплан Дж. Э., Гэри Г. У., Барон Р. К., Сингх Н., Шонбергер Л. Б., Фельдман Р., Гринберг HB. Эпидемиология норволкского гастроэнтерита и роль вируса Норуолк в вспышках острого небактериального гастроэнтерита.Ann Intern Med. 1982; 96: 756–761. DOI: 10.7326 / 0003-4819-96-6-756. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Чиба С., Наката С., Нумата-Киношита К., Хонма С. Вирус Саппоро: история и недавние открытия. J Infect Dis. 2000; 181 (Дополнение 2): S303 – S308. [PubMed] [Google Scholar]
Dey SK, Phan TG, Nguyen TA, Nishio O, Salim AF, Yagyu F, Okitsu S, Ushijima H. Распространенность саповирусной инфекции среди младенцев и детей с острым гастроэнтеритом в городе Дакка, Бангладеш во время 2004–2005 гг.J Med Virol. 2007. 79: 633–638. DOI: 10.1002 / jmv.20859. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Blacklow NR, Greenberg HB. Вирусный гастроэнтерит. N Engl J Med. 1991; 325: 252–264. DOI: 10.1056 / NEJM1953250406. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Ноэль Дж.С., Лю Б.Л., Хамфри С.Д., Родригес Е.М., Лэмбден П.Р., Кларк И.Н., Дуайер Д.М., Андо Т., Гласс Р.И., Монро С.С. Вирус Парквилля: новый генетический вариант калицивируса человека в кладе вируса Саппоро, связанный со вспышкой гастроэнтерита у взрослых.J Med Virol. 1997. 52: 173–178. DOI: 10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199706) 52: 2 <173 :: AID-JMV10> 3.0.CO; 2-M. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Епископ РФ, Дэвидсон Г.П., Холмс И.Х., Рак Б.Дж. Вирусные частицы в эпителиальных клетках слизистой оболочки двенадцатиперстной кишки у детей с острым небактериальным гастроэнтеритом. Ланцет. 1973; 2: 1281–1283. [PubMed] [Google Scholar]
Парашар Ю.Д., Гибсон С.Дж., Бресс Дж.С., Гласс Р.И. Ротавирус и тяжелая диарея у детей. Emerg Infect Dis. 2006. 12: 304–306. DOI: 10.3201 / eid1202.050006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Mackow E. In: Инфекции желудочно-кишечного тракта. Блазер М., Смит П., Равдин Дж., Гринберг Х., Геррант Р.Л., редактор. Нью-Йорк: Raven Press; 1995. Ротавирусы группы B и C; С. 983–1008. [Google Scholar]
Сантос Н., Хосино Ю. Глобальное распространение серотипов / генотипов ротавируса и его значение для разработки и внедрения эффективной ротавирусной вакцины. Rev Med Virol. 2005; 15: 29–56.DOI: 10.1002 / RMV.448. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Родригес В.Дж., Ким Х.В., Арробио Дж.О., Брандт С.Д., Чанок Р.М., Капикян А.З., Вятт Р.Г., Парротт Р.Х. Клинические особенности острого гастроэнтерита, связанного с реовирусоподобным агентом человека, у младенцев и детей раннего возраста. J Pediatr. 1977; 91: 188–193. DOI: 10.1016 / S0022-3476 (77) 80810-X. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Брандт С.Д., Ким Х.В., Родригес В.Дж., Арробио Д.О., Джеффрис Б.К., Столлингс Е.П., Льюис С., Майлз А.Дж., Чанок Р.М., Капикян А.З., Пэрротт Р.Х.Детский вирусный гастроэнтерит за восемь лет исследования. J Clin Microbiol. 1983; 18: 71–78. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
Эдмонсон Л.М., Эбберт Дж. О., Эванс Дж. М.. Сообщение о вспышке ротавируса среди взрослого населения дома престарелых. J Am Med Dir Assoc. 2000; 1: 175–179. [PubMed] [Google Scholar]
Hrdy DB. Эпидемиология ротавирусной инфекции у взрослых. Rev Infect Dis. 1987; 9: 461–469. DOI: 10.1093 / Clinids / 9.3.461. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Гриффин М.Р., Суровец Дж. Дж., Макклоски Д.И., Капуано Б., Пьерзински Б., Куинн М., Войнарски Р., Паркин В.Е., Гринберг Н., Гэри Г.В.Норуолкский вирус пищевого происхождения. Am J Epidemiol. 1982; 115: 178–184. [PubMed] [Google Scholar]
Ганн Р.А., Яновски Х.Т., Либ С., Пратер Е.С., Гринберг Х.Б. Гастроэнтерит, вызванный вирусом Norwalk, возникший после употребления в пищу сырых устриц. Am J Epidemiol. 1982; 115: 348–351. [PubMed] [Google Scholar]
Malek M, Barzilay E, Kramer A, Camp B, Jaykus LA, Escudero-Abarca B, Derrick G, White P, Gerba C, Higgins C. и др. Вспышка норовирусной инфекции среди рек стропила, связанные с упакованным мясом деликатесов, Гранд-Каньон, 2005 г.Clin Infect Dis. 2009. 48: 31–37. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Саид MA, Perl TM, Sears CL. Эпидемиология здравоохранения: желудочно-кишечный грипп: норовирус в учреждениях здравоохранения и длительного ухода. Clin Infect Dis. 2008. 47: 1202–1208. DOI: 10,1086 / 5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
O’Ryan M, Linhares AC. Последние новости о Rotarix: пероральная вакцина против ротавируса человека. Экспертные ревакцины. 2009. 8: 1627–1641. DOI: 10.1586 / erv.09.136. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]
Желудочный грипп: как долго я заразен?
Как долго я буду заразным, если у меня желудочный грипп?
Вы можете заразиться от нескольких дней до двух недель и более, в зависимости от того, какой вирус вызывает у вас желудочный грипп (гастроэнтерит).
Гастроэнтерит может вызывать ряд вирусов, включая норовирусы и ротавирусы. Период заразности — время, в течение которого больной может передать болезнь другим, — немного отличается для каждого вируса.
Норовирус. Норовирус — самая частая причина вирусного гастроэнтерита у взрослых — вы заразны, когда начинаете чувствовать себя плохо. Симптомы обычно появляются в течение одного-двух дней после заражения.
Хотя обычно вы чувствуете себя лучше через день или два, вы заразны в течение нескольких дней после выздоровления.После выздоровления вирус может оставаться в стуле до двух и более недель.
Дети должны оставаться дома и не ходить в школу или детские учреждения в течение как минимум 48 часов после последней рвоты или диареи.
Ротавирус. Симптомы ротавируса — основной причины вирусного гастроэнтерита у младенцев и детей младшего возраста — обычно проявляются через один-три дня после контакта. Но вы заразны еще до появления симптомов и до двух недель после выздоровления.
Вирусы, вызывающие гастроэнтерит, передаются при тесном контакте с инфицированными людьми, например при совместном использовании пищи или посуды, а также при прикосновении к зараженным поверхностям и предметам. Употребление зараженной пищи также может вызвать норовирус.
Часто мытье рук водой с мылом — самый эффективный способ остановить распространение этих вирусов среди других. Если вы не можете мыть руки, используйте дезинфицирующее средство для рук на спиртовой основе, которое может уменьшить количество микробов.
Чтобы защитить других от болезней, дезинфицируйте загрязненные поверхности сразу после рвоты или диареи.Наденьте одноразовые перчатки и используйте бытовое моющее средство на основе отбеливателя или 2 чашки (0,5 литра) отбеливателя на галлон (3,8 литра) воды. Норовирус может выживать месяцами на поверхностях, недостаточно продезинфицированных с помощью отбеливающего раствора.
Также используйте одноразовые перчатки, чтобы немедленно постирать одежду или постельное белье, которые могут быть загрязнены.
Для младенцев доступны две пероральные ротавирусные вакцины — RotaTeq и Rotarix. Вакцины против норовируса проходят клинические испытания.
с
Притиш К.Тош, доктор медицины
Прививка от гриппа: предотвратит ли желудочный грипп?
04 марта 2020 Показать ссылки
Норовирус. Центры по контролю и профилактике заболеваний. http://www.cdc.gov/norovirus/about/index.html. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
Matson DO. Острый вирусный гастроэнтерит у детей в богатых ресурсами странах: лечение и профилактика. https://uptodate.com/contents/search. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
Предотвратить распространение норовируса.Центры по контролю и профилактике заболеваний. https://www.cdc.gov/features/norovirus/index.html. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
Вирусный гастроэнтерит. Национальный институт диабета, болезней органов пищеварения и почек. https://www.niddk.nih.gov/health-information/digestive-diseases/viral-gastroenteritis. По состоянию на 4 февраля 2018 г.
Посмотреть больше ответов экспертов
.
% PDF-1.6 % 776 0 объект > эндобдж xref 776 78 0000000016 00000 н. 0000002185 00000 н. 0000002359 00000 н. 0000002548 00000 н. 0000002987 00000 н. 0000003110 00000 н. 0000003268 00000 н. 0000003426 00000 н. 0000003584 00000 н. 0000003742 00000 н. 0000003900 00000 н. 0000004059 00000 н. 0000004218 00000 н. 0000004377 00000 н. 0000004536 00000 н. 0000004694 00000 н. 0000004852 00000 н. 0000005010 00000 н. 0000005168 00000 п. 0000005901 00000 п. 0000006605 00000 н. 0000006766 00000 н. 0000007210 00000 н. 0000007343 00000 п. 0000007481 00000 н. 0000007625 00000 н. 0000007765 00000 н. 0000007802 00000 н. 0000009471 00000 п. 0000010770 00000 п. 0000011214 00000 п. 0000012724 00000 п. 0000014037 00000 п. 0000015474 00000 п. 0000016896 00000 п. 0000018209 00000 п. 0000019719 00000 п. 0000019858 00000 п. 0000019946 00000 п. 0000020034 00000 п. 0000020118 00000 п. 0000020206 00000 п. 0000020292 00000 п. 0000020376 00000 п. 0000020463 00000 п. 0000020553 00000 п. 0000020647 00000 п. 0000020737 00000 п. 0000020879 00000 п. 0000020967 00000 п. 0000023661 00000 п. 0000052641 00000 п. 0000052891 00000 п. 0000078350 00000 п. 0000078606 00000 п. 0000078850 00000 п. 0000102824 00000 н. 0000103092 00000 н. 0000126243 00000 н. 0000126507 00000 н. 0000140455 00000 н. 0000140704 00000 п. 0000140940 00000 н. 0000141269 00000 н. 0000153864 00000 н. 0000154119 00000 н. 0000154337 00000 н. 0000154635 00000 н. 0000168185 00000 н. 0000168453 00000 н. 0000168669 00000 н. 0000168957 00000 н. 0000181832 00000 н. 0000182096 00000 н. 0000182316 00000 н. 0000182616 00000 н. 0000182661 00000 н. 0000001856 00000 н. трейлер ] >> startxref 0 %% EOF 853 0 объект > поток xb«f« t` * `b HB` $ lL ‘+ 94T2 | a ||} Z @ A! AA @ `= L, l $ N0` @ A + sT ŷ ݌ a [S ܐ˰ | NgCav &> F020b«fa`
Норовирус — Глава 4-2020 Желтая книга | Здоровье путешественников
Кристина В.Кардемиль, Арон Дж. Холл
ИНФЕКЦИОННЫЙ АГЕНТ
Норовирусная инфекция вызывается безоболочечными одноцепочечными РНК-вирусами из рода Norovirus, которые также называются «норволк-подобными вирусами», норволк-вирусами и небольшими вирусами с круглой структурой. Норовирус является причиной вирусного гастроэнтерита, иногда называемого «желудочным гриппом»; однако биологической связи с вирусами гриппа или гриппа нет.
ТРАНСМИССИЯ
Передача происходит главным образом фекально-оральным путем, либо при прямом контакте от человека к человеку, либо косвенно через зараженную пищу или воду.Норовирус также распространяется через рвотные аэрозоли и загрязненные поверхности и предметы окружающей среды.
ЭПИДЕМИОЛОГИЯ
Норовирусные инфекции распространены во всем мире, и во всем мире большинство детей переживут ≥1 инфекцию в возрасте 5 лет. Инфекции, вызванные норовирусом, могут возникать круглый год, но в умеренном климате пик активности норовируса приходится на зиму. Норовирусы распространены как в развивающихся, так и в развитых странах. По оценкам, во всем мире норовирус является причиной 18% случаев острого гастроэнтерита и может быть причиной примерно 200 000 смертей ежегодно.В Соединенных Штатах норовирус является основной причиной гастроэнтерита у детей раннего возраста и вспышек гастроэнтерита; по оценкам, он вызывает 19–21 миллион заболеваний в год и примерно 50% всех вспышек болезней пищевого происхождения.
Вспышки норовируса часто происходят в местах, где люди живут в тесноте и могут легко заразить друг друга. Хотя большинство вспышек норовируса происходит в медицинских учреждениях, школах и учреждениях общественного питания, вспышки также происходят на круизных лайнерах, а также в отелях, лагерях и общежитиях.Норовирус — хорошо известная причина диареи путешественников; Известно, что распространенность в одних условиях выше, чем в других. Поскольку коинфекция и бессимптомная инфекция норовирусом являются обычным явлением, необходимы дополнительные контролируемые исследования, чтобы точно определить, насколько часто норовирус является причиной заболевания.
Риск заражения присутствует везде, где пища приготовлена антисанитарным образом и может быть заражена, или там, где питьевая вода не обрабатывается надлежащим образом. Особый риск представляют «готовые к употреблению» холодные продукты, такие как бутерброды и салаты.Сырые моллюски, особенно устрицы, также являются частым источником инфекции, поскольку вирус из загрязненной воды концентрируется в кишечнике этих фильтрующих устройств. Загрязненный лед также был причастен к вспышкам.
Вирусное заражение неодушевленных предметов или поверхностей окружающей среды (фомитов) может сохраняться во время и после вспышек и быть источником инфекции. Например, на круизных лайнерах загрязнение окружающей среды вызывало повторяющиеся вспышки норовируса в последовательных круизах с пассажирами, только что совершившими посадку.Сообщалось о передаче норовируса в самолетах как во время внутренних, так и международных рейсов и, вероятно, в результате заражения туалетов или пассажиров с симптомами в салоне.
КЛИНИЧЕСКАЯ ПРЕЗЕНТАЦИЯ
У инфицированных людей обычно начинается острая рвота с диареей без крови. Инкубационный период 12–48 часов. Другие симптомы включают спазмы в животе, тошноту и иногда субфебрильную температуру. Болезнь обычно купируется самостоятельно, и у большинства пациентов можно ожидать полного выздоровления через 1-3 дня.В некоторых случаях обезвоживание, особенно у очень молодых или пожилых пациентов, может потребовать медицинской помощи.
ДИАГНОСТИКА
Норовирусная инфекция обычно диагностируется на основании симптомов. Диагностическое тестирование норовируса не является широко распространенным для руководства клиническим ведением отдельных пациентов, но лабораторное тестирование используется во время расследования вспышек заболевания органами общественного здравоохранения.
Диагностические панели для множественных патогенов на основе ПЦР становятся все более доступными для клинических и исследовательских целей; Эти панели обладают хорошей чувствительностью и специфичностью для обнаружения норовируса.Наиболее распространенным диагностическим тестом, используемым в государственных лабораториях общественного здравоохранения и CDC, является ОТ-ПЦР, которая быстро и надежно обнаруживает вирус в образцах стула. Также доступно несколько коммерческих иммуноферментных анализов (ИФА) для обнаружения вируса в образцах стула. Специфичность и чувствительность ИФА относительно низки по сравнению с ОТ-ПЦР. Для получения дополнительной информации о лабораторных диагностических исследованиях и сборе образцов см. Www.cdc.gov/norovirus/lab-testing/index.html.
ЛЕЧЕНИЕ
Поддерживающая терапия — это основа лечения норовирусной болезни, особенно пероральной или внутривенной регидратации.Для рутинного лечения острого гастроэнтерита у детей не рекомендуются противодиарейные и противорвотные средства, поскольку отсутствуют высококачественные доказательства их эффективности и их потенциальной токсичности. Для взрослых полезными дополнениями к регидратации могут быть препараты, снижающие моторику, антисекреторные и противорвотные средства. Антибиотики бесполезны при лечении пациентов с норовирусным заболеванием.
ПРОФИЛАКТИКА
В настоящее время вакцины нет, хотя усилия по разработке вакцины продвигаются. Норовирусы распространены и очень заразны, но риск заражения можно свести к минимуму путем частого и правильного мытья рук и избегания возможно зараженной пищи и воды.Мытье рук водой с мылом в течение не менее 20 секунд считается наиболее эффективным способом уменьшить заражение норовирусом; Дезинфицирующие средства для рук на спиртовой основе могут быть полезны между мытьями рук, но их не следует рассматривать как замену мыла и воды.
Помимо мытья рук, меры по предотвращению передачи норовирусов между людьми, путешествующими вместе, включают тщательную очистку фекалий или рвотных масс и дезинфекцию загрязненных поверхностей и туалетов. Продукция должна быть одобрена Агентством по охране окружающей среды для дезинфекции норовирусом; в качестве альтернативы можно использовать разбавленный раствор отбеливателя (5–25 столовых ложек отбеливателя на галлон воды).Загрязненные предметы одежды следует стирать при максимально доступной продолжительности цикла и сушить в машине при сильном нагреве.
Чтобы предотвратить распространение норовирусов, можно рассмотреть возможность изоляции больных людей на круизных лайнерах и в учреждениях, включая больницы, учреждения длительного ухода и школы.
Веб-сайт CDC: www.cdc.gov/norovirus
БИБЛИОГРАФИЯ
Ахмед С.М., Холл А.Дж., Робинсон А.Е. и др. Глобальная распространенность норовируса в случаях гастроэнтерита: систематический обзор и метаанализ.Lancet Infect Dis. 2014. 14 (8): 725–30.
Ajami NJ, Kavanagh OV, Ramani S, Crawford SE, Atmar RL, Jiang ZD и др. Сероэпидемиология диареи путешественников, связанной с норовирусом. J Travel Med. 2014, январь – февраль; 21 (1): 6–11.
Алиабади Н., Лопман Б.А., Парашар Ю.Д., зал AJ. Прогресс в отношении вакцин против норовируса: соображения для дальнейшей разработки и внедрения в потенциальных целевых группах населения. Экспертные ревакцины. 2015; 14 (9): 1241–53.
Cardemil CV, Parashar UD, Hall AJ.Норовирусная инфекция у пожилых людей: эпидемиология, факторы риска и возможности профилактики и контроля. Заражение Dis Clin North Am. 2017 декабрь; 31 (4): 839–70.
Hall AJ, Lopman BA, Payne DC, Patel MM, Gastañaduy PA, Vinje J, et al. Норовирусное заболевание в США. Emerg Infect Dis. 2013 август; 19 (8): 1198–205.
Hall AJ, Wikswo ME, Pringle K, Gould LH, Parashar UD. Жизненно важные признаки: вспышки пищевого норовируса — США, 2009–2012 гг. MMWR Morb Mortal Wkly Rep.2014 6 июня; 63 (22): 491–5.
Кирк М.Д., Пирес С.М., Блэк Р.Э. и др. Оценки Всемирной организации здравоохранения глобального и регионального бремени болезней, вызванных 22 бактериальными, протозойными и вирусными болезнями пищевого происхождения, 2010 г .: синтез данных. PLoS Med. 2015; 12 (12): e1001921.
Simons MP, Pike BL, Hulseberg CE, Prouty MG, Swierczewski BE. Норовирус: новые события и последствия для диареи путешественников. Вакцины Trop Dis Travel Med. 2016 12 января; 2: 1.
Инфекции тонкого кишечника | MUSC Health
Основная функция тонкой кишки — переваривание, всасывание и продвижение пищи по всей ее длине.Большинство клинически важных инфекций тонкого кишечника нарушают эти функции. Часто бывает понос; другие симптомы включают кровотечение, вздутие живота, тошноту, рвоту, боль в животе и даже признаки полной абдоминальной непроходимости. Некоторые инфекции имеют характерные особенности.
Инфекция, вызванная сальмонеллой
Микрофотография с помощью сканирующего электронного микроскопа с усилением цвета, показывающая, что Salmonella Typhimurium (красный) вторгается в культивируемые клетки человека
Сальмонелла существует во многих формах. Так называемые нетифоидные виды Salmonella являются наиболее частой причиной вспышек пищевых отравлений в Соединенных Штатах.Эти организмы чрезвычайно распространены в мясных продуктах, но также были прослежены до домашних черепах и игуан. Цыплята и яйца, вероятно, являются наиболее частой причиной заражения.
У пациентов развиваются симптомы через 10-48 часов после употребления зараженной пищи. У них может быть широкий спектр симптомов, от легкого гастроэнтерита до тяжелого диарейного заболевания с обезвоживанием и серьезной инфекцией. Пациенты со злокачественными новообразованиями, серповидноклеточной анемией, аневризмами аорты и пороками сердечного клапана, по-видимому, более предрасположены к заражению диссеминированным типом инфекции (т.е. перекинуться в кровь).
Пациенты могут поправиться без применения антибиотиков. Очень больным пациентам рекомендуются антибиотики. У небольшого процента людей может развиться хроническое носительство; они протекают бессимптомно, но выделяют сальмонеллы со стулом в течение года или дольше.
Брюшной тиф — распространенное во всем мире бактериальное заболевание, передающееся при приеме пищи или воды, загрязненных фекалиями инфицированного человека.
Брюшной тиф — Инфекция, вызванная определенным видом Salmonella (обычно Salmonella typhi), брюшной тиф характеризуется продолжительной лихорадкой, наличием бактерий в крови и полиорганной недостаточностью, включая воспаление почек и головного мозга.Брюшной тиф в Соединенных Штатах становится редкостью. Иммунизация полезна. Для лечения требуются мощные антибиотики и специальные методы лечения поражений других органов.
Staphylococcus Aureus — Золотистый стафилококк, вероятно, является второй по частоте причиной бактериального пищевого отравления в Соединенных Штатах. Бактерии размножаются в пище и производят токсин. Токсин, вырабатываемый пищей, не инактивируется при нагревании. Симптомы развиваются в течение шести-восьми часов и среди них преобладают рвота и спазмы в животе.Обычно пациенты полностью выздоравливают в течение 24-48 часов.
Bacillus Cereus — Bacillus cereus — это организм, вырабатывающий кишечный токсин. Эта инфекция связана с употреблением жареного риса. Рвота обычно возникает в течение шести часов после приема пищи. У некоторых пациентов может развиться диарея, но у большинства состояние улучшается самопроизвольно без специального лечения.
Другие инфекции — Есть много других бактериальных инфекций, которые могут вызывать острые симптомы.К ним относятся различные E-coli, Clostridium, Campylobacter, Yersinia и Vibrio (холера). Существуют также вирусные инфекции кишечника, которые могут вызывать острые диарейные заболевания, которые обычно проходят спонтанно. Обезвоживание — самая большая проблема.
Протозойные инфекции
Вид простейших в клетке костного мозга.
Giardia Lamblia — Giardia lamblia — распространенный паразитарный патоген, который может загрязнять источники воды и часто встречается у путешественников в слаборазвитые страны.Дети в детских садах (и работающие в них взрослые) чаще заболевают лямблиозом.
Симптомы различаются, но могут включать расстройство кишечника, газы, вздутие живота и признаки мальабсорбции. У пациентов может быть значительная потеря веса и стеаторея. Диагноз можно поставить, выполнив специальный анализ стула или исследуя образец биопсии двенадцатиперстной кишки, полученный во время эндоскопии верхних отделов.
Лямблии обычно легко поддаются лечению коротким курсом антибиотиков.Инфекции могут повторяться, и кишечник может оставаться «раздражительным» в течение нескольких недель или месяцев после того, как инфекция будет ликвидирована.
Кишечные черви
Хотя верно то, что многие кишечные глисты можно найти в Соединенных Штатах, на самом деле они представляют собой глобальную проблему, причем большинство случаев происходит за пределами США.
Анкилостомы — Анкилостомы прикрепляются к слизистой оболочке тонкой кишки. Они являются наиболее частой причиной железодефицитной анемии во всем мире, а также могут вызывать боль в животе и диарею.Иногда из кишечника может происходить серьезная потеря белка. Диагноз ставится при исследовании кала. Лекарство эффективное
Ленточный червь — Существует множество типов ленточных червей, которые встречаются в различных мясных продуктах, таких как свинина, говядина или рыба. Заражение происходит при проглатывании плохо приготовленного мяса. Считается, что наиболее распространенный тип ленточных червей в Соединенных Штатах передается через контакт с человеческими фекалиями.
Ленточные черви могут вызывать непроходимость кишечника, но обычно вызывают мало симптомов, кроме неспецифических болей в животе и периодической диареи.Рыбный цепень может вызвать дефицит витамина B12. Диагноз ставится на основании исследования кала, и доступны эффективные лекарства.
Булавочный червь — Довольно часто наблюдается у маленьких детей, наиболее частым симптомом булавочного червя является зуд в анальной области, хотя у многих инфицированных людей симптомы отсутствуют. Диагноз ставится путем обнаружения яиц или настоящих глистов вокруг перианальной области путем наложения прозрачной липкой ленты на анальную область рано утром. Затем липкую ленту исследуют под предметным стеклом микроскопа.
Несмотря на то, что специализированная терапия доступна и эффективна, для предотвращения повторного заражения все же может потребоваться проведение тестирования и лечения других членов домохозяйства.
Strongyloides Stercoralis — Strongyloides Stercoralis наиболее распространен в Африке, Азии и Латинской Америке, но также встречается в южной части Соединенных Штатов. Этот червь проникает в организм, проникая через кожу и мигрируя по венозной системе в легкие, и, наконец, достигает тонкой кишки.
У пациентов могут развиться симптомы поражения легких, такие как кашель, одышка и хрипы. Хроническая инфекция может вызывать периодические боли в животе, рвоту, нарушение всасывания и потерю веса.
У пациентов с трансплантацией органов или основных злокачественных новообразований, таких как лейкемия, лимфома, или у тех, кто принимает кортикостероиды, может развиться опасная для жизни инфекция, проявляющаяся тяжелыми желудочно-кишечными и легочными симптомами. Диагноз ставится при тщательном исследовании стула и назначении определенных лекарств.
Эхинококкоз — Червь эхинококка обнаружен в кишечнике собак и овец. Люди заражаются кистозной формой. Эта инфекция обнаруживается в местах, где собаки, овцы и люди живут в непосредственной близости, особенно в условиях плохой гигиены. Люди заражаются, когда глотают яйца с продуктами питания, загрязненными фекалиями, такими как овощи, дикие фрукты и вода.
No related posts.